TEMAT

CEL PRACY

TEMAT

CEL PRACY

TEMAT

CEL PRACY

TEMAT

CEL PRACY

TEMAT

CEL PRACY

TEMAT

CEL PRACY

TEMAT

CEL PRACY

TEMAT

CEL PRACY

TEMAT

CEL PRACY

TEMAT

CEL PRACY

TEMAT

CEL PRACY

TEMAT

CEL PRACY

TEMAT

CEL PRACY

TEMAT

CEL PRACY

TEMAT

CEL PRACY

TEMAT

CEL PRACY

TEMAT
Wpływ opieki rodzicielskiej na rozwój psychofizyczny potomstwa u naczelnych.

CEL PRACY
U naczelnych interakcje na wczesnym etapie życia z matką wpływają na zachowanie w późniejszym życiu. Jednak nadal nie wiemy zbyt wiele na temat związku między osobowością matki, opieką macierzyńską i osobowością jej młodych, zwłaszcza w warunkach naturalnych. Celem tej pracy bedzie, w oparciu o dostepna literature, okreslenie wplywu roznych typow opieki nad potomstwem u naczelnych na rozwoj psychiczny i fizyczny potomstwa.

TEMAT
Związek pomiędzy osobowością makaków i ich reakcją na zwiedzających ZOO w Poznaniu.

CEL PRACY
W grupach społecznych różnice osobowości pomiedzy osobnikami są uważane za korzystne dla całej grupy, ponieważ promują zróżnicowanie zadań, takie jak odkrywanie i czujność. Ogólnie rzecz biorąc, międzyosobnicze badania osobowości naczelnych są szczególnie ważne, ponieważ mogą one dostarczyć modeli do badań nad osobowością człowieka i mogą nakreslic procesy ewolucyjne, które ukształtowały strukturę osobowości i promowały indywidualne różnice. Celem tej pracy jest: 1) okreslenie osobowosci osobnikow w grupie makakow japonskich, 2) zbadanie zaleznosci pomiedzy osobowoscia osobnikow i otwartoscia na zwiedzajacych ZOO.

TEMAT
Wpływ wybranych grzybów endogennych na rośliny pszenicy zwyczajnej (Triticum aestivum L.)

CEL PRACY
Celem pracy jest określenie wpływu endogennych izolatów grzybów na ekspresję wybranych genów pszenicy związanych z reakcjami obronnymi, odpornościowymi lub symbiotycznymi roślin. Praca będzie obejmowała: (1) selekcję kandydatów genów związanych z wymienionymi powyżej reakcjami roślin pszenicy; (2) izolację RNA z korzeni i liści siewek pszenicy rosnącej w warunkach laboratoryjnych traktowanych/inokulowanych grzybami endofitycznymi; (3) analizę ekspresji wyselekcjonowanych genów metodą RT-qPCR. W badaniach wykorzystane będą dwie odmiany pszenicy formy jarej i ozimej. Materiał grzybowy będą stanowiły szczepy wyizolowane wcześniej z tkanek wspomnianych odmian, zidentyfikowane gatunkowo na podstawie analiz morfologicznych i molekularnych.

TEMAT
Analiza zmienności genetycznej i biochemicznej patogenicznego grzyba Fusarium proliferatum w warunkach stresu abiotycznego z wykorzystaniem narzedzi bioinformatycznych

CEL PRACY
Nadrzędnym celem pracy jest analiza wpływu stresu abiotycznego tj. stresu solnego i osmotycznego na biosyntezę fumonizyn u patogenicznego grzyba Fusarium proliferatum z zastosowaniem wybranych narzędzi bioinformatycznych.

TEMAT
Optimization of isolation and homogenous culture method of human Wharton’s jelly mesenchymal stromal cells and their differentiation into neurons for use in regenerative medicine.

Optymalizacja metod izolacji i homogennej hodowli ludzkich mezenchymalnych komórek zrębowych z galarety Whartona oraz ich różnicowanie do komórek nerwowych w celu zastosowania w medycynie regeneracyjnej.

CEL PRACY
Celem pracy jest standaryzacja metody izolacji i warunków homogennej hodowli ludzkich mezenchymalnych komórek zrębowych z galarety Whartona, a także optymalizacja metody różnicowania uzyskanej hodowli do komórek nerwowych.

Ponadto, w celu uzyskania informacji na temat bezpieczeństwa kriokonserwacji powyższych komórek, jako potencjalnej metody ich przechowywania dla zastosowań klinicznych, zbadany zostanie jej wpływ na morfologię i transkryptom komórek otrzymanych w toku badań: homogennej hodowli ludzkich mezenchymalnych komórek zrębowych z galarety Whartona, homogennej hodowli ludzkich mezenchymalnych komórek zrębowych z galarety Whartona poddanej kriokonserwacji, homogennej hodowli zróżnicowanych komórek nerwowych oraz homogennej hodowli zróżnicowanych komórek nerwowych poddanych kriokonserwacji.
Otrzymane homogenne populacje ludzkich mezenchymalnych komórek zrębowych z galarety Whartona oraz komórek nerwowych, będą mogły zostać wykorzystane jako źródło komórek w badaniach przedklinicznych.

TEMAT
Research based on interactions between NANOS, PUMILIO and hnRNAP2B1 proteins in post-translational genes expression in male sex cells.

CEL PRACY
The main purpose of the experiment is to show the key interactions between them and the influence they cause in post-translational genes expression. We would like to demonstrate significant role of these proteins.

TEMAT
The effect of cannabidiol on the expression of GABAergic receptors in the brain of rats undergoing alcohol tolerance development.
Wpływ kannabidiolu na ekspresję receptorów GABAergicznych w mózgu szczurów poddanych rozwojowi tolerancji alkoholowej.

CEL PRACY
The aim is to evaluate the effect of cannabidiol (CBD) on the development of ethanol tolerance. The experiments will concern brain samples of male Wistar rats subjected previously to CBD and induction of the ethanol tolerance. Because GABAergic receptor type A (GABAA) is regarded to be involved in the tolerance, the experiments will consist in quantitative assessment of transcripts of genes coding for chosen GABAA subunits using the quantitative PCR with real-time fluorescence detection (real-time qPCR) and verification of the observed differences at protein level by Western blot. The obtained results are important for understanding of alcoholism pathomechanism and development of putative therapeutic strategies.

TEMAT
Effect of harman and nonharman on the expression of genes associated with age-related neurodegenerative changes in Sprague-Dawley rats.
Wpływ związków harman i nonharman na ekspresje genów związanych ze zmianami neurodegeneracyjnymi warunkowanymi wiekiem u szczurów rasy Sprague-Dawley.

CEL PRACY
Ocena wpływu związków z grupy beta- karbolin (harman i nonharman) na ekspresję genów związanych ze zmianami neurodegeneracyjnymi warunkowanymi wiekiem u szczurów Spraque- Dawley po kilkumiesięcznym traktowaniu związkami harman i nonharman.

TEMAT
Analysis of antiproliferative properties of new analogs of pyrimidine nucleoside dimers containing 1,2,3-tiazol linkage in tumor cell lines

CEL PRACY
Choroby nowotworowe stanowią jedną z głównych przyczyn zgonów w krajach rozwijających się oraz wysokorozwiniętych, generując znaczne koszty społeczne i ekonomiczne. Stosowane obecnie strategie terapeutyczne w dalszym ciągu nie zapewniają oczekiwanej skuteczności i selektywności oraz obarczone są poważnymi skutkami ubocznymi, dlatego badania nad opracowywaniem nowych strategii leczenia stanowią intensywnie rozwijającą się dziedzinę nauk medycznych. Głównym celem pracy jest zbadanie odpowiedzi w warunkach in vitro wybranych nowotworowych linii komórkowych (MRC5, HeLa, HepG2, T98G, U-118 MG, U-87 MG) na 13 nowych analogów dimerów pirymidynowych zsyntetyzowanych w Zakładzie Chemii Nukleozydów i Nukleotydów IChB PAN w Poznaniu. W tym celu wykorzystane zostaną między innymi takie metody badawcze jak test MTT, test klonogenny czy metody cytometrii przepływowej, aby ocenić związki m.in. pod kątem ich toksyczności, wpływu na proliferację, apoptozę czy cykl komórkowy. Prace te pozwolą na zidentyfikowanie związków potencjalnie terapeutycznych działających selektywnie względem określonego typu nowotworów.

TEMAT
Ocena migracji makrofagów w mikrośrodowisku modelu 3D raka piersi

CEL PRACY
Makrofagi stanowią jeden ze składników mikrośrodowiska nowotworowego. Zgodnie z danymi literaturowymi, większość z tych komórek może być rekrutowana przez komórki nowotworowe do tzw. TAMs ( makrofagi zasocjowane z nowotworem), wykazujących aktywność promującą rozwój nowotworu. Wysoki stopień infiltracji guza tymi komórkami jest złym czynnikiem prognostycznym dla pacjenta, ze względu zmiany w mikrośrodowisku korzystne dla komórek nowotworowych. Model 3D mysiego raka piersi to przestrzenny układ ko-hodowli komórek linii EMT6 i fibroblastów (linia NH 3T3/365) na rusztowaniach wykonanych z jedwabiu. Od kilku lat Zakład Diagnostyki i Immunologii Nowotworów WCO w Poznaniu pracuje na w/w modelu i prowadzi badania skupione na cross-talk pomiędzy komórkami nowotworowymi a komórkami ich mikrośrodowiska. Zastosowanie powyższego modelu w badaniach daje możliwość stworzenia warunków zbliżonych do warunków in vivo.
Celem pracy obejmującej część teoretyczną i praktyczną jest:
1. przedstawienie aktualnych danych na temat zróżnicowania fenotypowego makrofagów (M1, M2), ich roli w rozwoju nowotworów
2. ocena migracji makrofagów w modelu 3D mysiego raka piersi stanowiącego ko-hodowlę komórek raka piersi (linia EMT6), fibroblastów (linia NH 3T3/365) oraz makrofagów (linia J774) na rusztowaniu z jedwabiu.
W ramach części doświadczalnej pracy studentka przeprowadzi procedurę ekstrakcji jedwabiu naturalnego, wytwarzanie jedwabnych rusztowań, hodowlę komórek, ocenę oddziaływań między komórkami nowotworowymi, fibroblastami a makrofagami oraz zdolność makrofagów do migracji. Dzięki przeprowadzonym badaniom zostaną określone czynniki wpływające na zdolność makrofagów do migracji w guzie.

TEMAT
Breast cancer-induced angiogenesis - influence of cancer cells and their microenvironment on endothelial cells activity

CEL PRACY
Angiogeneza stanowi bardzo istotny proces w rozwoju nowotworów złośliwych. Złożone oddziaływania między komórkami nowotworu a komórkami mikrośrodowiska, w tym szczególnie komórkami śródbłonka mogą prowadzić do powstania nowotworowych naczyń krwionośnych. Model 3D mysiego raka piersi to przestrzenny układ ko-hodowli komórek linii EMT6 i fibroblastów (linia NH 3T3/365) na rusztowaniach wykonanych z jedwabiu. Od kilku lat Zakład Diagnostyki i Immunologii Nowotworów WCO w Poznaniu pracuje na w/w modelu i prowadzi badania skupione na cross-talk pomiędzy komórkami nowotworowymi a komórkami ich mikrośrodowiska. Zastosowanie powyższego modelu w badaniach daje możliwość stworzenia warunków zbliżonych do warunków in vivo.
Celem pracy jest określenie oddziaływań modelu 3D raka piersi na komórki śródbłonkowe i proces tworzenia naczyń krwionośnych. W ramach pracy zostanie zbadany:
1) wpływ pożywki kondycjonowanej zebranej znad modelu raka piersi na tworzenie przez komórki śródbłonka naczyń krwionośnych na matriżelu z zastosowaniem testu in Vitro Angiogenesis Assay Tube Formation;
2) morfologia, penetracja komórek śródbłonkowych i ich zdolność do formowania naczyń krwionośnych, po wprowadzeniu komórek do modelu 3D.
Badania będą realizowane z zastosowaniem różnych technik/metod, w tym mikroskopowych i molekularnych.
Poznanie interakcji i ich warunków pozwoli być może w przyszłości na wykorzystanie w/w modelu do testowania związków hamujących lub ograniczających proces angiogenezy. Znane leki wciąż nie zapewniają w pełni skutecznej terapii.

TEMAT
Wpływ odpadów pochodzenia antropogenicznego na zgrupowania mrówek

CEL PRACY
Synurbizacja jest obecnie jedną z najważniejszych sił ekologicznych. Pomimo licznych badań nadal nie udzielono jednoznacznej odpowiedzi na pytanie, czy uzależnienie zwierząt od dzielności człowieka stanowi dla nich pułapkę ekologiczną. Stąd też w niniejszej pracy wykonane zostaną analizy, których nadrzędnym celem jest znalezienie odpowiedzi na w/w pytanie. Jako obiekt badań wybrano mrówki, ponieważ wśród bezkręgowców jest to grupa która najszybciej wykorzystuje odpady generowane przez gospodarstwa domowe. Z technicznego punktu widzenia badania będą miły charakter semi-eksperymentalny, polegający na stymulowaniu zgrupowaniami mrówek przetworzonymi, organicznymi produktami niewystępującymi naturalnie w środowisku.

TEMAT
Investigation of the role of RNA binding proteins and RNA structure in p53 protein translation. Structural and functional analysis.

CEL PRACY
Określenie roli wybranych białek oraz struktury RNA w procesie translacji białka p53. Stosując szereg metod z zakresu biochemii kwasów nukleinowych i białek zidentyfikowane zostaną motywy strukturalne w mRNA p53, które w skutek tworzenia miejsc wiązania dla ważnych białek regulują proces syntezy białka p53 i jego ważnej funkcjonalnie izoformy.

TEMAT
Investigation of the role of RNA binding proteins and RNA structure in p53 protein translation. Structural and functional analysis.

CEL PRACY
Określenie roli wybranych białek oraz struktury RNA w procesie translacji białka p53. Stosując szereg metod z zakresu biochemii kwasów nukleinowych i białek zidentyfikowane zostaną motywy strukturalne w mRNA p53, które w skutek tworzenia miejsc wiązania dla ważnych białek regulują proces syntezy białka p53 i jego ważnej funkcjonalnie izoformy.

TEMAT
Deciphering post-transcriptional mutations identified in miRNAs in classical Hodgkin lymphoma

CEL PRACY
Project aims at deciphering peculiar mutations identified in miRNA transcripts in classical Hodgkin lymphoma (cHL). The project is a part of a larger Polish-German collaborative grant focused on the role of miRNA in cHL. Wet-lab tasks include amplification, cloning of cDNA and Sanger sequencing with the aim to confirm a post-transcriptional RNA-editing based mechanism behind the appearance of the mutations.

TEMAT
Badania cytotoksyczności funkcjonalizowanych, wielościennych nanorurek węglowych na wybranych liniach komórkowych

CEL PRACY
Praca ma na celu funkcjonalizację i zbadania wpływu funkcjonalizowanych wielościennych nanorurek węglowych na żywotność wybranych linii komórkowych. Funkcjonalizacja ma na celu biokompatybilizację nanorurek poprzez dodanie powierzchniowych grup hydrofilowych. Następnie zostanie przeprowadzony panel testów określających wpływ na różne markery metabolizmu oraz przeżywalności komórek.

TEMAT
Immunolokalizacja acetylowanej lizyny 12 histonu 4 (H4K12ac) w plemnikach mężczyzn z oligozoospermią

CEL PRACY
Celem pracy jest sprawdzenie lokalizacji przestrzennej acetylowanej lizyny 12 histonu 4 (H4K12ac) w plemnikach mężczyzn o obniżonej liczbie plemników (oligozoospermia) metodą immunofluorescencji.

TEMAT
Deciphering post-transcriptional mutations identified in miRNAs in B-cell lymphomas

CEL PRACY
.

TEMAT
BADANIE GLOBALNEGO POZIOMU METYLACJI (5mC) I HYDROKSYMETYLACJI (5hmC) DNA PLEMNIKOWEGO U MĘŻCZYZN Z OLIGOZOOSPERMIĄ

CEL PRACY
Celem pracy jest sprawdzenie, czy i w jaki sposób w plemnikach mężczyzn o obniżonej liczbie plemników ( olizgozoospermia) globalny poziom metylacji (5mC) i hydroksymetylacji (5hmC )DNA jest zmieniony wobec kontrolnej grupy mężczyzn płodnych o prawidłowych parametrach nasienia ( normozoospermia).

TEMAT
Analiza wariantów genu CXCL8 u pacjentów populacji polskiej z nieswoistymi chorobami zapalnymi jelit

CEL PRACY
Analiza wariantów sekwencyjnych genu CXCL8 u pacjentów z NChZJ oraz analiza korelacji z diagnozą kliniczną.

TEMAT
Sztuczne mikroRNA jako strategia terapeutyczna dla chorób poliglutaminowych

CEL PRACY
Znalezienie najlepiej działających reagentów typu antysens w alleloselektywnym wyciszaniu genów odpowiedzialnych za rozwój chorób poliglutaminowych.

TEMAT
Methylation analysis of selected genes in the cell free DNA of patients with head and neck cancer.
Analiza poziomu metylacji wybranych genów w wolnokrążącym DNA u pacjentów z nowotworami głowy i szyi.

CEL PRACY
Główny cel pracy magisterskiej stanowi analiza poziomu metylacji wybranych dinukleotydów CG w wolnokrążącym DNA guza wyizolowanym z osocza pacjentów z nowotworami głowy i szyi. Cel główny realizowany będzie poprzez cele szczegółowe: Określenie poziomu metylacji wybranych regionów w wolnokrążącym DNA wyizolowanym od chorych z Head and Neck Squamous-Cell Carcinoma (HNSCC), zbadanie metylacji tych samych regionów w wolnokrążącym DNA izolowanych z prób kontrolnych. oraz poszukiwanie istotnych różnic w poziomach metylacji pomiędzy dwoma analizowanymi grupami. Cel biotechnologiczny: wykorzystanie wolnokrążącego DNA jako biomarkera u pacjentów z nowotworami głowy i szyi.

TEMAT
Structure and properties of selected mature human microRNAs

CEL PRACY
Celem pracy jest ukazanie strukturalnych aspektów mikroRNA oraz pokazanie korelacji między strukturą a funkcją miRNA. Z puli ludzkich dojrzałych mikroRNA, z użyciem narzędzi bioinformatycznych, wytypowane będą mikroRNA, które potencjalnie mogą tworzyć strukturę wyższego rzędu. Dla wybranych mikroRNA, z użyciem specyficznych nukleaz (rybonukleazy T1, V1 oraz nukleazy S1), barwników specyficznie rozpoznających motywy strukturalne oraz metod spektroskopowych zostanie określona struktura badanych RNA. Poznanie struktury mikroRNA może przyczynić się do zrozumienia wielofunkcyjności i specyficzności tych krótkich niekodujących RNA oraz poznania mechanizmów regulacji komórkowej zależnych od mikroRNA. Wiedza te może być przydatna w kontekście poznania etiologii chorób, które cechują się zmienionym poziomem miRNA oraz projektowania nowych leków skierowanych na miRNA, do zastosowania w terapii tych chorób.

TEMAT
Różnorodność drobnych ssaków w diecie lisów rudych w Borach Tucholskich i na Pojezierzu Iławskim

CEL PRACY
Poznanie diety lisów rudych w dwóch różnych siedliskach Niżu Polskiego.

TEMAT
Algorytmiczne podejście do analizy porównawczej chromatogramów cieczowych białek u myszy Mus musculus

CEL PRACY
Celem pracy jest opracowanie podejścia algorytmicznego, które może być wykorzystane do analizy porównawczej chromatogramów cieczowych białek występujących u myszy.
Badania obejmą analizę statystyczną i bioinformatyczną danych zawartych w widmach masowych. W pracy zostanie wykorzystane już istniejące oprogramowanie, powstaną także proste
skrypty opierające się na dostępnych bibliotekach służących do analizy tego typu danych. Wskazanie istotnych różnic (bądź podobieństw) może zostać wykorzystane w dalszych badaniach.

TEMAT
Photodegradation of biohazardous staining dye using green chemistry method at nanoscale

CEL PRACY
Nowadays, nanostructures having tremendous chemical and physical properties are gaining attention in biomedical industry. However, naostructures prepared through classical method (physical and chemical) are least biocompatible and toxic to environment. Considering this, in current research, organometalllic silver nanostructures have been prepared by green chemistry method using extract of medicinally important plant Cichorium intybus. Secondary metabolities from C. intybus can be used as an alternative to synthetic reagents at industrial scale to manufacture biosafe and economical nanostructures with enhanced physico-chemical parameters. Prepared nanosructures will be characterized using SEM, XRD, FTIR, TGA, UV and zeta potential. Futhermore, prepared nanostructures will be tested as an cost efficient and active agent to .....

TEMAT
Narzędzie do automatyzacji procesu normalizacji danych w eksperymencie SHAPE

CEL PRACY
Celem pracy będzie opracowanie algorytmu normalizacji danych pochodzących z eksperymentu SHAPE dla cząsteczek RNA, implementacja algorytmu w postaci przyjaznego użytkownikowi narzędzia z interfejsem sieciowym, wykonanie testów obliczeniowych algorytmu na reprezentatywnym zbiorze danych testowych, porównanie wyników działania algorytmu z wynikami normalizacji wykonywanej odręcznie przez ekspertów.

TEMAT
Lokalizacja chloroplastowych obszarów nukleoidopodobnych w mutantach Arabidopsis thaliana pozbawionych wewnątrzbłonowej metalloproteazy cynkowej - Egy1

CEL PRACY
Celem pracy jest analiza obrazów ultrastrktury chloroplastów roślin szczepu dzikiego i mutantów egy1 pod kątem rozmieszczenia i ilości kopii obszrów nukleoidooidobnych. Z informacji literaturowych wiadomo, że białko Egy1 jest istotne dla prawidłowego przebiegu biogenezy chloroplastów oraz, prawdopodobnie, procesu replikacji zachodzącego w chloroplastach. Z koleji moje wcześniejsze doświadczenia wskazują, że u mutantów egy1 obniżony jest poziom białka MFP1, wiążącego się niespecyficznie do chlDNA i błon tylakoidych.

TEMAT
Aktywność glikoalkaloidów z psianki czarnej Solanum nigrum L. jako związków o działaniu insektycydowym.

CEL PRACY
Celem pracy jest syntetyczne przedstawienie działania glikoalkaloidów - związków biologicznie czynnych - na owady. Związki te coraz częściej są obiektem zainteresowania naukowców zajmujących się ochroną środowiska i zwalczaniem szkodników. Znajdują zastosowanie jako insektycydy nowszych generacji. Mogą również wykazywać działanie addytywne lub synergistyczne w stosunku do syntetycznych insektycydów. W pracy planowane jest również przeprowadzenie części eksperymentalnej, dotyczącej skojarzonego czasowo stosowania glikoalkaloidu i syntetycznego insektycydu, na wybrane aspekty fizjologii organizmu modelowego - chrząszcza Tenebrio molitor.

TEMAT
Mechanizmy działania alkaloidów jako czynników modyfikujących funkcjonowanie organizmów

CEL PRACY
Celem pracy jest przedstawienie mechanizmów działania glikoalkaloidów na poziomie komórek, tkanek i organizmów. Większość badań dotyczących tych związków koncentruje się bowiem na działaniu toksycznym lub farmakologicznym, Natomiast zagadnienia związane z badaniami podstawowymi, koncentrującymi się na wpływie glikoalkaloidów na ultrastrukturę komórek i metabolizm poszczególnych tkanek w organizmach poddanych działaniu tych związków, są relatywnie słabo poznane. Praca ma mieć charakter przeglądowy, z dodatkowym elementem badań eksperymentalnych.

TEMAT
Cząsteczki sygnałowe w immunizacji roślin uprawnych

CEL PRACY
Celem pracy jest charakterystyka cząsteczek sygnałowych zaangażowanych w inicjację systemicznej odporności nabytej (SAR), do której dochodzi w wyniku słabej infekcji lokalnej lub w wyniku traktowania induktorami SAR. Praca zakłada eksperymentalną weryfikację wzajemnych oddziaływanń pomiędzy tlenkiem azotu oraz kwasem azelainowym i pipekolowym podczas immunizacji ziemniaka.

TEMAT
Analiza przebiegu procesu autofagii podczas ksylogenezy u mutantów atg5 i atg9 Arabidopsis thaliana

CEL PRACY
Poznanie przebiegu i regulacji degradacji struktur komórkowych w procesie autofagii z jednoczesną analizą procesu formowania wtórnej ściany komórkowej różnicujących się naczyń drewna u Arabidopsis thaliana (typu dzikiego oraz mutantów genów związanych z autofagią – atg5 i atg9). Badania będą miały na celu określenie roli genów atg5 i atg9 w procesie tworzenia autofagosomów i pozwolą odpowiedzieć na pytanie czy u mutantów tych genów autofagia przebiega nadal prawidłowo, doprowadzając do wykształcenia w pełni funkcjonalnych naczyń drewna, czy też szlak ten jest zaburzony. Wyniki otrzymane w toku badań mechanizmów związanych z ksylogenezą, umożliwią dalszą pracę nad genetyczną modyfikacją sposobu formowania ksylemu o pożądanych cechach drewna jako surowca przemysłowego.

TEMAT
Sukcesja bezkręgowców na zwłokach ssaków w środowisku wodnym i możliwość jej wykorzystania do szacowania czasu zgonu

CEL PRACY
Celem pracy jest podsumowanie danych literaturowych na temat zasiedlania zwłok rozkładających się w środowisku wodnym przez stawonogi i ocena mozliwości wykorzystania tego zjawiska do szacowania czasu zgonu.

TEMAT
Chrząszcze nekrofilne i ich rola w szacowaniu czasu zgonu

CEL PRACY
Celem pracy jest podsumowanie danych literaturowych na temat chrząszczy zasiedlających zwłoki i ocena możliwości wykorzystania wiedzy na temat ich biologii i ekologii do szacowania czasu zgonu.

TEMAT
Zróżnicowanie środowisk zasiedlanych przez wybrane gatunki chrząszczy z rodziny gnilikowatych (Histeridae).

CEL PRACY
Celem pracy jest analiza na podstawie danych literaturowych zróżnicowania nisz ekologicznych wybranych gatunków chrząszczy z rodziny gnilikowatych zasiedlających nietrwałe mikrośrodowiska. Jeden z rozdziałów pracy stanowić będzie scenariusz lekcji, której zadaniem będzie zaznajomienie uczniów ze zróżnicowaniem środowisk zasiedlanych przez owady na przykładzie chrząszczy gnilikowatych. Jeden z rozdziałów pracy stanowić będzie scenariusz lekcji, której zadaniem będzie zaznajomienie uczniów ze zróżnicowaniem środowisk zasiedlanych przez owady na przykładzie chrząszczy gnilikowatych.

TEMAT
Zmienność morfologiczna stadiów rozwojowych jedwabnika morwowego (Bombyx mori L.) w aspekcie zmienności rasowej

CEL PRACY
Poznanie zmienności stadiów rozwojowych gąsienic jedwabnika morwowego w obrębie różnych ras.

TEMAT
Modraszkowate (Lycaenidae) Parku Narodowego Gorongosa w Mozambiku

CEL PRACY
Przedmiotem badań są motyle dzienne z rodziny Lycaenidae zebrane w Mozambiku w Parku Narodowym Gorongosa i jego otulinie w latach 2015-2018. Fauna motyli w tym Lycaenidae w Mozambiku jest bardzo słabo poznana. Motyle dzienne w tym z Lycaenidae są często wykorzystywane w waloryzacjach przyrodniczych terenów chronionych. Jest duże prawdopodobieństwo odnotowania nowych informacji z zakresu morfologii oraz rozsiedlenia tych owadów w Afryce. Wszystkie te dane zostaną wykorzystane w opracowaniach naukowych jako argumenty przy projektowanym poszerzeniu granic Parku.

TEMAT
Polimorfizm genetyczny izolatów Bacillus thuringiensis wyosobnionych z próbek gleby i ptaków

CEL PRACY
Celem pracy jest określenie zróżnicowania klonalnego izolatów B. thuringiensis (z użyciem metod ERIC i BOX) oraz analiza ich profilu plazmidowego.

TEMAT
Profil białkowy parasporalnych kryształów wytwarzanych przez Bacillus thuringiensis

CEL PRACY
Celem pracy jest porównanie składu białkowego insektycydowych kryształów białkowych u izolatów B. thuringiensis oraz wytypowanie na podstawie profilu białkowego szczepów o potencjalnie najwyższej aktywności owadobójczej.

TEMAT
Insektycydowa aktywność roślinnych chitynaz oraz mieszanin chitynaz i toksyn Cry Bacillus thuringiensis wobec larw Spodoptera exigua

CEL PRACY
Celem pracy jest określenie wpływu chitynaz pochodzenia roślinnego oraz mieszanin chitynaz i owadobójczych białek Bacillus thuringiensis na rozwój larw S. exigua.

TEMAT
Wpływ grzybowych chitynaz i białek wiążących chitynę (CBP) na rozwój larw Spodoptera exigua

CEL PRACY
Celem pracy jest określenie wpływu enzymów chitynolitycznych oraz białek wiążących chitynę (CBP), charakterystycznych dla grzybów entomopatogennych, na rozwój larw S. exigua.

TEMAT
Wykorzystanie owadów do szacowania czasu śmierci ssaków.

CEL PRACY
Poznanie fauny owadów żerujących na zwłokach zwierząt

TEMAT
Poszukiwanie białek zaangażowanych w składanie intronow u fagow z rzędu Caudovirales

CEL PRACY
Celem pracy jest identyfikacja białek zaangażowanych w składanie intronów grupy I u wybranych fagów z rzędu Caudovirales. W tym celu zastosujemy między innymi techniki bioinformatyczne i metodę RNA-protein pull-down. Dzięk lepszemu zrozumieniu mechanizmów ekspresji genów u fagów z badanej grupy możliwe będzie ich szersze i łatwiejsze zastosowanie w terapii fagowej (jako środki przeciwbakteryjne) i inżynierii genetycznej (jako wektory lub ich elementy). Jak pokazał casus autokatalitycznych intronów grupy II również same introny mogą stać się nadzieniem użytecznym w manipulacjach genetycznych.

TEMAT
Molekularne i ewolucyjne determinanty zjadliwości u fagów z rzędu Caudovirales

CEL PRACY
Celem pracy będzie opisanie czynników decydujących o tym czy infekcja fagowa wejdzie na ścieżkę lityczną, lizogenną czy też zostanie zatrzymana na etapie pseudo-lizogenii.

TEMAT
Bioinformatyczne metody przewidywania intronów w różnych domenach organizmów żywych.

CEL PRACY
Celem pracz jest przegląda metod obliczeniowych i narzędzi bioinformatycznych wykorzystywanych do identyfikacji intronów u wirusów, bakterii archeonów i eukariontów.

TEMAT
Metody poszukiwania danych transkryptomicznych powiązanych z sekwencjami genomów ze szczególnym uwzględnieniem układów wielkoskładnikowych.

CEL PRACY
W bazach NCBI dane transkryptomiczne (rekordy "SRA") nie są w prosty sposób powiązane z genomami (rekordy baz wchodzący w skład kolekcji "Nucleotide"). Celem niniejszej pracy jest opisanie metod umożliwiających skojarzenie transkryptomów z genomami z których pochodzą. W tym kontekście szczególną trudność stanowią transkryptomy pochodzące z wielu genomów jednocześnie (np. z układów Wirus-Gospodarz).

TEMAT
Ochrona przyrody w budżetach obywatelskich dużych miast

CEL PRACY
Identyfikacja potrzeb mieszkańców oraz rozpoznanie rodzaju i zakresu projektów z zakresu ochrony przyrody zgłaszanych przez mieszkańców dużych miast do budżetów obywatelskich. Określenie znaczenia ochrony przyrody dla mieszkańców dużych miast w odniesieniu do innych potrzeb i aktywności.

TEMAT
Gospodarka odpadowa w budżetach obywatelskich dużych miast

CEL PRACY
Identyfikacja potrzeb mieszkańców w zakresie gospodarowania odpadami zgłaszanych do budżetów obywatelskich. Rozpoznanie zakresu i rodzaju potrzeb które nie są realizowane przez przyjęty system gospodarki odpadowej lub ich realizacja jest niewystarczająca i wymaga podjęcia dodatkowych działań przez mieszkańców.

TEMAT
Efekty ekonomiczno-ekologiczne selektywnego gromadzenia frakcji odpadów kuchennych w ramach gminnego systemu gospodarowania odpadami

CEL PRACY
1. Określenie uwarunkowań wdrożenia selektywnej zbiórki frakcji odpadów kuchennych w ramach gminnego systemu gospodarowania odpadami.
2. Ocena efektywności ekonomicznej selektywnego gromadzenia frakcji odpadów kuchennych w ramach gminnego systemu gospodarowania odpadami odpadami.
3. Określenie efektów ekologicznych selektywnego gromadzenia frakcji odpadów kuchennych w ramach gminnego systemu gospodarowania odpadami.

TEMAT
Opracowanie przyrodniczych zajęć edukacyjnych dla drużyn harcerskich

CEL PRACY
Opracowanie rozwiązań dydaktycznych na przyrodnicze zajęcia edukacyjne dla drużyn harcerskich (klasy 4-6):
a) rozbudzających zainteresowania przyrodnicze,
b) przyczyniających się do zrozumienia cech, zjawisk i rytmów przyrodniczych,
c) wykształcających umiejętności przydatne w samodzielnym poznawaniu przyrody.

TEMAT
Zdalne nauczanie biologii jako wyzwanie dla współczesnych nauczycieli

CEL PRACY
a) diagnoza problemów, ograniczeń oraz mocnych stron zdalnego nauczania biologii i przyrody; b) opracowanie własnych rozwiązań usprawniających i ubogacających zdalne nauczanie biologii i przyrody

TEMAT
Analiza oddziaływań genetycznych pomiędzy roślinnymi homologami podjednostek acetylotransferazy NuA4 i wybranymi czynnikami transkrypcyjnymi kontrolującymi rozwój aparatu fotosyntetycznego

CEL PRACY
Ogólnym celem pracy jest wstępna charakterystyka zależności funkcjonalnych pomiędzy acetylotransferazą NuA4 oraz wybranymi czynnikami transkrypcyjnymi zaangażowanymi w regulację rozwoju aparatu fotosyntetycznego u rośliny modelowej Arabidopsis thaliana. Badania prowadzone przez zespół prof. Piotra Ziółkowskiego wskazują na udział kompleksu NuA4 w regulacji ekspresji genów jądrowych związanych z fotosyntezą. Według przyjętej hipotezy badawczej, NuA4 wpływa na ekspresję tych genów acetylując histony w nukleosomach zlokalizowanych w ich obrębie. U drożdży, naprowadzanie kompleksu NuA4 na właściwe loci odbywa się dzięki rozpoznawaniu sekwencji DNA przez różne czynniki transkrypcyjne, które nie są stałymi podjednostkami kompleksu, dlatego ich związek z kompleksem NuA4 nie jest możliwy do stwierdzenia na podstawie samych tylko analiz biochemicznych. Do tej pory, zidentyfikowano już wiele czynników transkrypcyjnych zdolnych do rozpoznawania sekwencji DNA występujących w promotorach genów jądrowych związanych z fotosyntezą. Mutanty niewytwarzające aktywnych form tych białek wykazują zaburzenia w rozwoju aparatu fotosyntetycznego, które można zaobserwować także u roślin pozbawionych niektórych podjednostek kompleksu NuA4. Poprzez analizę fenotypową mutantów wielokrotnych, cechujących się brakiem funkcjonalnego kompleksu NuA4 oraz wybranych czynników transkrypcyjnych, można więc wstępnie ustalić jakie zależności łączą kompleks NuA4 ze znanymi elementami systemu kontroli ekspresji genów jądrowych związanych z fotosyntezą oraz zidentyfikować czynniki transkrypcyjne, które należy dokładniej zbadać jako potencjalnie zdolne do naprowadzania roślinnego kompleksu NuA4.
Realizacji ogólnego celu pracy będzie wymagała wykonania prostych zadań badawczych pod kierunkiem opiekuna pracy. Pierwszym z nich jest uzyskanie na drodze krzyżówek genetycznych roślin zawierających mutacje w genach podjednostek kompleksu NuA4 oraz w genach wybranych czynników transkrypcyjnych. W trakcie realizacji tego zadania studentka zapozna się z podstawowymi zasadami pracy z materiałem roślinnym oraz zdobędzie umiejętność analizy genotypowej z wykorzystaniem PCR, jednej z podstawowych technik badawczych w biologii molekularnej.
Drugie zadanie polega na opisaniu wpływu jednoczesnego występowania wcześniej wspomnianych mutacji na fenotyp roślin. Wykonanie tego zadania będzie wymagało zastosowania podstawowych metod laboratoryjnych do wykonania prostych pomiarów parametrów diagnostycznych związanych z rozwojem aparatu fotosyntetycznego, takich jak tempo wzrostu rozety, zawartość chlorofilu czy wielkość chloroplastów. Uzyskane wyniki doświadczalne studentka opracuje z pomocą opiekuna pracy, wykorzystując narzędzia matematyczne, informatyczne i statystyczne.
Jednym z głównych kierunków współczesnej biotechnologii roślin jest optymalizacja aparatu fotosyntetycznego roślin uprawnych. W tym kontekście, coraz większe znaczenie przypisuje się mechanizmom regulującym rozwój chloroplastów, dlatego wyniki uzyskane w efekcie realizacji przedstawionej pracy znajdą prawdopodobnie zastosowanie praktyczne.

TEMAT
Characterization of IFNalpha and IFNgamma induced transcriptional responses dependent on IRF1

CEL PRACY
IRF1 is a transcription factor involved in IFNalpha and IFNgamma induced responses. Huh7.5 liver cells overexpressing or lacking IRF1 will be generated and analyzed by western and RT-PCR to further characterize the role of IRF1 in IFNalpha and IFNgamma induced signaling and transcriptional responses.

2019-02-01, 16:25:36
RADA: Re: According to Msc in Biotechnology program requirements please provide in "aims" section(=cel pracy) potential application of the knowledge acquired during realisation of the MSc project.
Regards Agnieszka Ludwików

TEMAT
Characterization of IFNgamma and lipopolysaccharide induced transcriptional responses dependent on IRF8

CEL PRACY
IRF8 is a transcription factor involved in IFNgamma and lipopolysaccharide induced responses. HMEC endothelial cells overexpressing or lacking IRF8 will be generated and analyzed by western and RT-PCR to further characterize the role of IRF8 in IFNgamma and lipopolysaccharide induced signaling and transcriptional responses.

TEMAT
Predicting crop growth conditions and yield in Western Poland based on remote sensing data

CEL PRACY
The main purpose of this study is to determine growth conditions of selected crops (e.g. wheat, barley, maize) in Western Poland (Wielkopolska) based on remote sensing data retrieved from Sentinel 2 and Landsat 8 satellites and meteorological data from ground stations. The second objective is to model the crop yield of selected crop types on the level of districts (powiats). During this study, there will be the opportunity to learn the principles of sustainable development in agriculture. Moreover, we will test the hypotheses, for example: the area with small agricultural fields and
well developed tree belts are less sensitive to stress factors (such as water deficit) than areas with large agricultural fields.
During this study, following objectives will be reached:
- developing ability to process remote sensing data
- deepening the GIS technology and its application in modelling
- improving data analysis skills in R environment
- applying machine learning techniques in modelling
- improving writing and general language skills

Polska wersja tematu: Wykorzystanie danych satelitarnych do określenia warunków rozwoju roślin uprawnych i szacowania wielkości plonów w Wielkopolsce
Głównym celem merytorycznym pracy jest określenie warunków rozwoju różnych roślin uprawnych w Wielkopolsce na podstawie materiałów teledetekcyjnych z satelitów Sentinel 2 i Landsat 8 oraz danych meteorologicznych pozyskanych ze stacji naziemnych. Drugim celem jest modelowanie wielkości plonów wybranych upraw w podziale na powiaty województwa wielkopolskiego.
Celem pośrednim pracy jest poznanie zasad gospodarki rolnej opartej o zrównoważony rozwój, a także między innymi przetestowanie hipotezy mówiącej o tym, że obszary o mniejszych polach uprawnych, z dużym udziałem zadrzewień śródpolnych, pasów zadrzewień będą mniej podatne na czynniki stresowe np. deficyt wody niż tereny gdzie pola uprawne są duże.
W ramach tej pracy zaplanowano także szereg celów dydaktycznych, z których można wymienić:
- doskonalenie umiejętności obróbki danych satelitarnych
- zgłębianie technologii GIS i jej zastosowań w modelowaniu
- opanowanie podstawowych działań w środowisku R
- poznanie i stosowanie metod uczenia maszynowego w modelowaniu
- doskonalenie umiejętności pisania dłuższych tekstów, planowania badań, korzystania z literatury naukowej anglojęzycznej

TEMAT
Alergenne drzewa w Polsce - opracowanie baz danych i map o wysokiej rozdzielczości jako podkładu dla modeli stężeń ziaren pyłku

CEL PRACY
Głównym celem merytorycznym pracy jest opracowanie baz danych i map wybranych alergennych drzew w Polsce z wykorzystaniem banku danych o lasach. Powstanie baza danych dotycząca wydzieleń leśnych, w której będą uwzględnione takie taksony jak brzoza, olsza, jesion czy dąb występujące w danym miejscu z różnym stopniem pokrycia. Tak przygotowane dane zostaną agregowane do siatki różnej wielkości (od 1km, przez 10 km do 50 km). Drugim celem pracy będzie porównanie wyników z istniejącymi, bardziej ogólnymi opracowaniami, które powstały jako mapy bazowe dla modelowania stężenia i emisji alergennych ziaren pyłku w skali Europy np. w modelu SILAM.
Kolejnym celem będzie porównanie potencjalnych zasobów ziaren pyłku wybranych taksonów w różnych regionach Polski i wystawienie rekomendacji dla osób uczulonych co do miejsc, gdzie ryzyko ekspozycji na alergenne ziarna pyłku będzie najmniejsze.
W ramach tej pracy zaplanowano także szereg celów dydaktycznych, z których można wymienić:
- opanowanie podstaw pracy z bazami danych
- zgłębianie technologii GIS i poznawanie nowych funkcjonalności
- poznawanie nowego oprogramowania GIS w otwartym dostępie jak program QGIS
- nauka korzystania z różnych typów oprogramowania w celu uzyskania możliwie najlepszych wyników
- doskonalenie umiejętności pisania dłuższych tekstów, planowania badań, korzystania z literatury naukowej anglojęzycznej

TEMAT
Wpływ rozwoju infrastruktury turystycznej na zmiany w użytkowaniu terenu w powiecie sławieńskim w ostatnich 30 latach

CEL PRACY
Głównym celem merytorycznym pracy jest zbadanie oddziaływania człowieka na środowisko przyrodnicze w ostatnich 30 latach w środkowej części polskiego wybrzeża ograniczonej do granic powiatu sławieńskiego. Planowane jest wykorzystanie zdjęć satelitarnych z satelitów serii Landsat, począwszy od Landsata 4 aż do satelity Landsat 8 do zbadania zmian zasięgu poszczególnych typów ekosystemów, od lasów aż do terenów zabudowanych, Praca ta pozwoli wskazać m.in. w którym okresie i w jakim miejscu nastąpiły największe zmiany w użytkowaniu terenu, w szczególności związane z rozbudową infrastruktury turystycznej w powiecie sławieńskim. Jednym z innych wyników tej pracy będzie także odpowiedź na pytanie, czy te zmiany użytkowania terenu są związane z odległością od morza i czy możliwe jest ich wykrycie za pomocą dostępnych bezpłatnie danych satelitarnych.

W ramach tej pracy zaplanowano także szereg celów dydaktycznych, z których można wymienić:
- nabycie i doskonalenie umiejętności obróbki danych satelitarnych
- zgłębianie technologii GIS i poznawaniu nowych funkcjonalności
- nabycie umiejętności wizualizacji danych przestrzennych
- poznanie praktycznych zastosowań podstawowych parametrów statystycznych
- doskonalenie umiejętności pisania dłuższych tekstów, planowania badań, korzystania z literatury naukowej anglojęzycznej

TEMAT
Zmiany użytkowania terenu na obszarach chronionych wyspy Wolin w ostatnich 30 latach.

CEL PRACY
Głównym celem merytorycznym pracy jest zbadanie zmian użytkowania terenu w ostatnich 30 latach (1988-2018) na wyspie Wolin z wykorzystaniem Systemu Informacji Geograficznej. Praca skoncentrowana jest na porównaniu zmian, które zachodziły na przestrzeni 30 lat na terenie objętym różnymi formami ochrony na wyspie Wolin oraz na terenie nie objętym ochroną. W tym celu dokonana zostanie klasyfikacja typów pokrycia terenu na zdjęciach satelitarnych z różnych okresów (od 1988 do 2018, co 5 lat). Praca ma odpowiedzieć także na pytanie jakie informacje na temat obszarów bądź obiektów chronionych można uzyskać na podstawie zdjęć uzyskanych z satelitów serii Landsat zebranych przez wiele lat. Wskazane zostaną obszary na wyspie, które zmieniły się w największym stopniu w badanym okresie. Przeanalizowane zostaną również satelitarne współczynniki roślinne, na podstawie których podjęta zostanie próba oceny zmienności warunków rozwoju roślinności w badanych latach.

W ramach tej pracy zaplanowano także szereg celów dydaktycznych, z których można wymienić:
- nabycie i doskonalenie umiejętności obróbki danych satelitarnych
- zgłębianie technologii GIS i poznawaniu nowych funkcjonalności, w tym oprogramowania GIS typu open source (QGIS)
- nabycie umiejętności wizualizacji danych przestrzennych
- poznanie praktycznych zastosowań podstawowych parametrów statystycznych
- doskonalenie umiejętności pisania dłuższych tekstów, planowania badań, korzystania z literatury naukowej anglojęzycznej

TEMAT
Optimizing inducible Cas9 transcriptional repressor for research on human development.

CEL PRACY
In the MSc project a sophisticated, inducible CRISPR/Cas9-KRAB system will be adapted for conditional and temporary transcriptional repression of select gene expression at various stages of in vitro differentiation towards various cell types using human induced pluripotent stem cells. Such highly efficient, straightforward silencing will be a powerful tool for determination of candidate genes and pathways roles on human development or disease.

TEMAT
Optimizing the generation of functional knock-out human PSC lines using short oligonucleotide donors and CRISPR/Cas9 technology.

CEL PRACY
The MSc thesis research will focus on creating a platform for efficient generation of human pluripotent stem cell lines with homozygous knockouts using an inducible Cas9 system, in vitro transcribed sgRNAs and short ssDNA donors for insertion of STOP codon and protein tags. Such robustly created, homozygous knock-outs will be used for research on roles and mechanisms of action of example genes in cell fate determination during development or in disease in vitro modeling.

TEMAT
Rola wybranych genów w funkcjonowaniu komórek endokrynnych trzustki.

CEL PRACY
W pracy zastosowany będzie model badawczy w postaci ludzkiej linii komórek Beta trzustki. Manipulacje wybranych genów poprzez ich częściowe wyciszenie lub zwiekszoną ekspresję pozwolą na zbadanie ich roli w funkcjonalności komórek endokrynnych trzustki oraz wpływu na ekspresję kluczowych genów markerowych tych komórek.

TEMAT
Wstępna ocena roli wybranych genów w ludzkich komórkach beta trzustki.

CEL PRACY
1. Opracowanie konstruktów służących do nadekspresji wybranych genów (OVOL2 i GAP43) w komórkach ludzkich.
2. Analiza (na poziomie mRNA i białka) modelu ludzkich komórek beta o podwyższonym poziomie wybranych genów w celu zbadania ich roli w komórkach beta trzustki.
3. Analiza modelu ludzkich komórek beta o obniżonym poziomie wybranych genów w celu zbadania ich roli w komórkach beta trzustki.

TEMAT
Zwiększanie wydajności i specyficzności technologgi CRISPR/Cas9 w ludzkich komórkach pluripotencjalnych.

CEL PRACY
opracowanie nowych metod editowania genów w ludzkich komórkach pluripotencjalnych

TEMAT
Zwiększenie potencjału badawczego ludzkich komórek pluripotenjanych z indukowaną ekspresją białka Cas9

CEL PRACY
modyfikacja białka Cas9

TEMAT
Analiza ekspresji długich niekodujących RNA pochodzących z komórek endokrynnych trzustki.

CEL PRACY
1. Identyfikacja lncRNA o zmienionych w statystycznie istotny sposób poziomach ekspresji pomiędzy Ngn3+ komórkami z mysich embrionów z dnia e14.5 i e16.5, bazując na danych MATQ-seq przy użyciu narzędzi bioinformatycznych.
2. Weryfikacja/potwierdzenie ekspresji lncRNA w trzustkach mysich embrionów i ludzkich komórkach beta (EndoC-BH linia komórkowa) czy ludzkich zróżnicowanych z komórek pluripotencjalnych komórkach beta, DE, PP, EP.
3.Funkcjonalna analiza wybrach lncRNA.

2019-01-09, 14:13:21
RADA: Akceptacja tyttułu: Potwierdzam, że Kierownik pracy został poinformowany o zmianie i zaakceptował nowy tytuł pracy dyplomowej.
Serdecznie pozdrawiam,
Beata Messyasz

2019-01-09, 11:08:37
KIEROWNIK JEDNOSTKI: Praca u Malgosi Borowiak: Ja akceptuje poprawki wprowadzone przez RP, mam nadzieje, ze sa one rowniez przekazane promotorowi pracy?

2019-01-09, 11:03:02
RADA: Zmiana tematu pracy dyplomowej: Obecny temat pracy wymaga doprecyzowania. Propozycja Rady Programowej nowego tematu: "Analiza ekspresji długich niekodujących RNA pochodzących z komórek endokrynnych trzustki" (?)
Z pozdrowieniami,
Beata Messyasz

2019-01-09, 11:02:58
RADA: Zmiana tematu pracy dyplomowej: Obecny temat pracy wymaga doprecyzowania. Propozycja Rady Programowej nowego tematu: "Analiza ekspresji długich niekodujących RNA pochodzących z komórek endokrynnych trzustki" (?)
Z pozdrowieniami,
Beata Messyasz

2019-01-09, 11:02:48
RADA: Zmiana tematu pracy dyplomowej: Obecny temat pracy wymaga doprecyzowania. Propozycja Rady Programowej nowego tematu: "Analiza ekspresji długich niekodujących RNA pochodzących z komórek endokrynnych trzustki" (?)
Z pozdrowieniami,
Beata Messyasz

TEMAT
Computational study of putative allosteric pathways controlling molecular tunnels in dehalogenases

CEL PRACY
The goal of this project is to assemble data on the structure and dynamics of tunnel networks and putative structural features responsible for their modulation present in the wild-type dehalogenase LinB using various molecular dynamics simulation methods. The tunnels will be examined by CAVER software to reveal the location and geometric properties of tunnels, their temporal fluctuations, and identity of amino acid residues forming the tunnels. Finally, communication among individual residues and their correlated motions will be investigated to identify putative allosteric networks in the LinB enzyme capable of relaying signals upon the binding of ligand. In combination with the results of tunnel analysis, the allosteric networks connecting residues forming the tunnels will provide initial insights into structural features potentially involved in the allosteric regulation of molecular transport in the studied enzyme.

TEMAT
Przemiany flory roślin naczyniowych chronionego obiektu archeologicznego w Gieczu w okresie ostatnich 20 lat

CEL PRACY
Rozpoznanie aktualnego stanu flory naczyniowej grodziska w Gieczu i ocena jej przekształceń w stosunku do badań Z. Celki sprzed ponad 20 lat

TEMAT
Szata roślinna rezerwatu przyrody "Dębowa Góra" w Nadleśnictwie Bogdaniec (woj. lubuskie) oraz jej elementy chronione i cenne

CEL PRACY
Rozpoznanie i udokumentowanie flory i roślinności rezerwatu "Dębowa Góra", dotychczas bardzo słabo zbadanego, oraz wskazanie jego elementów cennych przyrodniczo

TEMAT
Skuteczność automatycznego wykrywania wokalizacji o różnym stopniu skomplikowania na przykładzie zięby (Fringilla coelebs)

CEL PRACY
Automatyczne rejestratory dźwięku są coraz częściej wykorzystywane do monitoringu wielu gatunków zwierząt lub całych ich zespołów. Technika ta pozwala w bardzo prosty sposób na gromadzenie tysięcy godzin nagrań dźwięków środowiska. Dość problematyczne pozostaje jednak wykrywanie wokalizacji poszczególnych gatunków. Najprostszym, jednak najbardziej pracochłonnym podejściem jest ręczne przeglądanie spektrogramów oraz klasyfikowanie wokalizacji do gatunku. Alternatywnie wykorzystywane są algorytmy pozwalające na automatyczną klasyfikację dźwięków do konkretnego gatunku. Metoda automatycznego wykrywania wokalizacji sprawdza się dość dobrze w przypadku gatunków o stosunkowo prostej wokalizacji. Gatunki o wokalizacji bardziej skomplikowanej przysparzają dość dużych trudności.
W ramach pracy przetestowana zostanie skuteczność różnych metod automatycznego wykrywania wokalizacji zięby. Opracowane zostaną algorytmy (oprogramowanie Song Scope, Kaleidoscope, monitoR) pozwalające na automatyczne wykrywanie różnych typów wokalizacji: skomplikowanych piosenek oraz prostych głosów. Następnie wykonane zostaną testy metody, poprzez porównanie detekcji automatycznych i manualnych (przez obserwatora) oraz określona zostanie częstotliwość popełniania dwóch typów błędów: niewykrycia wokalizacji przez algorytm oraz zaklasyfikowania wokalizacji innego gatunku jako wokalizację zięby. Opracowane algorytmy wykorzystane zostaną do analizy dobowych i sezonowych zmian wokalizacji zięby, w oparciu o nagrania pochodzące z automatycznych rejestratorów (8 rejestratorów nagrywających dźwięki środowiska co 10 dni, w tych samych punktach, od początku kwietnia do końca czerwca).
Wyniki pracy pozwolą odpowiedzieć na pytanie jak skuteczne mogą być różne metody automatycznej klasyfikacji w odniesieniu do śpiewu charakteryzującego się dużą zmiennością osobniczą, jak również prostych i stereotypowych głosów.

TEMAT
Nocturnal singing by daily active birds

CEL PRACY
Ostatnie badania pokazały, iż u niektórych gatunków ptaków o typowo dziennej aktywności obserwuje się również śpiew nocą. W przypadku gatunków europejskich nie wiadomo jak powszechne jest to zjawisko oraz jaką intensywnością charakteryzuje się nocny śpiew. Wciąż otwartym pozostaje również pytanie dotyczące funkcji nocnego śpiewu u aktywnych za dnia ptaków.
Celem pracy jest określenie (1) które spośród aktywnych za dnia gatunków ptaków śpiewają nocą, (2) jak intensywny jest nocny śpiew, oraz (3) czy nocny śpiew obserwowany jest równie często u gatunków zasiedlających tereny otwarte oraz lasy. Odpowiedzi na te pytania pozwolą lepiej zrozumieć funkcję nocnego śpiewu u aktywnych za dnia gatunków ptaków oraz umożliwią postawienie bardziej szczegółowych hipotez dotyczących tego zachowania.
W pracy wykorzystane zostaną nagrania wykonane przy użyciu automatycznych rejestratorów dźwięku w dwóch typach środowiska: lasach oraz terenach otwartych Doliny Górnego Nurca. Przeszukane zostaną nagrania obejmujące okres od godziny po zachodzie słońca do godziny przed wschodem słońca. Każda piosenka zanotowana w tym okresie zaklasyfikowana zostanie do gatunku. W sumie przeanalizowane zostaną nagrania z 62 punktów: 32 zlokalizowanych w lesie oraz 32 zlokalizowanych na terenach otwartych.

TEMAT
Analiza polimorfizmu genetycznego mikrosatelitów chloroplastowych u wybranych przedstawicieli z rodziny Pinaceae z wykorzystaniem narzędzi bioinformatycznych

CEL PRACY
Celem pracy jest analiza zróżnicowania genetycznego mikrosatelitów chloroplastowych u kilkunastu wybranych przedstawicieli z rodziny Pinaceae z wykorzystaniem narzędzi bioinformatycznych dedykowanych do wyszukiwania w genomach organellowych sekwencji mikrosatelitarnych i projektowania dla nich starterów.

TEMAT
Rośliny użytkowe i wiedza o nich wśród mieszkańców regionu lednickiego

CEL PRACY
W pracy magisterskiej przeprowadzone zostaną studia etnobotaniczne w regionie lednickim. Ich celem będzie poznanie roślin użytkowych i wiedzy o nich wśród mieszkańców terenów położonych nad jeziorem Lednica.

TEMAT
„Przyroda Wolina” – projekt punktów dydaktycznych wykorzystywanych w trakcie zajęć terenowych

CEL PRACY
Celem pracy jest zaprojektowanie kilku punktów dydaktycznych w Wolińskim Parku Narodowym (i na jego obrzeżach), które będzie można wykorzystywać w trakcie szkolnych zajęć terenowych.

TEMAT
Rośliny naczyniowe wybranych zamków Dolnego Śląska

CEL PRACY
Celem pracy jest ustalenie: (i) czy zróżnicowanie florystyczne zamków Dolnego Śląska jest powiązane z dawnym osadnictwem, (ii) czy we florze występują relikty dawnych upraw oraz (iii) .czy na zamkach występują gatunki rzadkie i zagrożone wymarciem w skali regionalnej i ogólnokrajowej.

2019-01-09, 11:59:57
RADA: Programowa Biologii: Zwracam się z prośbą o zaakceptowanie tematu pracy dyplomowej. Bez zatwierdzenia Kierownika Zakładu Rada Programowa nie może opiniować tematu pracy dyplomowej.
Serdecznie pozdrawiam,
Beata Messyasz

TEMAT
Wpływ temperatury na aktywność mitochondriów Daphnia spp.

CEL PRACY
Celem pracy jest porównanie szybkości oddychania i sprzężenia energetycznego mitochondriów rozwielitek z jezior podgrzanych i chłodnych, i badanych za pomocą oksygrafu w gradiencie temperatur. Hipoteza przewiduje, że dafnie z jezior podgrzanych mają przesunięte optimum w kierunku wyższych temperatur a ich mitochondria utrzymują wyższą wydajność.

TEMAT
Wpływ hipoksji i obecności fitoplanktonu na wzrost bakterii metanotroficznych i ich wydajność utleniania metanu.

CEL PRACY
Celem pracy jest porównanie wzrostu bakterii metanotroficznych i możliwości utleniania przez nie metanu w warunkach hipoksji oraz w układzie z organizmami fotosyntetyzującymi. Aby monitorować wzrost zarówno bakterii jak i fitoplanktonu wykorzystana zostanie technika qPCR i cytometria przepływowa. Dodatkowo, aby zmierzyć wydajność utleniania metanu, zostanie wykorzystany metan znakowany izotopem stabilnym 13C.

TEMAT
Opracowanie markerów molekularnych pozwalających na rozróżnienie gatunków i ich hybryd w kompleksie Daphnia longispina

CEL PRACY
Celem pracy jest sprawdzenie możliwości wykorzystania sekwencji mikrosatelitarnych (STR), polimorfizmów pojedynczych nukleotydów (SNP) i sekwencji mtDNA (COI) w rozróżnianiu mieszańców i gatunków w kompleksie Daphnia longispina.

TEMAT
Procesy regeneracji roślin po ekspozycji na stresy środowiskowe

CEL PRACY
Celem pracy jest synteza dostępnej literatury dotyczącej regeneracji roślin po działaniu różnorodnych czynników stresowych, takich jak susza, zatopienie, przechłodzenie, zasolenie i ekspozycja na metale. Istotnym elementem pracy jest próba znalezienie odpowiedzi jakie fizjologiczne i molekularne mechanizmy towarzyszą procesowi regeneracji oraz w jaki sposób modulują one odporność roślin.

TEMAT
Funkcje oksydacyjnych modyfikacji kwasów nukleinowych w regulacji procesów fizjologicznych i odpowiedzi na warunki stresowe w komórkach roślinnych i zwierzęcych.

CEL PRACY
Praca ma na celu syntezę wiedzy na temat wpływu oksydacyjnych modyfikacji kwasów nukleinowych na funkcjonowanie komórek roślinnych i zwierzęcych w optymalnych i niekorzystnych warunkach. Praca przedstawi między innymi udział oksydacyjnie modyfikowanych mRNA w procesie kiełkowania nasion, odpowiedzi roślin na abiotyczne i biotyczne czynniki stresowe, procesach starzenia i rozwoju chorób neurodegeneracyjnych u ludzi. W przypadku DNA, przedstawione zostanie powiązanie pomiędzy oksydacyjnymi zmianami nukleotydów, a odpowiedzią na warunki stresowe roślin, rozwojem szeregu chorób u ludzi, ale również regulacją metylacji DNA i histonów. Jednym z ważnych celów pracy jest pokazanie, że oksydacja kwasów nukleinowych może być wczesnym markerem działania warunków stresowych u roślin i szeregu chorób u ludzi. Z drugiej jednak strony może również uczestniczyć w regulacji ekspresji genów zaangażowanych w fizjologiczne procesy takie jak kiełkowanie nasion.

TEMAT
Analiza sekwencji mRNA zawierających 8-hydroksyguaninę (8-OHG).

CEL PRACY
Pomimo intensywnego rozwoju epitranskryptomiki w literaturze dostępnych jest niewiele informacji dotyczących najczęściej występującej oksydacyjnej modyfikacji RNA – 8-hydroksyguaniny (8-OHG). Celem pracy licencjackiej będzie w pierwszej kolejności wyszukanie pośród danych literaturowych sekwencji lub nazw genów zawierających 8-OHG, a następnie ich analiza pod kątem między innymi:
- organizmu, w którym została wykryta,
- warunków indukujących powstawanie,
- funkcji kodowanych białek
- ewentualnych wspólnych motywów.
Praca ma na celu przygotowanie zbioru oksydowanych sekwencji, które będzie można wprowadzić do tworzonej bazy danych OxiRNA.

TEMAT
Wpływ solaniny i chakoniny na aktywność kardiotropową blokera kanałów wapniowych – nifedypiny u chrząszcza Tenebrio molitor

CEL PRACY
Praca ma na celu określeni mechanizmu oddziaływania glikoalkaloidów solaniny i chakoniny na aktywnosć kurczliwą miokardium chrząszcza Tenebrio molitor z wykorzystaniem blokera kanałów wapniowych - nifedypiny

TEMAT
Analiza poziomu amin biogennych w układzie nerwowym owadów przy wykorzystaniu wysokosprawnej chromatografii cieczowej

CEL PRACY
Praca ma na celu oznaczenie poziomu wybranych amin biogennych (tyraminy, oktopaminy, dopaminy oraz serotoniny) w mózgu oraz brzusznym łańcuszku nerwowym chrząszcza Tenebrio molitor za pomocą wysokosprawnej chromatografii cieczowej (HPLC).

TEMAT
Produkcja rekombinowanego białka WHIRLY3 Arabidopsis thaliana w komórkach bakteryjnych

CEL PRACY
Opracowanie optymalnych warunków do nadekspresji w komórkach bakteryjnych i oczyszczania białka WHIRLY3

TEMAT
Wiedza i doświadczenie przyrodnicze uczniów klasy czwartej szkoły podstawowej z obszarów miejskich i wiejskich

CEL PRACY
Celem pracy jest poznanie wiedzy i doświadczeń przyrodniczych dzieci z obszaru miejskiego i wiejskiego, jak również porównanie, czy różnią się one w zależności od miejsca życia.

2019-01-09, 11:11:12
RADA: Praca P. Smoły: Rafale,
Czy możesz raz jeszcze zatwierdzić tę pracę jako kierownik Pracowni. Agnieszka Cieszyńska wprowadziła korektę w tytule, ale praca pojawiła się w systemie jako drugi wpis i tu brakuje Twojego zatwierdzenia. Zatwierdzenie jest przy pierwszym wpisie więc już zaznaczyłem pozytywną decyzję radu programowej.
Pozdrawiam,
Rafał Mól

TEMAT
Deklarowane nawyki żywieniowe w kontekście norm oraz preferowanych przez dzieci form spędzania wolnego czasu

CEL PRACY
Celem pracy jest poznanie deklarowanych przez dzieci nawyków żywieniowych w odniesieniu do przyjętych norm gwarantujących dobrostan organizmu i sprawdzenie, na ile wybrane tendencje są związane z preferowanym sposobem spędzania czasu wolnego.

2019-01-09, 11:11:48
RADA: Praca Klaudii Wojciech: Rafale,
Czy możesz raz jeszcze zatwierdzić tę pracę jako kierownik Pracowni. Agnieszka Cieszyńska wprowadziła korektę w tytule, ale praca pojawiła się w systemie jako drugi wpis i tu brakuje Twojego zatwierdzenia. Zatwierdzenie jest przy pierwszym wpisie więc już zaznaczyłem pozytywną decyzję radu programowej.
Pozdrawiam,
Rafał Mól

TEMAT
Wybrane przykłady fitozwiązków o działaniu hormetycznym i ich wpływ na procesy biologicznego starzenia się.

CEL PRACY
Celem pracy jest przegląd literatury przedmiotu (aktualny stan badań) pod kątem analizy wybranych fitozwiązków, które charakteryzują się właściwościami hormetycznymi oraz mają potencjalne zastosowanie w przeciwdziałaniu (spowalninaiu) procesom biologicznego starzenia się. Opisane zostaną przykłady takich związków, ich budowa oraz mechanizm działania o charakterze hormetyczym oraz antystarzeniowym.

TEMAT
Wykorzystanie technologii polimerowej sieci silikonowej 3-D-IPNS do hamowania rozrodu owadów

CEL PRACY
Celem pracy jest zbadanie działania 3-D-IPNS na rozwój jajnika, kurczliwość jajowodu, składanie jaj i embriogenezę u chrząszcza Tenebrio molitor

TEMAT
Badanie właściwości pro-apoptotycznych jamamarinu w ludzkich komórkach glejaka wielopostaciowego

CEL PRACY
wykazanie cytotoksyczności owadziego peptydu (jammamarinu) w komórkach glejaka wielopostaciowego (na przykładzie komórek linii U-138).

TEMAT
Wykorzystanie techniki izotermalnej amplifikacji kwasów nukleinowych LAMP (ang. loop medieated amplification) do identyfikacji bakterii Pseudomonas aeruginosa

CEL PRACY
Celem pracy jest wstępna walidacja testu molekularnego wykorzystującego technologię LAMP (ang. loop mediated amplification) do szybkiej, czułej i swoistej detekcji bakterii P. aeruginosa. Praca obejmuje wyselekcjonowanie genu docelowego, którego sekwencja byłaby swoista dla badanego gatunku, zaprojektowanie swoistych starterów do amplifikacji izotermalnej oraz przetestowanie swoistości starterów na izolatach DNA z gatunków referencyjnych.

TEMAT
Charakterystyka pozakomórkowego DNA (cfDNA) krążącego we krwi kręgowców

CEL PRACY
Praca ma charakter przeglądowy i dotyczy charakterystyki pozakomórkowego DNA (cfDNA) krążącego we krwi kręgowców, w tym DNA pochodzenia endogennego (mitochondrialnego,, martwicy i komórek nowotworowych) oraz egzogennego (płodowego, pasożytów).

TEMAT
Wykorzystanie sekwencji genów kodujących rybosomowe RNA i białka nici polarnej do identyfikacji mikrosporidiów

CEL PRACY
Praca ma charakter eksperymentalny. Celem pracy jest identyfikacja gatunkowa mikrosporydiów, których obecność została wcześniej wykryta w izolatach DNA za pomocą markera niespecyficznego (rejon V5 genu ssu rRNA). W trakcie wykonywania pracy będą amplifikowane i sekwencjonowane metodą Sangera kompletne geny rybosomowych RNA i trzech genów kodujących białka budujące nić polarną, specyficzną dla mikrosporydiów strukturę służącą do infekowania komórek gospodarza. Uzyskane sekwencje będą przyrównywane do bazy danych GenBank, a w przypadku braku identycznych sekwencji referencyjnych, przynależność taksonomiczna mikrosporydiów zostanie wyznaczona na podstawie prostej analizy filogenetycznej sekwencji ssu rDNA.

TEMAT
Molekularne metody detekcji bakterii Diplorickettsia (Legionellales) wywołujących nowo pojawiające się choroby zakaźne u ludzi

CEL PRACY
Praca ma charakter przeglądowy, a jej celem jest przegląd informacji na temat bakterii Diplorickettsia (Legionellales), nowego czynnika patogennego u ludzi, przenoszonego przez kleszcze. Do niedawna uważano, że Diplorickettsia są jedynie endosymbiontami kleszczy, ale w ostatnich latach zaczęto stwierdzać przypadki chorób zakaźnych u ludzi, które zostały wywołane przez te bakterie. Doniesienia te pojawiły się w ciągu ostatnich kilku lat. W pracy będą zawarte informacje na temat: przynależności systematycznej Diplorickettsia, funkcji bakterii endosymbiotycznych u hematofagów oraz, w szerszym zakresie, metody identyfikacji Diplorickettsia i innych bakterii u zwierząt i ludzi. w oparciu o dane molekularne.

TEMAT
Molekularne metody identyfikacji gatunków pierwotniaków z rodzaju Babesia (Apicomplexa)

CEL PRACY
Praca ma charakter przeglądowy i dotyczy molekularnych metod identyfikacji różnych gatunków z rodzaju Babesia, które mogą wywoływać choroby u ludzi. Praca będzie zawierała krótką charakterystykę rodzaju Babesia z informacją, które gatunki są zagrożeniem dla ludzi, natomiast skupi się na aktualnym stanie wiedzy dotyczącym opublikowanych genów referencyjnych, które mogą być przydatne w analizach na poziomie gatunkowym. Praca powinna zawierać zestawienie genów i starterów wykorzystywanych w takich analizach oraz powinna się krótko odnieść do innych metod identyfikacji babeszji, jeśli takie są stosowane.

TEMAT
Identyfikacja mikrosporidiów występujących u komarów (Culicidae) z wykorzystaniem sekwencjonowania rejonu V5 genu ssu rRNA

CEL PRACY
Praca ma charakter eksperymentalny i dotyczy amplifikacji i sekwencjonowania hiperzmiennego rejonu V5 genu ssu rRNA w celu wykrycia obecności i współwystępowania różnych gatunków mikrosporydiów. Jako model zastosowane zostaną izolaty DNA z komarów, ponieważ komary wykazują wysoki poziom zainfekowania tymi pasożytami. Uzyskane wyniki przyczynią się do przetestowania hipotezy o potencjalnym wektorowaniu mikrosporydioz przez komary.

TEMAT
The impact of metals on RNA oxidation in soybean seedlings

CEL PRACY
W poprzednich badaniach prowadzonych w Zakładzie Ekofizjologii Roślin wykazano, że kadm indukuje powstawanie oksydacyjnych modyfikacji RNA w siewkach soi. Celem pracy licencjackiej jest sprawdzenie, czy również inne metale pośredniczą w oksydacji RNA. Planowane doświadczenia obejmą pomiar poziomu najczęściej występującej oksydacyjnej modyfikacji RNA, 8-hydroksyguaniny (8-OHG), w siewkach soi poddanych działaniu miedzi i ołowiu

TEMAT
Edukacja prozdrowotna w szkole podstawowej - założenia programowe i propozycje rozwiązań dydaktycznych

CEL PRACY
Celem pracy jest analiza założeń obowiązującej Podstawy programowej w zakresie edukacji prozdrowotnej dla drugiego etapu kształcenia w szkole podstawowej oraz przygotowanie autorskich propozycji realizacji wybranych treści w tym zakresie..

TEMAT
Koncepcja materiałów dydaktycznych do ścieżek edukacyjno-przyrodniczych na terenie Czempinia

CEL PRACY
Celem pracy jest analiza i oszacowanie potencjału istniejących na terenie miasta Czempiń ścieżek edukacyjno-przyrodniczych oraz przygotowanie autorskich propozycji ich obudowy dydaktycznej.

TEMAT
Edukacja przyrodnicza w Związku Harcerstwa Polskiego - założenia programowe i propozycje rozwiązań dydaktycznych

CEL PRACY
Celem pracy jest przedstawienie programów edukacyjnych dotyczących wiedzy przyrodniczej realizowanych wśród harcerzy ZHP oraz przygotowanie autorskich propozycji rozwiązań dydaktycznych w tym zakresie.

TEMAT
Rola tkanki tłuszczowej w modelowaniu wzrastania liniowych wymiarów ciała u dziewcząt

CEL PRACY
Celem pracy będzie próba przedstawienia biologicznego mechanizmu zależności pomiędzy tkanką tłuszczową – układem hormonalnym – wzrastaniem liniowych wymiarów ciała u dziewcząt. Ponadto zostaną wykonane badania składu ciała u dziewcząt w wieku przedpokwitaniowym oraz spisane pomiary wysokości ciała wykonane podczas badań bilansowych. Posłużą one do wykreślenia krzywych wzrastania liniowych wymiarów ciała, wytyczenia momentu rozpoczęcia skoku pokwitaniowego i szczytu tego skoku, a następnie do oceny zależności pomiędzy tymi parametrami a zawartością tkanki tłuszczowej w organizmie badanych dziewcząt.

Praca badawcza.

TEMAT
Przebieg dojrzewania u dzieci urodzonych ze zbyt małą masą ciała w stosunku do wieku płodowego

CEL PRACY
Celem pracy będzie próba przedstawienia wzorców wzrastania liniowych wymiarów ciała w okresie dojrzewania i tempa pokwitania u dzieci urodzonych jako zbyt małe w stosunku do wieku płodowego (SGA, Small for Gestational Age)

Praca przeglądowa

TEMAT
Mikroflora jelitowa i jej wpływ na stan biologiczny człowieka w okresie dzieciństwa

CEL PRACY
Celem pracy będzie opis zależności pomiędzy mikroflorą jelitową a funkcjonowaniem wybranych układów u dzieci.

Praca przeglądowa.

TEMAT
BMI a wiek wystąpienia pubarche i skoku pokwitaniowego u chłopców

CEL PRACY
Celem pracy będzie ocena składu ciała, w tym nawodnienia, osób z niewydolnością nerek i jej wpływ na wartości ciśnienia tętniczego.

TEMAT
Wpływ BMI w okresie przedpokwitaniowym na wiek wystąpienia skoku pokwitaniowego i ostateczną wysokość ciała u chłopców

CEL PRACY
Celem pracy będzie próba opisu zależności pomiędzy składem ciała, w tym poziomem tkanki tłuszczowej i poziomem nawodnienia a stopniem nawilżenia i elastyczności skóry u kobiet.

TEMAT
Identyfikacja czynników infekcyjnych w łożyskach kobiet z wewnątrzmacicznym ograniczeniem wzrastania płodu (IUGR)

CEL PRACY
Celem pracy jest identyfikacja czynników infekcyjnych, wirusowych jak i bakteryjnych, które współtowarzyszą wewnątrzmacicznemu ograniczeniu wzrastania płodu poprzez zastosowanie metod detekcji DNA patogenów (PCR) oraz metod proteomicznych (MS/MS).

TEMAT
Prewencja i leczenie zakażeń ludzkim wirusem zapalenia wątroby typu C (HCV)

CEL PRACY
Celem pracy jest charakterystyka wirusa HCV (morfologia wirionu, budowa genomu, cykl replikacyjny, indukcja procesu nowotworowego) oraz przedstawienie strategii prewencyjnych obejmujących zakażenia HCV (opracowanie szczepionek, ich skuteczność, zaawansowanie badań nad szczepionkami). Dodatkowym celem będzie opisanie dostępnych metod leczenia zakażeń wirusem HCV (leki na rynku, ich sposób działania na poziomie komórki, skuteczność).

TEMAT
Przygotowanie konstruktów genetycznych umożliwiających podwyższoną ekspresję białek hybrydowych mCherry-pro-IGF-1b oraz mCherry-hEb w ludzkich liniach stabilnych U2-OS do badań interaktomu jąderkowej izoformy insulinopodobnego czynnika wzrostu IGF-1B

CEL PRACY
Cel pracy obejmuje przygotowanie konstruktów genetycznych, które umożliwią otrzymanie stablinych linii ludzkich U2-OS z podwyższoną ekspresją białka IGF-1b. Cele szczegółowe obejmują: amplifikację fragmentów cDNA kodujących ludzki IGF-1b oraz ludzki peptyd Eb metodą PCR, klonowanie pozycyjne do wektora pmCherry-C1 za pomocą enzymów restrykcyjnych SalI oraz BamHI, ostatecznie werfikację konstuktu przez sekwencjonowanie DNA.

TEMAT
Ekspresja genu kodującego alergenne białko Art v 3 w kwiatostanach bylicy pospolitej (Artemisia vulgaris) na obszarach o zróżnicowanym stopniu urbanizacji.

CEL PRACY
Celem pracy licencjackiej jest zbadanie poziomu ekspresji genu kodującego alergenne białko Art v 3 w kwiatostanach zabierających dojrzałe ziarna pyłku bylicy pospolitej (Artemisia vulgaris), zebranych z terenów Poznania i okolic o różnym stopniu urbanizacji, z wykorzystaniem metody PCR w czasie rzeczywistym.

TEMAT
Ekspresja genu kodującego alergenne białko Art v 4 w kwiatostanach bylicy pospolitej (Artemisia vulgaris) na obszarach o zróżnicowanym stopniu urbanizacji.

CEL PRACY
Celem pracy licencjackiej jest zbadanie poziomu ekspresji genu kodującego alergenne białko Art v 4 w kwiatostanach zabierających dojrzałe ziarna pyłku bylicy pospolitej (Artemisia vulgaris), zebranych z terenów Poznania i okolic o różnym stopniu urbanizacji, z wykorzystaniem metody PCR w czasie rzeczywistym.

TEMAT
Wpływ traumatycznego stresu na rozwój funkcji neuropoznawczych u dzieci w wieku szkolnym

CEL PRACY
Ocena wpływu traumatycznych wydarzeń życiowych na poziom funkcji neuropoznawczych takich jak uwaga i kontrola impulsów u dzieci w wieku szkolnym.

TEMAT
Epigenetyczne mechanizmy w etiologii ADHD

CEL PRACY
Ocena udziału interakcji między genami i środowiskiem w warunkowaniu nadpobudliwości psychoruchowej z deficytem uwagi (ADHD)

TEMAT
Ocena wpływu traumy wczesnodziecięcej na rozwój biologiczny i zdrowie człowieka

CEL PRACY
Ocena wpływu traumy wczesnodziecięcej na rozwój biologiczny (w tym wzrastanie, przyrosty masy ciała, proporcje wagowo-wzrostowe) i zdrowie człowieka (somatyczne i psychiczne)

TEMAT
Biologiczne korelaty zespołu stresu pourazowego

CEL PRACY
Ocena biologicznych uwarunkowań zespołu stresu pourazowego (PTSD) oraz neurologicznych i neurohormonalnych konsekwencji PTSD.

TEMAT
Mating preferences of female guppies from experimental lines selected for male colouration.

CEL PRACY
Celem jest sprawdzenie czy samice gupika z linii które przez sześć pokoleń były selekcjonowane w kierunku dużej lub małej powierzchni karotenoidowych plam samców, będą wykazywać skorelowaną odpowiedź na selekcję w postaci preferencji dla samców o stopniu rozbudowania ornamentowych plam podobnym jak w liniach selekcyjnych z których pochodzą. Test ten pozwoli odpowiedzieć na pytanie czy plamy samców ewoluują pod presją doboru płciowego zgodnie z modelem "dobrych genów" czy też "atrakcyjnych synów".

TEMAT
Rola białka FIP1(V) w regulacji poliadenylacji w A. thaliana

CEL PRACY
Badania nad czynnikiem poliadenylacyjnym FIPS1(V) poszerzą naszą wiedzę na temat samego procesu poliadenylacji. Pozwoli to na lepsze zrozumienie przebiegu procesu zakończenia transkrypcji u roślin. Zdobytą wiedzę będzie można wykorzystać do zaprojektowania nowych terminatorów transkrypcji używanych w konstruktach genetycznych w biotechnologii roślin. Dodatkowo, manipulacje procesem poliadenylacji będzie można wykorzystać do modyfikacji roślin użytkowych w celu poprawienia ich odporności na infekcje wirusowe (np. Tobacco mosaic virus - wirus ten znalazł sposób uniknięcia dodania ogona poli(A) podczas terminacji transkrypcji, co zwiększa jego stabilność w komórce roślinnej).

TEMAT
Rola białka CFI59 w regulacji poliadenylacji u A. thaliana

CEL PRACY
CEL PRACY: Badania nad czynnikiem poliadenylacyjnym CFI59 poszerzą naszą wiedzę na temat samego procesu poliadenylacji. Pozwoli to na lepsze zrozumienie przebiegu procesu zakończenia transkrypcji u roślin. Zdobytą wiedzę będzie można wykorzystać do zaprojektowania nowych terminatorów transkrypcji używanych w konstruktach genetycznych w biotechnologii roślin. Dodatkowo, manipulacje procesem poliadenylacji będzie można wykorzystać do modyfikacji roślin użytkowych w celu poprawienia ich odporności na infekcje wirusowe (np. Tobacco mosaic virus - wirus ten znalazł sposób uniknięcia dodania ogona poli(A) podczas terminacji transkrypcji, co zwiększa jego stabilność w komórce roślinnej).

TEMAT
Wpływ czynników środowiska na stopień degradacji DNA w prekolumbijskich ludzkich materiałach szkieletowych z Ameryki Południowej

CEL PRACY
Celem pracy jest ocena wpływu czynników środowiska tj. temperatura na stopień degradacji DNA w szkieletach ludzkich z okresu prekolumbijskiego z południowego Peru. W ramach pracy przeprowadzona będzie izolacja DNA, a następnie skonstruowane zostaną biblioteki genomowe. Jakość bibliotek zostanie oceniona metodą bioanalizy i qPCR. Biblioteki zostaną zsekwencjonowane wysokoprzepustowo. Na podstawie uzyskanych danych tj. ilość endogennego DNA, długość fragmentów oraz pokrycie genomu, oceniony zostanie stopień degradacji DNA w analizowanych próbach. Informacje te będą miały znaczenie przy planowaniu kolejnych analiz aDNA z materiałów szkieletowych, które pochodzą z badanego obszaru klimatycznego.

TEMAT
Analiza zagrożeń orzesznicy Muscardinus avellanarius L. na wybranych stanowiskach gatunku w Wielkopolsce

CEL PRACY
Ocena wszelkiego rodzaju zagrożeń dla orzesznicy, która w Wielkopolsce występuje jedynie na kilku stanowiskach. Podstawowym czynnikiem zagrażającym istnieniu ostatnich populacji gatunku jest działalność gospodarcza człowieka. Współczesne badania wskazują też na ocieplenie klimatu jako zagrożenie dla orzesznicy w Europie Środkowej. Analizy zagrożeń student dokona na podstawie badań terenowych i analizy informacji uzyskanych z nadleśnictw.

TEMAT
Współczesne metody stosowane w ochronie nietoperzy

CEL PRACY
Celem jest posumowanie stosowanych na świecie metod ochrony nietoperzy. W pracy uwaga będzie zwrócona głównie na sposoby ochrony gatunków europejskich. Uwypuklone zostaną trudności związane z ochroną tej grupy zwierząt, co związane jest z koniecznością użycia zupełnie innych metod w okresie lata, zimy i okresów przejściowych wiosną i jesienią.

TEMAT
Nietoperze jako źródło czynników chorobotwórczych dla ludzi.

CEL PRACY
Nietoperze są zwierzętami występującymi na wszystkich kontynentach poza Antarktydą. Bardzo często znajdują kryjówki ludzkich domostwach oraz są aktywne w miejscach, gdzie przebywają, pracują i odpoczywają ludzie. Ponieważ drogi ludzi i nietoperzy stosunkowo często się krzyżują, to np. możliwość bolesnego pogryzienia lub zarażenia się chorobą jest dość duża, W pracy zostaną przeanalizowane, i usystematyzowane pod kątem stopnia zagrożenia, różne rodzaje niebezpieczeństw jakie spotykają ludzi ze strony nietoperzy.

TEMAT
Związek między elementami składu ciała a wizerunkiem własnego ciała w różnych fazach cyklu menstruacyjnego u dziewcząt w wieku 16-18 lat

CEL PRACY
Celem pracy będzie ocena związku między obrazem ciała a fazą cyklu menstruacyjnego (wyznaczaną za pomocą zmierzonego poziomu hormonów: progesteronu i estradiolu) i składem ciała u dziewcząt w wieku 16-18 lat. Badania będą miały charakter przekrojowy, będą polegać na jednokrotnym pomiarze: cech antropometrycznych takich jak wysokość ciała, masa ciała, obwód pasa i bioder, analizie składu ciała za pomocą analizatora składu ciała wykorzystującego metodę bioimpedancji elektrycznej oraz na samodzielnym pobraniu śliny przez osobę badaną w celu określenia stężenia steroidów płciowych (estradiolu i progesteronu) za pomocą metody immunoenzymatycznej. Obraz ciała zostanie określony przy użyciu kwestionariusza wizualnego: Figure Rating Scale (FRS). Badanie jednej osoby powinno potrwać ok. 8 minut. Na przeprowadzenie badań posiadamy zgodę bioetycznej.

TEMAT
Związek między elementami składu ciała a wizerunkiem własnego ciała w różnych fazach cyklu menstruacyjnego u dziewcząt w wieku 16-18 lat

CEL PRACY
Celem pracy będzie ocena związku między obrazem ciała a fazą cyklu menstruacyjnego (wyznaczaną za pomocą zmierzonego poziomu steroidów płciowych (progesteronu i estradiolu) i składem ciała u dziewcząt w wieku 16-18 lat. Badania będą miały charakter przekrojowy, Będą polegać na jednokrotnym pomiarze: cech antropometrycznych takich jak wysokość ciała, masa ciała, obwód pasa i bioder, analizie składu ciała za pomocą analizatora składu ciała wykorzystującego metodę bioimpedancji elektrycznej oraz samodzielnym pobraniu przez osobę badaną śliny w celu określenia stężenia estradiolu i progesteronu za pomocą metody immunoenzymatycznej. Obraz ciała zostanie określony przy użyciu kwestionariusza wizualnego: Figure Rating Scale (FRS). Badanie jednej osoby powinno potrwać ok. 8 minut. Na planowane badania jest zgoda komisji bioetycznej.

TEMAT
Zależność między składowymi masy ciała a lękiem uogólnionym i psychospołecznym stresem w okresie adolescencji

CEL PRACY
Praca będzie miała charakter badawczy. Jej celem będzie ocena związku między psychospołecznym dystresem i lękiem w okresie adolescencji a składowymi masy ciała. Badania będą polegały na pomiarach antropometrycznych, pomiarze składu ciała metodą bioimpedancji elektrycznej oraz pomiarze odczuwanego stresu i lęku uogólnionego za pomocą trzech kwestionariuszy: Skala Odczuwanego Stresu PSS-14, PHQ-9 do pomiaru objawów depresyjnych, Kwestionariusz Lęku Uogólnionego GAD oraz termometr dystresu.

TEMAT
Rola białka VDAC3 w patogenezie chorób człowieka

CEL PRACY
Przegląd aktualnej wiedzy naukowej na temat roli białka VDAC3 w patogenezie różnych chorób człowieka. Praca będzie skoncentrowana przede wszystkim na dostępnych źródłach literaturowych dotyczących biologicznej roli białka VDAC3, jak również na patofizjologii człowieka spowodowanej mutacjami w genie kodującym białko VDAC3.

TEMAT
Analiza funkcjonalna mutacji w genie kodującym ludzkie białko VDAC3.

CEL PRACY
Heterologiczna ekspresja genu kodującego ludzkie białko VDAC3 (wariant dziki i zmutowany) w komórkach drożdży Saccharomyces cerevisiae, w celu zbadania wpływu mutacji na funkcjonowanie izolowanych mitochondriów.

TEMAT
Mutacje w genie VDAC3 u pacjentów z małą ruchliwością plemników.

CEL PRACY
Poszukiwanie mutacji genu VDAC3 w obrębie egzonów 3 - 9 w mało ruchliwych plemnikach. Hipoteza zakłada, że mutacje te mogą być przyczyną asthenozoospermii.

TEMAT
Warianty splicingowe genu VDAC3 w plemnikach człowieka.

CEL PRACY
Identyfikacja wariantów splicingowych genu VDAC3 w plemnikach człowieka.

TEMAT
Functional associations discerned from dynamic OMICs datasets via multivariate Granger causality

CEL PRACY
Establishing functional associations between molecules exploiting OMICs datasets is a central research theme in bioinformatics. If dynamic information is available, cause-effect relationships can be discerned exploiting the temporal order of level changes of molecules. In a previous study [1], we examined the relationships between metabolites and transcripts in Yeast exposed to elevated or lowered temperatures and made use of the concept of Granger causality (GC). GC exploits dynamic aspects in the context of prediction of future states, and in its original form, examines pairs of molecules to determine the mutual information (correlation) with regard to cause-effect relationships.
In the planned Bachelor thesis, we wish to further explore the GC-approach by including concepts such as multivariate GC and conditional GC. It is hoped that this will allow us to more directly discern the multivariate nature of molecular interactions (pathways, multiple transcription factors targeting a gene etc.) than by using a pairwise approach. GC-variants can also be compared to other multivariate regression techniques (e.g. Ridge regression/ lasso). Expanding the GC approach to include more variables requires long time series data to be available as more parameters need to be determined. Long time series in Arabidopsis that include metabolites and transcripts [2] will serve as a suitable dataset. In addition, public domain databases hold many more suitable datasets that can be analyzed.
1. Walther et al. (2010) Metabolic pathway relationships revealed by an integrative analysis of the transcriptional and metabolic temperature stress-response dynamics in yeast. OMICS 14: 261-271
2. Caldana et al (2011) High-density kinetic analysis of the metabolomic and transcriptomic response of Arabidopsis to eight environmental conditions. Plant J 67, 869-884

TEMAT
Otrzymanie roślin transgenicznych Arabidopsis thaliana pozwalających na analizę lokalizacji i dynamiki subkomórkowej białek Whirly.

CEL PRACY
Celem pracy jest przygotowanie konstrukcji genetycznych pozwalających na ekspresję białek Whirly w fuzji z fluorescencyjnymi białkami fotokonwertowalnymi w roślinach A. thaliana. Otrzymane konstrukcje genetyczne będą wprowadzane do roślin a wyselekcjonowane mutanty zostaną poddane analizie w mikroskopie konfokalnym.

TEMAT
Otrzymanie konstrukcji konstrukcji genetycznych pozwalających na ekspresję białka Whirly3 w fuzji z białkami fluorescencyjnymi w protoplastach Arabidopsis thaliana.

CEL PRACY
Celem pracy jest przygotowanie konstrukcji genetycznych pozwalających na ekspresję białka Whirly3 w fuzji z białkami fluorescencyjnymi w protoplastach A. thaliana. Lokalizacja subkomórkowa otrzymanych białek fuzyjnych będzie określana w protoplastach metodami mikroskopii konfokalnej.

TEMAT
Otrzymanie konstrukcji genetycznych pozwalających na ekspresję białka Whirly2 w fuzji z białkami fluorescencyjnymi w protoplastach Arabidopsis thaliana.

CEL PRACY
Celem pracy jest przygotowanie konstrukcji genetycznych pozwalających na ekspresję białka Whirly2 w fuzji z białkami fluorescencyjnymi w protoplastach A. thaliana. Lokalizacja subkomórkowa otrzymanych białek fuzyjnych będzie określana w protoplastach metodami mikroskopii konfokalnej.

TEMAT
Otrzymanie konstrukcji genetycznych pozwalających na ekspresję białka Whirly1 w fuzji z białkami fluorescencyjnymi w protoplastach Arabidopsis thaliana.

CEL PRACY
Celem pracy jest przygotowanie konstrukcji genetycznych pozwalających na ekspresję białka Whirly1 w fuzji z białkami fluorescencyjnymi w protoplastach Arabidopsis thaliana. Lokalizacja subkomórkowa otrzymanych białek fuzyjnych będzie określana w protoplastach metodami mikroskopii konfokalnej.

TEMAT
Przygotowanie konstrukcji genetycznych do nadekspresji białek GRP2 i GRP4 w roślinach Arabidopsis thaliana

CEL PRACY
Celem pracy licencjackiej jest przygotowanie konstrukcji genetycznych do nadekspresji białek GRP2 i GRP3 z kalafiora w roślinach Arabidopsis thaliana. Sekwencje kodujące białek GRP2 i GRP3 zostaną wklonowane do wektorów binarnych pozwalających na ekspresję białek w fuzji z GFP w bakteriach i roślinach. Wektory te zostaną wprowadzone do roślin Arabidopsis thaliana metodą floral dip. Białka GRP2 i GRP3 są zaangażowane w odpowiedź roślin na zmiany temperatury, zaś poznanie ich funkcji może przyczynić się do uzyskania roślin uprawnych odpornych na stres związany ze zmianami temperatury.

TEMAT
Aktywność białek Cry1Ab i Cry1B wobec larw Cydia pomonella.

CEL PRACY
Celem pracy jest ocena interakcji zachodzących pomiędzy różnymi toksynami krystalicznymi zmieszanymi w różnych proporcjach i wybór mieszanin o najwyższej aktywności insektycydowej do przygotowania nowego środka ochrony roślin.

TEMAT
Wpływ kormoranów (Phalacrocorax carbo L.) na zanieczyszczenie gleb na obszarze kolonii lęgowych i noclegowisk.

CEL PRACY
Celem pracy jest oszacowanie wpywu kormoranów na transfer nutrientów, metali cięzkich i innych wybranych pierwiastków chemicznych pomiędzy ekosystemem wodnym i lądowym. Oszacowany będzie także dyspersja ornitogennych ładunków pierwiatków w glebach pod koloniami oraz trwałość zanieczyszczenia gleb.

TEMAT
Zanieczyszczenie termiczne wód jezior konińskich i jego wpływ na biocenozy wodne.

CEL PRACY
Celem pracy jest synteza materiałów związnych z oddziaływaniem zrzutów wód podgrzanych na termikę systemu jezior konińskich. Zebrane zostaną dane literaturowe dotyczące oddziaływania podwyższonej termiki na biocenozy występujące w tych ekosystemach. Przeprowadzony będzie także krótki eksperyment terenowy wykazujący róznice w zagęszczeniu i aktywności dziesięcionogów w wodach o odmiennej termice.

TEMAT
Konsekwencje ekologiczne obecności obcych gatunków ryb w ekosystemach wodnych Polski

CEL PRACY
Celem pracy jest przegląd danych literaturowych dotyczących występowania obcych i inwazyjnych gatunków ryb w ekosystemach wodnych Polski oraz opisanie wpływu tych gatunków na rodzimą ichtiofaunę oraz inne komponenty ekosystemów wodnych.

TEMAT
Reakcja zespołów bezkręgowców dennych na zabiegi rekultywacyjne w jeziorach.

CEL PRACY
Celem pracy jest analiza reakcji - zmian jakościowych i ilościowych - makrozoobentosu na prowadzone w jeziorach zabiegi rekultywacyjne. Hipoteza badawcza zakłada , że dawkowanie różnorodnych koagulantów i innych substancji chemicznych do jezior, w trakcie ich rekultywacji, zmienia liczebność i skład taksonomiczny bezkręgowców zamieszkujących strefę denną zbiornika.

TEMAT
Wpływ zabiegów rekultywacyjnych na zmiany ilościowe i jakościowe bezkręgowców dennych w Jeziorze Raczyńskim

CEL PRACY
Celem pracy jest analiza sezonowej i przestrzennej zmienności zespołów bezkręgowców dennych zasiedlających eutroficzne jezioro Raczyńskie. W związku z tym, że jezioro poddawane jest zabiegom chemicznej rekultywacji , przeprowadzona zostanie analiza oddziaływania koagulantów na strukturę makrozoobentosu.

TEMAT
Koncentracja pierwiastków śladowych w tkankach dorsza (Gadus morhua L.) z Morza Bałtyckiego.

CEL PRACY
Celem pracy jest ocena kumulacji wybranych pierwiastków śladowych w tkance mięśniowej i wątrobie bałtyckiej populacji dorsza. Na podstawie analizy ryb należących do różnych klas wiekowych i porównania z danymi literaturowymi rozpoznana zostanie bioakumulacja i biomagnifikacja wybranych pierwiastków w badanych tkankach ryb.

TEMAT
Ocena jakości wód zbiornika Rusałka w Poznaniu w kontekście jego rekultywacji

CEL PRACY
Celem pracy jest ocena w ujęciu sezonowym właściwości fizycznych i chemicznych wody w zbiorniku zaporowym Rusałka i porównanie tych właściwości z danymi z lat ubiegłych. pozwoli to na ocenę skuteczności zabiegów rekultywacyjnych prowadzonych na tym ekosystemie.

TEMAT
Jakość wód Zbiornika Maltańskiego w Poznaniu w sezonie jesienno -zimowym.

CEL PRACY
Celem pracy jest poznanie zmienności wybranych parametrów fizycznych i chemicznych wody zbiornika zaporowego Malta. Badania prowadzone będą w sezonie jesienno-wiosennym.

TEMAT
Ocena jakości wód jeziora Błędno wraz ze wskazaniem potencjalnych metod działań ochronnych i rekultywacyjnych.

CEL PRACY
Celem pracy jest określenie jakości wód i statusu troficznego troficznego jeziora Błędno a także wskazanie (na podstawie zebranych danych) optymalnych działań ochronnych ograniczających negatywne oddziaływania ze strony obszaru zlewniowego. Zaproponowane zostaną także działania rekultywacyjne które doprowadzić maja do poprawy stanu ekosystemu jeziora

TEMAT
Wpływ wybranych farmaceutyków na skorupiaki wodne (Crustacea)

CEL PRACY
Głównym celem pracy jest zbadanie czy wybrane grupy farmaceutyków, notowanych w naturalnych ekosystemach wodnych mogą zmieniać przeżywalność bezkręgowców wodnych. Zanieczyszczenie wód farmaceutykami wydaje się mieć potencjalnie poważne konsekwencje dla funkcjonowania ekosystemów. Choć obecnie leki spotyka się w wodach powierzchniowych w niewielkich stężeniach, to istnieją doniesienia, iż mogą one oddziaływać na w zróżnicowany sposób na organizmy roślinne i zwierzęce. Przetestowane zostaną leki z grupy niesteroidowych leków przeciwzapalnych, farmaceutyki przeciwepileptyczne oraz paracetamol (lek przeciwbólowy). Podjęta zostanie próba określenia stężenia śmiertelnego LC 50 badanych leków w stosunku do wybranego taksonu bezkręgowca wodnego.

TEMAT
Weryfikacja sekwencji aminokwasowej mitochondrialnej oksydazy alternatywnej niesporczaka Hypsibius exemplaris.

CEL PRACY
Dostępna w bazie NCBI sekwencja aminokwasowa przewidywana dla mitochondrialnej oksydazy alternatywnej niesporczaka Hypsibius exemplaris (dawniej Hypsibius dujardini) pozbawiona jest przewidywanego dla tego białka u zwierząt (w tym dwóch innych gatunków niesporczaków) motywu końca C. W związku z tym celem pracy jest stwierdzenie czy brak ten jest skutkiem błędu w analizie danych genomowych/transkryptomicznych.

TEMAT
Określenie liczby kopii mitochondrialnego DNA u niesporczaka Hypsibius exemplaris w warunkach uruchamiających anhydrobiozę

CEL PRACY
Dostępne dane sugerują możliwy udział mitochondriów w przebiegu anhydrobiozy u niesporczaków. Ponieważ liczbę kopii mitochondrialnego DNA (mtDNA) uznaje się za czynnik o fundamentalnym znaczeniu dla funkcjonowania mitochondriów, celem niniejszej pracy jest oszacowanie liczby kopii mtDNA u osobników aktywnych i podlegających dehyratacji, uruchamiającej proces anhydrobiozy. Gatunkiem badanych w ramach pracy będzie Hypsibius exemplaris (dawniej Hypsibius dujardini), w przypadku którego anhydrobioza przebiega z niewielką wydajnością.

TEMAT
Wyznaczenie liczby kopii mitochondrialnego DNA u niesporczaków z rodzaju Paramacrobiotus, w stanie aktywnym i po wprowadzeniu w anhydrobiozę

CEL PRACY
Dostępne dane sugerują możliwy udział mitochondriów w przebiegu anhydrobiozy u niesporczaków. Ponieważ liczbę kopii mitochondrialnego DNA (mtDNA) uznaje się za czynnik o fundamentalnym znaczeniu dla funkcjonowania mitochondriów, celem niniejszej pracy jest oszacowanie liczby kopii mtDNA u osobników aktywnych i podlegających anhydrobiozie. Badania planuje się przeprowadzić na gatunkach z rodzaju Paramacrobiotus, w przypadku których anhydrobioza przebiega z różną wydajnością.

TEMAT
Oporność nowotworów na chemio- i radioterapię w świetle najnowszych badań

CEL PRACY
Chemioterapia i radioterapia są najczęstszym sposobem walki z nowotworami. Niestety skuteczność leczenia za ich pomocą często jest niska, a sama terapia niesie ze sobą wiele skutków ubocznych. Poważnym problemem jest oporność komórek nowotworowych na leki chemioterapeutyczne i promieniowanie jonizujące. Może to być oporność pierwotna ( wyjściowa) lub nabyta w trakcie leczenia, o różnym mechanizmie przeciwdziałania terapii. Walka z powyższym zjawiskiem stanowi ogromne wyzwanie w biologii i medycynie. Poszukuje się czynników uwrażliwiających komórki nowotworowe, znoszących mechanizmy oporności.
Celem obecnej pracy jest:
1. ukazanie dotychczasowych danych na temat historii chemio- i radioterapii nowotworów, mechanizmów i rodzajów oporności komórek nowotworowych na chemioterapię i radioterapię,
2. przedstawienie w świetle najnowszych danych literaturowych wpływu chemioterapii/radioterapii na wykształcanie potencjału metastatycznego i oporności komórek nowotworowych, aktualnych trendów zwiększania biodostępności leków przeciwnowotworowych na poziomie komórki (w oparciu o nanonośniki leków), sposobów przewidywania odpowiedzi pacjentów na chemio- i/lub radioterapię, m.in. z wykorzystaniem tzw. markerów epigenetycznych.

TEMAT
Ocena immunohistochemiczna ekspresji liganda receptora PD-1 w raku niedrobnokomórkowym płuc

CEL PRACY
PD-L1 to ligand receptora PD-1 obecnego w błonie komórkowej limfocytów oraz monocytów/makrofagów. W warunkach fizjologicznych układ PD-1/PD-L1 odgrywa rolę w dojrzewaniu limfocytów w grasicy, Uczestniczy także w tzw. tolerancji płodowej. PD-L1 jest zatem czynnikiem regulującym/hamującym aktywność komórek układu immunologicznego. Wysoka ekspresja PD-L1 jest charakterystyczna dla komórek niektórych typów nowotworów. Należą do nich m.in. komórki czerniaka oraz komórki niektórych typów raka płuc, Efektem oddziaływania PD-L1 w tych warunkach jest immunosupresja i dalszy rozwój nowotworu. O wadze badań skupionych na działaniu PD-L1 świadczy m.in. przyznana w obecnym roku Nagroda Nobla w dziedzinie medycyny i fizjologii. Dzięki pracom Allisona i Honjo dziś znane są leki blokujące PD-L1 lub PD-1.
Celem pracy obejmującej część teoretyczną i praktyczną jest:
1. przedstawienie stanu wiedzy o wpływie PD-L1 na rozwój nowotworów, o terapiach skupionych na blokowaniu PD-L 1 oraz jego celu komórkowego (tzw. terapie immunologicznych punktów kontrolnych).
2. ocena immunohistochemiczna ekspresji PD-L1 w archiwizowanym materiale tkankowym pochodzącym od pacjentów z rakiem niedrobnokomórkowym płuc ( typ płaskonabłonkowy, typ gruczolakorak, typ mieszany) - miejsce wykonania doświadczeń pracownia Katedry Patomorfologii Klinicznej Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu.
W ramach części doświadczalnej studentka wykona preparaty histologiczne, reakcje immunohistochemiczne (IHC), porównanie ilościowe wyników reakcji IHC w 3 badanych typach raka płuc.
Uzyskane wyniki pozwolą określić "status" badanych typów raka płuc pod względem zdolności komórek nowotworowych do produkcji PD-L1.

TEMAT
Występowanie integronów u gronkowców wyhodowanych z materiałów pobranych z gniazd bociana białego z terenu Hiszpanii

CEL PRACY
Celem pracy jest molekularna charakterystyka mobilnych integronów - markerów wielolekooporności - u bakterii z rodzaju Staphylococcus występujących w gniazdach bociana białego w Hiszpanii. Zadania realizowana w ramach ww. tematu są częścią badań nad występowaniem integronów u bakterii obecnych w gniazdach z różną zawartością odpadów antropogenicznych.

TEMAT
Integrony oporności bakterii z rodzaju Staphylococcus wyosobnionych z próbek materiałów pobranych od piskląt bociana białego z terenu Hiszpanii

CEL PRACY
Celem pracy jest molekularna charakterystyka mobilnych integronów - markerów wielolekooporności - u bakterii z rodzaju Staphylococcus występujących w jamie dziobowej i w kloace piskląt bociana białego w Hiszpanii. Zadania realizowane w ramach ww. tematu są częścią badań nad występowaniem integronów u bakterii obecnych na jajach, u piskląt oraz w gniazdach z różną zawartością odpadów antropogenicznych.

TEMAT
Charakterystyka integronów obecnych w genomach bakterii Staphyloccus spp. występujących w gniazdach bociana białego na terenie Polski

CEL PRACY
Celem pracy jest molekularna charakterystyka mobilnych integronów - markerów wielolekooporności - u bakterii z rodzaju Staphylococcus występujących w gniazdach bociana białego na terenie Polski. Zadania realizowane w ramach ww. tematu są częścią badań nad występowaniem integronów u bakterii obecnych na jajach, u piskląt oraz w gniazdach z różną zawartością odpadów antropogenicznych.

TEMAT
Mobilne integrony bakterii z rzędu Enterobacterales obecnych w gniazdach bociana białego na terenie Hiszpanii

CEL PRACY
Celem pracy jest molekularna charakterystyka mobilnych integronów - markerów wielolekooporności - u pałeczek Enterobacteriaceae występujących w gniazdach bociana białego w Hiszpanii. Zadania realizowane w ramach ww. tematu są częścią badań nad występowaniem integronów u bakterii obecnych na jajach, u piskląt oraz w gniazdach z różną zawartością odpadów antropogenicznych.

TEMAT
Tempo zasiedlania i struktura zbiorowisk okrzemek fitobentosowych na różnych rodzajach tkanin.

CEL PRACY
Poznanie różnorodności gatunkowej okrzemek bentosowych zasiedlających różne tkaniny zanurzone w wodzie śródleśnego stawu.

TEMAT
Modelowanie wpływu oscylacji wielkości populacji na gromadzenie się szkodliwych mutacji

CEL PRACY
Celem pracy będzie teoretyczne zbadanie wpływu zmian wielkości populacji na gromadzenie się szkodliwych mutacji. Wiele gatunków charakteryzuje się oscylacjami w wielkości populacji, związanymi z sezonowością, czy, w dłuższej skali czasowej, ze zmiennością klimatu. Wpływ takich oscylacji na potencjał adptacyjny i ilość szkodliwych mutacji gromadzących się w populacji jest nieznany. Student ekplorować będzie to zagadnienie poprzez symulacje komputerowe. Badana będzie dynamika mutacji w zależności od współczynnika selekcji, dominacji i scenariusza demograficznego. Symulacje komputerowe prowadzone będą za pomocą programu SLiM oraz dedykowanego do tego typu analiz języka programowania (Eidos).

TEMAT
Mechanizmy środowiskowe i ewolucyjne wpływające na wariancję tempa rozwoju piskląt.

CEL PRACY
Celem pracy jest odpowiedz na pytanie: co wywołuje wariancję tempa rozwoju piskląt w populacjach tego samego gatunku jak również pomiędzy gatunkami. Ostatnie podsumowanie tego zagadnienia zostało przeprowadzone w roku 1998 (Brzek P. 1998: Factor affecting growth rates in birds). Jednak od tego czasu pojawiły się liczne badania opisujące różne (fizjologiczne, behawioralne, ewolucyjne) mechanizmy determinujące tempo rozwoju. Z metodycznego punktu widzenia, zadanie polega na wykonaniu meta-analizy zjawiska, opierając się na danych literaturowych.

TEMAT
Wstępne efekty rekultywacji Jeziora Raczyńskiego na podstawie wybranych wskaźników jakości wody

CEL PRACY
Celem pracy będzie ocena efektów prowadzonych w 2018 roku w Jeziorze Raczyńskim zabiegów rekultywacyjnych. Ponadto określona zostanie jakość wód tego jeziora w okresie jesienno-zimowym a uzyskane wyniki będą porównane z danymi z lat wcześniejszych.

TEMAT
Analiza stopnia starcia zębów mlecznych jako wyznacznika wprowadzania pokarmów stałych do diety dziecka w średniowieczu.

CEL PRACY
Zmiana sposobu żywienia dziecka, polegająca na przejściu z pokarmu matki na pokarm stały, ma poważne konsekwencje zdrowotne i przez to jest często analizowana w naukach medycznych i antropologicznych. W ostatnim czasie pojawiła się w antropologii biologicznej nowa propozycja metodyczna dotycząca tego zjawiska, bazująca na stopniu starcia zębów mlecznych. Celem pracy jest analiza zastosowania tej metody u dzieci pochodzących z populacji średniowiecznych.

TEMAT
Wymiary kanału kręgowego i kręgów jako wyznaczniki zakłóceń rozwojowych człowieka.

CEL PRACY
Celem pracy jest przedstawienie możliwości i ograniczeń poznawczych metody oceny zaburzeń rozwojowych osobnika na podstawie cech metrycznych kanału kręgowego i kręgów - praca ma stanowić przegląd literatury.

TEMAT
Rola antropologa w identyfikacji zmarłego osobnika i ustalaniu okoliczności jego śmierci.

CEL PRACY
Tematyka pracy została zaproponowana przez studentkę. Praca ma charakter przeglądu literatury na temat antropologicznych analiz szczątków ludzkich dla potrzeb kryminalistyki, koncentrujących się na identyfikacji osobnika - określaniu jego profilu biologicznego i unikalnych cech biologicznych oraz na ustalaniu przyczyny i okoliczności zgonu, w tym czasu i przyczyny zgonu.

TEMAT
Oddziaływanie arsenu na wybrane układy organizmu ludzkiego.

CEL PRACY
Zapoznanie z toksycznymi skutkami zanieczyszczenia środowiska i zatrucia organizmu ludzkiego jednym z najbardziej toksycznych pierwiastków śladowych jakim jest arsen. Pierwiastek ten powoduje każdego roku kilka tysięcy zgonów rocznie. Poznanie skutków zatrucia As uświadamia jasno konieczność oczyszczania środowiska. z metali i metaloidów.

TEMAT
Aktywność cytotoksyczna pęcherzyków błony zewnętrznej wytwarzanych przez Enterobacter spp. i Pseudomonas aeruginosa

CEL PRACY
Pęcherzyki błony zewnętrznej wydzielane przez niektóre bakterie Gram-ujemne biorą udział w dostarczaniu czynników wirulencji do komórek eukariotycznych. Celem pracy jest określenie zdolności oportunistycznych patogenów do sekrecji pęcherzyków i ich oddziaływania z komórkami nabłonkowymi z linii HeLa. Badania będą wykonane na szczepach z rodzajów Enterobacter i Pseudomonas wyizolowanych z próbek materiałów pochodzących od pacjentów leczonych w szpitalach w Poznaniu.

TEMAT
Wpływ krótkołańcuchowych kwasów tłuszczowych na aktywność cytotoksyczną wybranych pałeczek Gram-ujemnych w stosunku do komórek endotelialnych E.A.hy926

CEL PRACY
Krótkołańcuchowe kwasy tłuszczowe (KKT) są końcowym produktem fermentacji prowadzonej przez mikrobiotę jelita. Nie poznano dokładnie mechanizmów oddziaływania KKT na wirulencję bakterii. Celem pracy jest określenie wpływu tych związków na aktywność cytotoksyczną oportunistycznych patogenów w stosunku do komórek endotelialnych E.A.hy926. Badania będą wykonane na szczepach z rodzajów Acinetobacter, Enterobacter i Pseudomonas wyizolowanych z próbek materiałów pochodzących od pacjentów leczonych w szpitalach w Poznaniu.

TEMAT
Rangr: an R package for mechanistic, spatially explicit simulation of species range dynamics

CEL PRACY
In the information age, increasing volumes of biodiversity databases pose a great analytical challenge. Data originating from monitoring schemes are especially demanding, as they vary both in space and time and involve multiple visits to study sites, hundreds of recorded species and many observers. This multivariate structure, complicated hierarchy and noisy observational process make this kind of ecological information particularly error-prone. Despite these shortcomings, a lot of research has been devoted to using this kind of data to infer a wide range of ecological phenomena, including habitat selection or biotic interaction studies. However, due to uncertainties associated with the input data, the reliability of these analyses remains largely unknown. This study aims to build a set of tools (in the form of R package) for simulating a species range dynamics. By generating species distributions from known demographic parameters, the efficiency of different algorithms and analytical approaches could be objectively evaluated.

TEMAT
Factors influencing breeding success in the wood warbler Phylloscopus sibilatrix - implications for species conservation

CEL PRACY
The wood warbler Phylloscopus sibilatrix is a small migratory insectivorous songbird which breeds in deciduous forests in temperate Europe and nests on the ground. There has been a general decline of the species since the ‘80s and, although there is no evidence that such decline is driven by processes operating on the breeding grounds, the preservation of its primary reproductive habitat is a key to its conservation. The aim of the study is to investigate factors (such as habitat type or predation pressure) influencing the breeding success of the wood warbler.

TEMAT
Stan populacji, zagrożenia i ochrona pokląskwy (Saxicola rubetra)

CEL PRACY
W pracy zostanie przedstawiona biologia, rozmieszczenie i trendy liczebności pokląskwy (Saxicola rubetra) w oparciu o dane literaturowe oraz informacje pochodzące z monitoringu przyrody i projektów „citizen science”. Przedstawione zostanie również aktualne rozmieszczenie gatunku w ujęciu krajowym i lokalnym. Dodatkowo przeprowadzone zostaną badania terenowe, których celem będzie poznanie wybiórczości gatunku w skali mikro-siedliskowej.

TEMAT
Rola mikoryzy w rolnictwie ekologicznym i konwencjonalnym

CEL PRACY
W ostatnich latach w badaniach środowiskowych jak i rolniczych coraz większego znaczenia nabiera gromadzenie informacji na temat wpływu systemów produkcji (konwencjonalny, ekologiczny) na jakość plonu i jakość gleby. Postępująca degradacja środowiska, będąca efektem intensyfikacja rolnictwa, stosowania pestycydów a także nadmiaru nawozów mineralnych, spowodowała potrzebę poszukiwania alternatywnych metod ochrony upraw. Powszechnym, aczkolwiek pomijanym zjawiskiem w uprawie konwencjonalnej roślin jest występowanie w środowisku glebowym pożytecznych układów mikroorganizmów wpływających nie tylko na odżywianie roślin ale również na jakość środowiska glebowego. W procesie tym biorą czynny udział grzyby mikoryzowe. Celem pracy będzie porównanie efektywności grzybów mikoryzowych w uprawie jak i ochronie roślin oraz wpływ grzybni na jakość gleby w warunkach gospodarowania zgodnego z regułami rolnictwa ekologicznego w porównaniu z rolnictwem konwencjonalnym.

TEMAT
Interakcja między owadem a grzybem (Botanophila-Epichloë) w populacji dzikiej trawy Holcus lanatus: rozwój i przeżywalność jaj muchówek w zależności od wielkości grzyba i obecności hiperpasożyta

CEL PRACY
1. Opisanie przebiegu ontogenezy muchówek (Botanophila) związanych z grzybem, workowcem Epichloe clarkii.
2. Ocena przeżywalności jaj i larw w zależności od wielkości stadium płciowego grzyba i obecności hiperpasożyta grzybowego Clonostachys epichloe.
Badania wykonywane w terenie i laboratorium

TEMAT
Funkcjonowanie sieci rośliny klonalnej jastrzębca (Hieracium pilosella L.):
testowanie hipotezy o przepływie zasobów między rametami

CEL PRACY
Celem pracy jest sprawdzenie czy odkryty przepływ zasobów (asymilaty od ramety potomnej do macierzystej, a woda i nutrienty odwrotnie) u kilku roślin klonalnych występuje także w kolistej sieci jastrzębca (Hieracium pilosella L.).
Badania będą prowadzone w fitotronie. W eksperymencie czynnikiem manipulowanym będzie dostępność do światła.

TEMAT
Znaczenie neutrofilowych sieci NET w rozwoju chorób autoimmunologicznych

CEL PRACY
Neutrofilowe sieci NET należą do ważnych elementów układu immunologicznego. Jednak w niektórych sytuacjach patologicznych mogą one być przyczyną rozwoju chorób o podłożu autoimmunologicznym. Cele pracy, która ma charakter przeglądowy jest dokonanie podsumowania najnowszych danych literaturowych omawiających to zagadnienie.

TEMAT
Wskaźnik wtórnej proporcji płci jako biologiczny wyznacznik stresu środowiskowego w populacjach z XIX i początku XX wieku

CEL PRACY
Celem pracy jest zbadanie, czy ekspozycja kobiet w ciąży na stres środowiskowy, wywołany warunkami ekologicznymi (w tym klimatycznymi), ekonomicznymi i społecznymi w Wielkopolsce w XIX i początku XX wieku wpłynęła na obniżenie wskaźnika wtórnej proporcji płci.

TEMAT
Liczba potomstwa i jego płeć jako czynniki wpływające na długość życia matki w populacjach okresu industrializacji (XIX-początek XX wieku)

CEL PRACY
Reprodukcja jest energetycznie i fizjologicznie kosztownym procesem, w szczególności rozwój prenatalny płci męskiej.
W pracy zostanie zbadane, czy liczba dzieci urodzonych przez kobiety w ciągu ich okresu reprodukcji oraz płeć potomstwa wpływały negatywnie na długość życia matek, czy może matczyne czynniki społeczno-ekonomiczne osłabiały ich działanie.

TEMAT
Wpływ późnego rodzicielstwa na stan biologiczny potomstwa w Polsce w XIX i początku XX wieku

CEL PRACY
Celem pracy jest zweryfikowanie czy w XIX i na początku XX wieku późne rodzicielstwo wpłynęło negatywnie na stan biologiczny potomstwa: obniżało prawdopodobieństwo dożycia do końca okresu niemowlęcego, początku reprodukcji, wczesnej dorosłości, oraz wpłynęło na długość życia dzieci.

TEMAT
Wysokość, masa ciała oraz wskaźnik BMI Polaków urodzonych przed w trakcie i po zakończeniu I wojny światowej.

CEL PRACY
Celem pracy jest ocena wielkości ciała dorosłych Polaków (wysokości, masy ciała i wskaźnika masy ciała) urodzonych przed wybuchem I wojny światowej, w jej trakcie i po zakończeniu. W pracy zostanie uchwycony wpływ zróżnicowanych warunków społeczno-ekonomicznych na wymienione zmienne biologiczne, szczególnie zaś warunków życia w krytycznych momentach ontogenezy (ciążą i wczesne dzieciństwo) na wysokość ciała.

TEMAT
Ekstremalne temperatury otoczenia jako czynnik ryzyka umieralności w populacji Wielkopolan w XIX i na początku XX wieku

CEL PRACY
Celem pracy jest zbadanie wpływu stresu wywołanego ekstremalnymi temperaturami (falami ciepła i zimna) na stan biologiczny populacji Wielkopolan. Stan biologiczny zostanie oceniony na podstawie analizy jednej ze składowych dynamiki biologicznej populacji ludzkich, jaką jest umieralność.

TEMAT
Ekologiczne i kulturowe uwarunkowania nadumieralności dorosłych mężczyzn w Wielkopolsce w XIX i na początku XX wieku

CEL PRACY
Nadumieralność mężczyzn jest cechą współczesnych dynamiczne rozwijających się społeczeństw. Celem pracy jest zbadanie na przykładzie populacji Wielkopolan, czy zjawisko to istniało już w okresie industrializacji, oraz uchwycenie jego jego różnorakich uwarunkowań ekologicznych i kulturowych.

TEMAT
Opracowanie systemu in vitro do ubikwitynacji białek roślinnych

CEL PRACY
przygotowanie konstruktów wektorowych do nadekspresji białek systemu

TEMAT
Fauna wybranych rodzin Prostigmata (Acari; Acariformes) na terenie zachodniej części Kampusu Morasko UAM

CEL PRACY
Stworzenie listy gatunków wybranych rodzin Prostigmata (Acari; Acariformes) na terenie zachodniej części Kampusu Morasko UAM w Poznaniu na tle zróżnicowania głównych typów siedlisk.

TEMAT
Dupleksy RNA:RNA transkryptów genów ENOPH1 i HNRNPDL w nowotworach piersi i zdrowych tkankach

CEL PRACY
Celem pracy jest zbadanie czy transkrypty genów ENOPH1 i HNRNPDL tworzą dupleksy RNA:RNA zarówno w tkankach zdrowych i nowotworowych oraz zbadanie czy tworzenie dupleksu może mieć znaczenie regulatorowe.

TEMAT
Regulatorowa rola dupleksów RNA:RNA w gruczolakoraku płuc.

CEL PRACY
Celem projektu jest zbadanie czy transkrypty genów, które wykorzystują nakładające się miejsca startu transkrypcji w gruczolakoraku płuc tworzą dupleksy RNA:RNA oraz czy tworzenie tych dupleków ma znaczenie regulatorowe i jest istotne dla przeżywalności komórek rakowych.

TEMAT
Transkrypcyjna aktywność retrogenów w oponiaku psa

CEL PRACY
Celem pracy jest identyfikacja, na podstawie danych RNA-seq, retrogenów o zmienionym profilu ekspresji w przypadku oponiaka u psa.

TEMAT
Aktywność transkrypcyjna retrogenów w nowotworze sutka psa.

CEL PRACY
Celem pracy jest identyfikacja retrogenów, na podstawie analizy danych RNA-seq, które zmieniły poziom ekspresji w przypadku nowotworu sutka u psa.

TEMAT
Wykorzystanie alternatywnych promotorów genów nakładających się na końcach 5` w kontekście poziomu ekspresji i tworzenia dupleksów RNA:RNA

CEL PRACY
Celem pracy jest zbadanie na ile wykorzystywanie alternatywnych promotorów, prowadzących do nakładania się genów na końcach 5`, wynika z potrzeby zwiększenia poziomu ekspresji (poprzez wykorzystanie silniejszego i/lub dodatkowego promotora), a na ile może wynikać z funkcji regulatorowych związanych z tworzeniem dupleksów RNA:RNA

TEMAT
Retrogeny jako gąbki mikroRNA

CEL PRACY
Celem pracy jest sprawdzenie metodami bioinformatycznymi czy i w jakim stopniu duplikaty genów, powstałe w wyniku retropozycji, mogą regulować ekspresję swoich genów rodzicielskich poprzez `wyłapywanie` cząsteczek mikroRNA regulujących ekspresję protoplastów.

TEMAT
Wykorzystanie sekwenatora Oxford Nanopore i podejść metagenomicznych w terenowych badaniach przenoszenia pasożytów pomiędzy ludźmi i szympansami.

CEL PRACY
Celem pracy jest teoretyczne opracowanie metod dotychczas stosowanych w badaniach przenoszenia pasożytów pomiędzy człowiekiem i szympansem; zebranie informacji dotyczących metod metagenomicznych i wykorzystywanych narzędziach bioinformatycznych w badaniach przenoszenia pasożytów oraz opracowanie materiału odnoszącego się do możliwości wykorzystania sekwenatora MinION w terenie (w stacji badawczej) w celu badania przenoszenia pasożytów i monitorowania mikrobiomu populacji szympansów żyjących na wolności.

TEMAT
Wyrażanie się materiału genetycznego poprzez modyfikację chromatyny w środowiskowo uwarunkowanym modelu mysim pozabezpiecznego stylu przywiązania.

CEL PRACY
Celem projektu jest stworzenie modelu mysiego pozabezpiecznego stylu przywiązania, wiązanego z szeregiem zaburzeń osobowości u ludzi. Pozabezpieczny styl więzi, potwierdzony za pomocą szeregu testów behawioralnych, będzie następnie weryfikowany za pomocą technik molekularnych ewaluujących poziom metylacji, jak i strukturę chromatyny w różnych obszarch mózgu, między innymi hipokampie oraz ciele migdałowatym.

TEMAT
Wykorzystanie indukowanych pluripotentnych komórek macierzystych w biotechnologii i medycynie

CEL PRACY
Celem pracy jest przegląd aktualnej literatury dotyczącej wykorzystania indukowanych pluripotentych komórek macierzystych w medycynie i biotechnologii.

TEMAT
Polifenole z Cladophora glomerata (L.) Kutzing jako związki o działaniu hamującym rozwój sinic.

CEL PRACY
Makroglony wydzielają do swojego otoczenia różne związki chemiczne, takie jak kwasy tłuszczowe, polisacharydy, polifenole, drobne peptydy i aminokwasy oraz egzotoksyny. Wydzielanie metabolitów wtórnych do środowiska przez Cladophora glomerata ma działanie hamujące na bakterie i fitoplankton. Celem niniejszej pracy magisterskiej będzie sprawdzenie, podczas eksperymentów laboratoryjnych, wpływu polifenoli wydzielanych przez C. glomerata na pięć taksonów sinic : Planktothrix, Limnothrix, Anabaena/Dolichospermum, Microcystis i Aphanizomenon. Wyniki badań pozwolą na określenie potencjału allelopatycznego C. glomerata i wskazanie możliwości zastosowania wydzielanych polifenoli jako algicydów hamujących rozwój sinic.

TEMAT
Warunki środowiskowe determinujące inwazje kleszcza gołębiego Argas reflexus (Argasidae) na terenie miasta Poznania

CEL PRACY
rozpoznanie czynników odpowiedzialnych za okresowe inwazje kleszcza gołębiego w warunkach miasta Poznania oraz sposoby zapobiegania i ograniczania tych zdarzeń

TEMAT
Metody ochrony człowieka i zwierząt domowych przed kleszczami Ixodidae

CEL PRACY
Przegląd najbardziej skutecznych sposobów aktywnej profilaktyki człowieka i zwierząt domowych (m.in. psów i kotów) przed kontaktem z kleszczami; metody ograniczenia ich zagęszczenia i występowania.

TEMAT
Występowanie integronów u bakterii z rodzaju Staphylococcus wyhodowanych z próbek pobranych od piskląt bociana białego z terenu Polski

CEL PRACY
Celem pracy jest oznaczenie częstości występowania i i molekularna charakterystyka mobilnych integronów - markerów wielolekooporności - u gronkowców wyizolowanych z kloaki i jamy dziobowej piskląt bociana białego. Zadania realizowane w ramach ww. tematu są częścią badań nad występowaniem integronów u bakterii obecnych na jajach, u piskląt oraz w gniazdach z różną zawartością odpadów antropogenicznych.

TEMAT
Charakterystyka integronów obecnych w genomach pałeczek Enterobacteriaceae wyizolowanych z powierzchni jaj bociana białego

CEL PRACY
Celem pracy jest oznaczenie klasy i molekularna charakterystyka integronów oporności u opornych na sulfametoksazol pałeczek Enterobacteriaceae wyhodowanych z powierzchni jaj bociana białego z gniazd w Polsce i Hiszpanii. Zadania realizowane w ramach ww. tematu są częścią badań nad występowaniem integronów u bakterii obecnych na jajach, u piskląt oraz w gniazdach z różną zawartością odpadów antropogenicznych.

TEMAT
Genetyczne determinanty wielooporności bakterii z grupy coli wyhodowanych z próbek materiałów pobranych od piskląt bociana białego

CEL PRACY
Celem pracy jest oznaczenie struktury integronów oporności u bakterii z grupy coli wyizolowanych z kloaki i jamy dziobowej piskląt bociana białego na terenie Polski. Zadania realizowane w ramach ww. tematu są częścią badań nad występowaniem integronów u bakterii obecnych na jajach, u piskląt oraz w gniazdach z różną zawartością odpadów antropogenicznych

TEMAT
Kasety genowe integronów pałeczek Enterobacterales występujących w gniazdach bociana białego na terenie Polski

CEL PRACY
Celem pracy jest molekularna charakterystyka integronów oporności obecnych u opornych na sulfametoksazol bakterii grupy coli wyizolowanych z gniazd bociana białego w Polsce. Zadania realizowane w ramach ww. tematu są częścią badań nad występowaniem integronów u bakterii obecnych na jajach, u piskląt oraz w gniazdach z różną zawartością odpadów antropogenicznych.

TEMAT
Rozwój woreczka zalążkowego Capsella bursa-pastoris L. u roślin pochodzących ze stanowisk odległych geograficznie i kwitnących w różnym czasie.

CEL PRACY
Przeprowadzenie porównawczej analizy embriologicznej w materiałach zebranych z dwóch lokalizacji w Polsce (Poznań, Rogów) i jednej w Obwodzie Archangielskim, w Rosji (Krassnaya Gorka, Rejon Piniegski). Ze względu na różnice w czasie trwania sezonu wegetacyjnego w ww. lokalizacjach możliwe jest pojawienie się różnych typów rozwojowych woreczka zalążkowego w materiale badawczym. Problem zmienności w rozwoju woreczka zalążkowego jest mało poznany.

TEMAT
Potencjał morfogenny organów juwenilnych Salix viminalis L. w kulturach in vitro.

CEL PRACY
Próba stworzenia systemu regeneracji de novo roślin Salix viminalis L. dla celów biotechnologicznych. Obiekt badań jest fitoremediantem i roślina energetyczną. Do tej pory u tego gatunku możliwa jest regeneracja tylko z istniejących merystemów pędowych (rozwój natywny). Indukowana regeneracja de novo otworzyłaby nowe pola zastosowań, np. w mutagenezie, zmienności somaklonalnej i poliploidyzacji.

TEMAT
Analiza mechanizmu oddziaływania syntetycznych pochodnych graminy na erytrocyty ludzkie w warunkach stresu oksydacyjnego

CEL PRACY
Celem pracy jest ocena potencjału przeciwutleniającego wybranych syntetycznych pochodnych alkaloidu indolowego graminy oraz ich wpływu na ludzkie erytrocyty w warunkach stresu oksydacyjnego generowanych różnymi induktorami. Pochodne graminy zostały zsyntetyzowane i scharakteryzowane pod względem strukturalnym przez zespół pani prof. Beaty Jasiewicz z Wydziału Chemii UAM. Cel pracy będzie realizowany dzięki kilku zadaniom badawczym: (1) analiza właściwości chemicznych cząsteczek i ich biodostępności w programie MOLINSPIRATION, (2) ocena właściwości przeciwrodnikowych, chelatujących Fe2+ oraz redukcyjnych, (3) ocena właściwości hemoprotekcyjnych w testach przyżyciowych z sondami fluorescencyjnymi redoks oraz z wykorzystaniem analiz biomarkerów stresu oksydacyjnego. W badaniach będą stosowane metody spektrofotometryczne, cytometrii przepływowej, techniki mikroskopowe (świetlna i/lub elektronowa skaningowa, konfokalna), bioinformatyczne oraz analiza statystyczna. Stawiamy hipotezę, że celowane modyfikacje strukturalne natywnej graminy, przyczynią się do uzyskania nowych związków o pożądanych właściwościach cytoprotekcyjnych i zaproponujemy molekularny mechanizm ich działania na poziomie komórkowym. Badania będą finansowane z grantu NCN OPUS14 (2017/27/B/ST4/02494).

TEMAT
Ocena funkcjonalności sieci zadrzewień pasowych w Lednickim Parku Krajobrazowym na potrzeby świadczeń ekosystemów

CEL PRACY
Zadrzewienia pasowe jako nieleśne skupiska drzew odgrywają kluczową rolę w ekologii krajobrazów otwartych. W celu właściwego zarządzania nimi istotne jest poznanie, między innymi, ich układu przestrzennego, a z drugiej strony zdefiniowanie tzw. potrzeb zadrzewieniowych na badanym terenie. Celem pracy jest określenie funkcjonalności sieci zadrzewień istniejącej i projektowanej, mierzalnej przy użyciu metodologii świadczeń ekosystemowych.

TEMAT
Kierunki i tempo ewolucji biokulturowej człowieka współczesnego.

CEL PRACY
Celem pracy jest przegląd literatury i wypracowanie własnego stanowiska w sprawie dyskusji, którą w literaturze przedmiotu wywołała opinia Davida Attenborough. We wrześniu 2013 roku Sir David Attenborough, w wywiadzie dla Radia Times stwierdził: „Ludzie przestali ewoluować w sensie biologicznym i są jedynym gatunkiem, który położył kres doborowi naturalnemu z własnej woli. Stało się tak w momencie, w którym zaczęliśmy utrzymać przy życiu 95-99% dzieci, które się rodzą. Przestaliśmy podlegać procesowi naturalnej selekcji. Odpór tej opinii dał John Hawkes (University of Wisconsin, J. F. Crow Institute for the Study of Evolution), stwierdzając: "Mówienie iż selekcja naturalna nie działa jest lekceważące wobec szybkiej ewolucji człowieka w ciągu ostatnich 10000 lat. Ludzie, którzy mówią o zatrzymaniu procesu naturalnej selekcji zapominają o większości świata i koncentrują się na społeczeństwach wysoko rozwiniętych, tak jakby ewolucja biologiczna dotyczyła lub nie, jedynie wybranej części cywilizacji ludzkiej.” Wydaje się, że niezależnie od stanowiska obu stron sporu, nasza dalsza ewolucja (jej kierunek i tempo) będzie zależała od tego, czy jesteśmy w stanie z powodzeniem dostosować się do przyszłego stresu środowiskowego, wykorzystując zarówno bufor kulturowy, technologiczny, jak i własną fizjologię. Praca licencjacka może stanowić jeden z wielu głosów w toczącej się obecnie dyskusji, jak również doskonale przygotować licencjata do wykonania pracy eksperymentalnej z zakresu biologii ewolucyjnej na poziomie magisterskim.

TEMAT
Przejście demograficzne i jego skutki biologiczne w różnych populacjach ludzkich.

CEL PRACY
Dynamicznie zmieniająca się sytuacja demograficzna we współczesnym świecie skłania do spojrzenia na przejście demograficzne i jego fazy, w nowym świetle. Szczególnie istotny wydaje się wpływ zróżnicowania ruchu naturalnego i wędrówkowego, w kolejnych fazach przejścia demograficznego, na biologię populacji ludzkich. Na podstawie danych literaturowych możemy oceniać ten wpływ, zarówno w ujęciu historycznym, jak i współcześnie, w populacjach będących na różnych etapach rozwoju technologiczno-organizacyjnego. Celem pracy będzie synteza dostępnej literatury pod kątem odpowiedzi na przykładowe pytania, które już stawiali sobie liczni autorzy, jednak próby odpowiedzi były zazwyczaj niepełne i zależały od tego, jak dokładnym i obszernym materiałem dysponowali. Na tle wyników dyskutowanych w literaturze przedmiotu, część z tych pytań nadal pozostaje aktualna i warto się nad nimi zastanowić. Szczególnie interesujący wydaje się wpływ zjawisk demograficznych na trendy sekularne cech biologicznych (wysokości i masy ciała). Dla przykładu: Czy trend sekularny wysokości ciała był w II połowie XIX wieku zjawiskiem powszechnym i dotyczył wszystkich krajów europejskich ? Czy do wywołania kierunkowych zmian w budowie morfologicznej, wystarcza uogólniona poprawa warunków życia i czy jedynie na tym zjawisku opiera się zróżnicowanie dynamiki trendu ? Czy, aby trend sekularny się ujawnił, konieczne jest wystąpienie zjawisk demograficznych podobnych do tych, które towarzyszyły rewolucji przemysłowej ? W końcu, czy rejestrowano lub rejestruje się w badaniach europejskich i światowych działanie niespecyficznych czynników, które mogą towarzyszyć przemianom demograficznym i jednocześnie uruchamiać kierunkowe zmiany, w osiąganych wartościach cech biologicznych ? Podjęcie próby odpowiedzi na powyższe pytania, może stanowić główny cel pracy i jednocześnie stać się przyczynkiem do lepszego poznania zależności pomiędzy wskaźnikami demograficznymi i biologią populacji ludzkich.

TEMAT
Rola mechanizmów epigenetycznych w badaniach, diagnostyce i terapii chorób nowotworowych

CEL PRACY
Niezwykle istotne w badaniach, diagnostyce i terapii chorób nowotworowych, okazały się odkrycia dotyczące procesów epigenetycznych oraz ich zaangażowania w procesy regulacji tkankowo-specyficznej ekspresji genów i różnicowania się komórek. Zjawiska epigenetyczne, a szczególnie epigenetyczna regulacja funkcjonalnej ekspresji genu, stały się w ostatnich latach jednym z najważniejszych obiektów badań, również w odniesieniu do patogenezy nowotworów. Celem pracy jest przegląd literatury oraz przedstawienie obecnego stanu wiedzy w zakresie molekularnego podłoża zmian epigenetycznych w nowotworach, jak i perspektywicznych możliwości wykorzystania tych zjawisk w profilaktyce i terapii. Wydaje się, że dynamicznie rozwijająca się epigenetyka oraz coraz większa wiedza, dotycząca modyfikacji epigenetycznych, będzie w niedalekiej przyszłości kluczem do poznania mechanizmów powstawania różnych nowotworów, umożliwi stratyfikację ryzyka ich wystąpienia i progresji, a także stanie się przyczyną wprowadzania szeregu innowacyjnych procedur terapeutycznych na poziomie genomu. W związku z tym podjęcie takiej tematyki oraz synteza pewnego obszaru wiedzy z pogranicza biologii i medycyny, staje się bardzo wskazana w kontekście dalszej, coraz ściślejszej współpracy biologów człowieka, biologów molekularnych oraz biotechnologów z grupami badawczymi, działającymi w obszarze medycyny eksperymentalnej i klinicznej.

TEMAT
Dobór naturalny i mutacje, czy środowisko i kultura – który z „napędów" ewolucji człowieka ma współcześnie większą moc ?

CEL PRACY
Celem pracy jest przegląd literatury pod kątem obecnego i potencjalnego wykorzystania różnych narzędzi bioinformatycznych do szacowania nasilenia procesów ewolucyjnych, w skali populacyjnej (makro). Postęp w dziedzinie bioinformatyki i badań genomicznych coraz częściej umożliwia przekładanie wyników otrzymywanych podczas pracy na bardzo dużych zbiorach danych, na poziom osobniczy i daje możliwość praktycznego ich wykorzystania np. w opracowywaniu terapii spersonalizowanych lub przygotowywaniu leków celowanych. Jednocześnie pojawia się szereg nowych pytań, które mogą zostać postawione w niniejszej pracy: czy fakt, że potrafimy ocenić częstość występowania polimorfizmów pojedynczych nukleotydów może nam ułatwić odpowiedź na pytanie, czy ewolucyjnie zwiększamy swój poziom dostosowania - biologicznego fitness i czy możemy w ten sposób mierzyć sposobność do działania selekcji naturalnej ? Jaki udział w kształtowaniu puli genowej populacji ma środowisko wzrastania i rozwoju oraz kultura ? A może w końcu, dysponując współczesną wiedzą na temat mechanizmów epigenetycznych oraz bazami danych bioinformatycznych, stawianie pytania, co jest ważniejsze geny, czy środowisko, stało się bezzasadne ? Stawianie takich i innych pytań oraz próba udzielenia na nie odpowiedzi, staje się z pewnością motorem napędowym współczesnej genomiki, biologii molekularnej, genetyki populacyjnej człowieka i szeregu innych dyscyplin wzajemnie siebie wspomagających. Coraz częściej ich zdobycze są wdrażane w praktyce i nawet jeśli nie dowiemy się, który z "napędów" ewolucji jest ważniejszy, bo być może mają równą wagę, to na pewno owe wdrożenia powodują, że jako gatunek biologiczny jesteśmy najlepiej przystosowani do świata w którym żyjemy.

TEMAT
Program Codone Code Aligner – jego funkcje i wykorzystanie do analizy sekwencji DNA

CEL PRACY
Tematem pracy będzie opis funkcjonowania jednego z programów służących analizie plików .abi z sekwenatora ABI Prism 3710xl w porównaniu z innymi programami (np. Sequencher) . W części praktycznej poddane zostaną pliki uzyskane w wyniku sekwencjonowania fragmentu jednego z chloroplastowych genów ycf1 wykorzystywanego jako proponowany „barkod DNA” dla roślin lądowych. Dong W. et al. 2015. Ycf1, the most promising plastid DNA barcode of land plants. Scientific Reports 5: 8348

TEMAT
The contributions of the conserved residues in the N-terminal and C-terminal domains of the ProQ protein to its binding to regulatory RNAs in Escherichia coli

CEL PRACY
Celem pracy jest poznanie znaczenia zachowanych ewolucyjnie reszt aminokwasowych o ładunku dodatnim znajdujących się w domenach N-końcowej oraz C-końcowej białka opiekuńczego ProQ dla jego oddziaływań z cząsteczkami RNA. W pracy zostaną przygotowane mutanty białka ProQ z substytucjami reszty argininy 58 w domenie N-końcowej oraz reszty lizyny 195 w domenie C-końcowej. Konstrukty te zostaną użyte do zbadania udziału tych reszt w stabilności wiązania białka ProQ z cząsteczkami regulatorowych RNA, co pozwoli na lepsze zrozumienie mechanizmu rozpoznawania cząsteczek RNA przez białko ProQ.

TEMAT
Klonowanie i nadekspresja białka ProQ z bakterii Escherichia coli, zawierającego mutacje konserwowanych reszt aminokwasowych lizyny 35 i i argininy 62

CEL PRACY
Celem pracy jest otrzymanie mutantów białka ProQ z E.coli, w których zachowane ewolucyjnie reszty dodatnio naładowanych aminokwasów lizyny w pozycji 35 oraz argininy w pozycji 62 zostaną zastąpione resztami alaniny. Mutanty te posłużą do zbadania znaczenia tych reszt aminokwasowych dla oddziaływania białka ProQ z cząsteczkami RNA.

2019-01-07, 17:56:48
KIEROWNIK JEDNOSTKI: re: uzylbym slowa konserwowany zamiast konserwatywny, wtedy tytul brzmialby:
"Klonowanie i nadekspresja białka ProQ z bakterii Escherichia coli, zawierającego mutacje konserwowanych reszt aminokwasowych lizyny K35 i i argininy R62."

2019-01-05, 23:00:22
RADA: opiniowanie - Biotechnology: Rada programowa zaleca następujące brzmienie tematu pracy "Klonowanie i nadekspresja białka ProQ z bakterii Escherichia coli, zawierającego mutacje konserwatywnych reszt aminokwasowych lizyny K35 i i argininy R62.
Proszę o zatwierdzenie zmodyfikowanego tematu przez kierownika zakładu.
Agnieszka Ludwików

TEMAT
Występowanie Wolbachia sp. i Cardinium sp. u wybranych gatunków mechowców (Acari: Oribatida) w populacjach zróżnicowanych pod względem siedliskowym.

CEL PRACY
Określenie występowania endosymbiotycznych bakterii dziedziczonych w linii matczynej u wybranych gatunków mechowców (Oribatida) z populacji w okolicach Poznania i Szczecina. Badania będą obejmowały wykrycie oraz identyfikację drobnoustrojów wewnątrzkomórkowych w/w roztoczy techniką PCR.

TEMAT
Analiza składu wydzielin gruczołów opistonotalnych u wybranych gatunków roztoczy z grupy Oribatida

CEL PRACY
Zbadanie składu chemicznego substancji produkowanych przez parzyste gruczoły znajdujące się na notogaster u nimf i osobników dorosłych mechowca Zygoribatula exilis. Rola tych struktur i wydzielin, które produkują, jest u mechowców niejasna - prawdopodobnie pełnią one rolę obronną odstraszając potencjalne drapieżniki. Analiza będzie przeprowadzana metodą chromatografii gazowej w Pracowni Spektrometrii Mas Wielkopolskiego Centrum Zaawansowanych Technologii.

TEMAT
Czynniki wpływające na rozpoczynanie chóru porannego ptaków tropikalnych lasów górskich Kamerunu

CEL PRACY
Celem pracy jest poznania czynników wpływających na czas rozpoczynania tzw. chóru porannego u ptaków na przykładzie zespołu zamieszkującego górskie lasy Kamerunu. Wczesne rozpoczynanie śpiewu o świcie ma kluczowe znaczenia dla ptaków i jest związane z obroną terytorium i wabieniem, stymulacją bądź pilnowaniem partnerki. Górskie lasy tropikalne stanową dość ekstremalne środowisko, w którym podjęcie aktywności głosowej po relatywnie chłodnej nocy, stanowi dogodny model do testowania potencjalnych ograniczeń kształtujących to zjawisko.

TEMAT
Struktura przestrzenna oraz zależności pomiędzy gatunkami roślinności wodnej w troficznie stabilnym choć poddanym presji antropogenicznej płytkowodnym jeziorze (Jezioro Jarosławieckie, Wielkopolski PN)

CEL PRACY
Analiza aktualnego (na rok 2018) składu gatunkowego i rozmieszczenia przestrzennego makrofitów wodnych Jeziora Jarosławieckiego w Wielkopolskim Parku Narodowym w świetle danych z wcześniejszych badań.
Analiza zależności pomiędzy gatunkami makrofitów w kontekście głębokości ich występowania.

TEMAT
Monitorowanie biogenezy mięśniowo-specyficznego mikroRNA-133b, z zastosowaniem sztucznego konstruktu do nadekspresji

CEL PRACY
Celem pracy jest zlokalizowanie miejsc regulatorowych odpowiedzialnych za biogenezę miR-133b i określenie efektywności powstawania tego miRNA w stosunku do miR-206, którego sekwencja zawarta jest w tym samym zgrupowaniu mikroRNA. miR-133b uczestniczy w proliferacji i wzroście komórek mięśniowych. Poznanie czynników wpływających na efektywność biogenezy tego mikroRNA jest kluczowe dla zaprojektowania specyficznych oligonukleotydów antysensowych, które zostaną wykorzystane do obniżenia poziomu pri-miR-133b.

TEMAT
Monitorowanie biogenezy mięśniowo-specyficznego miR-206 przy wykorzystaniu sztucznego konstruktu do nadekspresji

CEL PRACY
Celem pracy jest zbadanie wpływu na biogenezę otoczenia sekwencyjnego miR-206 i określenie efektywności powstawania tego miRNA w stosunku do miR-133b, którego sekwencja zawarta jest w tym samym zgrupowaniu mikroRNA. miR-206 jest eksprymowany wyłącznie w mięśniach szkieletowych i odgrywa ważną rolę w procesie różnicowania mioblastów. Poznanie czynników wpływających na efektywność biogenezy tego mikroRNA i jej zależność od ekspresji miR-133b jest kluczowe dla zaprojektowania narzędzi opartych na modyfikowanych kwasach nukleinowych, które posłużą do modulowania poziomu pri-miR-206.

TEMAT
Wpływ bakterii promujących wzrost Burkholderia phytofirmans PsJN na tolerancję i wydajność roślin rzepaku w procesie fitoekstrakcji metali śladowych

CEL PRACY
Gleby zanieczyszczone metalami stanowią duże zagrożenie dla otaczającego środowiska, jednym z wiodących trendów jest poszukiwanie atrakcyjnych ekonomicznie i przyjaznych dla środowiska rozwiązań technologicznych, ograniczających ich szkodliwy wpływ. Metoda fitoekstrakcji metali z gleb zanieczyszczonych jest znana od wielu lat. Początkowo, prowadzone badania koncentrowały się głównie na mechanizmach pobierania i akumulacji metali, obecnie prowadzi się szereg badań nad możliwością zwiększenia wydajności procesu fitoekstrakcji dzięki zastosowaniu jak najbardziej przyjaznych środowisku metod. Celem pracy było sprawdzenie czy i w jakim stopniu obecność bakterii promujących wzrost Burkholderia phytofirmans wpłynie na rozwój, tolerancje i potencjał fitoremediacyjny roślin rzepaku uprawianego z dodatkiem metali śladowych.

TEMAT
Zmiany w efektywności fitoremediacji metali śladowych [ Ni, Pb, Zn i Cd] przez rośliny Brassica napus w obecności bakterii probiotycznych

CEL PRACY
Celem pracy było sprawdzenie czy i w jakim stopniu obecność bakterii probiotycznych wpłynie na pobieranie i transport jonów Cd, Zn, Pb i Ni do części nadziemnych oraz na podstawową odpowiedz na stres metalami śladowymi u roślin Brassica napus.

TEMAT
Metody stosowane w nowoczesnych systemach do fenotypowania roślin

CEL PRACY
Przedstawienie oprzyrządowania systemów automatycznej uprawy roślin, aparatury służącej do nieinwazyjnej oceny fenotypowej oraz celów badawczych, którym mogą służyć systemy fenotypowania

TEMAT
Praktyczne wykorzystanie czynników integrujących oddziaływania sieciowe w środowisku roślinnym

CEL PRACY
Celem pracy jest charakterystyka czynników roślinnych (molekularnych i strukturalnych) oraz mikrobiologicznych (bakterie i grzyby glebowe), które sprzyjają tworzeniu zintegrowanych relacji sieciowych w praktyce rolniczej.

TEMAT
Komputerowa analiza obrazu jako narzędzie do oceny architektury i funkcjonalności systemu korzeniowego

CEL PRACY
Charakterystyka oprzyrządowania i oprogramowania służącego do oceny cech architektury korzeniowej. Przedstawienie cech funkcjonalności korzeni jako potencjalnych obiektów modyfikacji w celu uzyskania nowych odmian roślin uprawnych.

TEMAT
Spermidyna - nowy przełącznik metaboliczny starzenia liścia jęczmienia.

CEL PRACY
Celem pracy jest poznanie czy zmiana kierunku metabolizmu poliamin wpłynie na starzeniowo - zależne procesy remobilizacji i wejście liści w fazę śmierci. Zostanie to osiągnięte przez przygotowanie transgenicznych linii jęczmienia ze zmodyfikowanym metabolizmem spermidyny oraz ustalenie fenotypowych markerów faz przebiegu procesów anty- i pro-starzeniowych.

TEMAT
Otrzymanie mutantów delecyjnych ludzkiego białka Bend3 w prokariotycznym systemie ekspresyjnym

CEL PRACY
Celem pracy jest wykonanie konstruktów genetycznych kodujących fragmenty ludzkiego białka BEND3, które obejmować będą poszczególne domeny funkcjonalne tego białka. Otrzymane plazmidy zostaną następnie wykorzystane do produkcji mutantów delecyjnych BEND3 w prokariotycznym systemie ekspresyjnym i testów oddziaływań z wybranymi białkami.

TEMAT
The importance of Bend3 SUMOylation for its accumulation at sites of induced DNA damage

CEL PRACY
The aim of the work is to determine the effect of the sumoylation of Bend3 protein on its accumulation at DNA damage sites in human cell lines. The work will consist in receiving point mutants of the BEND3 protein, which will not be subjected to sumoylation. These mutants will then be used in BEND3 migration tests to sites of laser-induced DNA damage. The results obtained will provide new insights into how the BEND3 protein contributes to maintaining genome stability.

TEMAT
Poszukiwanie sekwencji docelowych regulowanych przez małe cząsteczki RNA pochodzące ze snoRNA SNORD104 w komórkach ludzkich

CEL PRACY
Celem pracy jest sprawdzenie poziomu transkryptów wytypowanych jako sekwencje docelowe regulowane przez małe cząsteczki RNA pochodzące ze snoRNA SNORD104. Użyjemy do tego celu techniki RT-PCR i RT-qPCR. W kolejnym etapie sprawdzimy poziom białka syntetyzowanego na matrycy danego transkryptu techniką Western blot.

TEMAT
Ekspresja U7 snRNA oraz białek kompleksu Histone Cleavage Complex (HCC) w proliferujących i zróżnicowanych komórkach ludzkiej linii neuroblastoma SH-SY5Y.
The expression of U7 snRNA and proteins of Histone Cleavage Complex (HCC) in proliferating and terminally differentatied human neuriblastoma cells SH-Sy5Y.

CEL PRACY
W terminalnie zróżnicowanych komórkach nerwowych poziom ekspresji genów histonów rdzeniowych jest bardzo niski, w porównaniu do komórek proliferujących, ulegających podziałom. Celem pracy jest sprawdzenie, czy w obu typach komórek występuje również zróżnowowanie w poziomie ekspresji czynników zaangażowanych w ekspresję genów histonowych: U7 snRNA i wybranych białek kompleksu HCC (Flash, symplekina, ZFP100, CstF64, CFmI68, SLBP, Lsm1o, Lsm11). Analizy przeprowadzimy z użyciem techniki RT-qPCR i Western blot.

TEMAT
Analiza oddziaływania białka hnRNP UL1 z cząsteczką U7 snRNA z zastosowaniem techniki immunoprecypitacji RNA (RIP).

CEL PRACY
Celem pracy jest sprawdzenie, która domena białka hnRNP UL1 oddziałuje z U7 snRNA oraz czy oddziaływanie to jest zależne od fazy cyklu komórkowego.

TEMAT
Wyprowadzenie stabilnych ludzkich linii komórkowych HeLa i SH-SY5Y z indukowaną nadekspresją białek Lsm10 i Lsm11 z użyciem systemu Flp-In T-REX.

CEL PRACY
Celem pracy jest przygotowanie wektora genetycznego do indukowanej syntezy dwóch białek, Lsm10 i Lsm11. Wektor ten posłuży następnie do transfekcji komórek ludzkich i wyprowadzenia linii ze stabilną, indukowaną nadekspresją. Wykorzystamy do tego celu system Flp-In T-REX.

TEMAT
Analiza wzajemnych oddziaływań cząsteczki U7 snRNA i białek hnRNP UL1 oraz FUS w jąderku komórkowym z użyciem technik mikroskopowych.
The analysis of mutual interactions of U7 snRNA, hnRNP UL1 and FUS in the nucleolus using microscopic techniques.

CEL PRACY
Celem pracy jest analiza, jak wzajemnie oddziałują ze sobą w jąderku komórkowych trzy czynniki - U7 snRNA i dwa białka: FUS i hnRNP UL1. Spróbujemy odpowiedzieć na pytanie, jaka jest kolejność pojawiania się w jąderku tych trzech czynników oraz czy ich wzajemne oddziaływanie zmienia się zależnie od fazy cyklu komórkowego.

TEMAT
Identyfikacja modyfikacji potranskrypcyjnych cząsteczki U7 snRNA w komórkach ludzkich
Identification of postranscriptional modifications of U7 snRNA in human cells

CEL PRACY
Celem pracy jest sprawdznie czy cząsteczka U7 snRNA podlega modyfikacjom potranskrypcyjnym, do których należa, między innymi, metylacja cytozyny i adenozyny. Użyjemy do tego celu techniki PCR po konwersji RNA z użyciem dwusiarczanu oraz immunoprecypitacji RNA (RIP) z użyciem przeciwciał skierowanych przeciwko metylowanym resztom adeninowym. Dodatkowo, oczyszczona cząsteczka U7 snRNA zostanie poddana analizie z użyciem spektrometri mas, by zidentyfikować inne typy modyfikacji potranskrypcyjnych.

TEMAT
Zastosowanie nieżelowych i żelowych metod proteomicznych w analizach biogenezy organelli roślin wyższych podczas warunków stresowych

CEL PRACY
Celem pracy o charakterze teoretycznym (przeglądowym) jest przedstawienie najważniejszych osiągnięć analiz proteomicznych organelli roślin wyższych, takich jak jądro komórkowe, mitochondria, czy plastydy. Materiał literaturowy będzie obejmował prace doświadczalne przede wszystkim z ostatnich 10-15 lat.. W pracy licencjackiej zostaną przedstawione wyniki uzyskane w ramach doświadczeń obejmujących m.in. techniki proteomiki żelowej; szczególny nacisk zostanie położony jednak na najnowsze wyniki uzyskane podczas analiz nieżelowych. W pracy przedstawione zostaną również różne zastosowania nowych podejść metodycznych w celu dokładniejszego przebadania złożoności proteomów organellowych w aspekcie tkankowym i rozwojowym w modelowych i niemodelowych gatunkach roślin. Zebrane zostaną również najnowsze dane odnośnie profilowania modyfikacji potranslacyjnych białek organellowych oraz dane poświęcone globalnym zmianom ilościowym i jakościowym w proteomach i kompleksomach organellowych podczas aklimatyzacji i deaklimatyzacji do różnorodnych warunków stresowych. Materiały z pracy zostaną wykorzystane podczas opracowywania publikacji przeglądowej w czasopiśmie o wysokim współczynniku oddziaływania.

TEMAT
Udział dehydryn i białek podobnych do dehydryn w biogenezie organelli podczas stresu abiotycznego

CEL PRACY
Celem pracy licencjackiej o charakterze przeglądowym (teoretycznym) będzie zebranie wszystkich dotychczasowych danych literaturowych dotyczących dehydryn i białek podobnych do dehydryn oddziałujących z wybranymi organellami (plastydy, mitochondria) w różnych liniach rozwojowych Eukaryota. Szczególny nacisk położony zostanie na ustalenie roli tych białek w funkcjonowaniu plastydów i mitochondriów roślin wyższych. Przedyskutowane zostaną również analizy strukturalne dehydryn w różnorodnych układach doświadczalnych. Zostaną również zamieszczone dane odnośnie zmian w akumulacji, lokalizacji suborganellowej oraz oddziaływaniach tych białek w aspekcie tkankowo-rozwojowym i w zależności od warunków środowiskowych. Przedstawione zostaną przede wszystkim dane z ostatnich 10 lat, które znacząco wzbogaciły naszą wiedzę odnośnie istotnej roli dehydryn w aklimatyzacji i deaklimatyzacji do różnorodnych warunków stresu abiotycznego. Zebrane wyniki zostaną w przyszłości wykorzystane podczas przygotowywania publikacji przeglądowej, opublikowanej w czasopiśmie o wysokim współczynniku oddziaływania.

TEMAT
Wizualizacja i interpretacja zależności przyrodniczych - analiza problemów uczniów szkół podstawowych i licealnych związanych z tworzeniem, interpretowaniem i wnioskowaniem opartym na wykresach w ramach nauczania biologii.

CEL PRACY
Celem pracy jest dokonanie analizy umiejętności, koncepcji i problemów związanych z konstruowaniem i interpretowaniem wykresów. W nauczaniu biologii znaczną część informacji przedstawia się w postaci danych matematycznych, które następnie mogą być zwizualuzowane. Nie zawsze jednak wizualizacja oznacza dla ucznia rozumienie tego, co jest na niej przedstawione.

2019-01-08, 13:23:18
RADA: Praca dyplomowa Pani Brembor: W systemie prac dyplomowych dla pracy Pani Brembor (NBiP) brak zatwierdzenia przez Kierownika Zakładu/Pracowni. Prosimy o pilne zaznaczenie zatwierdzenia pracy.
Z poważaniem,
Rafał Mól
Przewodniczący Rady Programowej NBiP

TEMAT
Rozwój płodowy człowieka- wykorzystanie rysunku w procesie nauczania.

CEL PRACY
Celem pracy jest poznanie koncepcji uczniowskich na temat rozwoju płodowego człowieka z wykorzystaniem rysowania (obrazowania poznawczego) jako głównego narzędzia pracy w procesie edukacyjnym. Kolejnym etapem pracy będzie analiza poznanych koncepcji celem zaprojektowania obszarów wymagających wsparcia dydaktycznego.

TEMAT
Modelowanie przez rysowanie w procesie nauczania biologii, w celu rozwiązania problemu: „Skąd rośliny biorą swoją masę?”

CEL PRACY
Celem pracy jest weryfikacja hipotezy mówiącej o możliwościach zastosowania rysowania jako narzędzia modelowania w procesie nauczania na temat procesów życiowych (głównie fotosyntezy) - zachodzących w roślinach. W tym wypadku rysunek będzie służył jako model naukowy wyjaśniający problem skąd roślin biorą swoją masę.

TEMAT
Zróżnicowanie aktywności dobowej dwóch gatunków rzęsorków, Neomys anomalus i N. fodiens w warunkach eksperymentalnych.

CEL PRACY
1) W oparciu o analizę wcześniej zarejestrowanych nagrań wideo, sprawdzenie czy w warunkach eksperymentalnych (2-gatunkowa grupa zwierząt hodowana w wolierze) z upływem czasu dwa gatunki rzęsorków, Neomys anomalus i N. fodiens, różnicują na tyle swoją aktywność dobową, że spada liczba konfliktów między nimi, co umożliwia ich współbytowanie.
2) Uzyskanie tytułu licencjata biologii przez studentkę i tym samym ukończenie w pełnym zakresie studiów I stopnia.

TEMAT
Wpływ czynników biotycznych na torpor i hibernację u małych ssaków.

CEL PRACY
1) W oparciu o przegląd literatury (w tym najnowszych publikacji anglojęzycznych z wiodących czasopism), zestawienie informacji o wpływie czynników biotycznych (np. jakość i dostępność pokarmu, presja konkurentów i drapieżników, możliwość termoregulacji socjalnej) na zapadanie w, głębokość i czas trwania torporu i hibernacji u małych ssaków.
2) Uzyskanie tytułu licencjata biologii przez studentkę i tym samym ukończenie w pełnym zakresie studiów I stopnia.

TEMAT
Wpływ czynników abiotycznych na torpor i hibernację u małych ssaków.

CEL PRACY
1) W oparciu o przegląd literatury (w tym najnowszych publikacji anglojęzycznych z wiodących czasopism), zestawienie informacji o wpływie czynników abiotycznych (np. pora roku, temperatura otoczenia, opady, fotoperiod) na zapadanie w, głębokość i czas trwania torporu i hibernacji u małych ssaków.
2) Uzyskanie tytułu licencjata biologii przez studentkę i tym samym ukończenie w pełnym zakresie studiów I stopnia.

TEMAT
Generowanie reaktywnych form tlenu w komórkach roślinnych w warunkach stresu świetlnego.

CEL PRACY
Celem szczegółowym pracy jest przegląd aktualnej wiedzy na temat generowania i roli reaktywnych form tlenu w funkcjonowaniu organizmów roślinnych w warunkach stresu świetlnego. Zakres i charakter pracy wpisuje się w nadrzędny cel jakim jest opanowanie i prezentacja wiedzy z zakresu zjawisk rządzących funkcjonowaniem komórek oraz komunikacją wewnątrz- i międzykomórkową w warunkach stresowych.
Na bazie wiedzy obejmującej molekularne, biochemiczne i komórkowe podstawy funkcjonowania organizmów roślinnych zostaną przedstawione zagadnienia dotyczące m.in.: indukcji syntezy reaktywnych form tlenu, aktywności systemów antyoksydacyjnych oraz roli ROS w funkcjonowaniu komórek roślinnych w niekorzystnych warunkach świetlnych. W pracy zostaną uwzględnione również aspekty biotechnologiczne związane z wykorzystaniem zjawiska generowania reaktywnych form w komórkach roślinnych.

TEMAT
Wykorzystanie stabilnych linii komórkowych K562 z indukowaną ekspresją mutantów Nan-KLF1 i CDA-KLF1 (Kruppel like factor 1) do poszukiwania nowych oddziaływań białkowych.

CEL PRACY
Opracowanie wydajnej metody immunoprecypitacji kompleksów zawierających zmutowane formy KLF1 (Nan i CDA) z indukowanych stabilnych linii komórkowych K562. Badanie oddziaływań w kompleksach białkowych przy pomocy spektrometrii mas.

TEMAT
Plant volatiles as dispersal cues in the invasive wheat curl mite

CEL PRACY
The aim of the study is to investigate behavioural responses of wheat curl mite (measured by the following activities: lying, walking, standing up, undertaking dispersal) to volatiles emitted by three different host plant species (wheat, barley, smooth brome) measured in an olfactometer. These three plant species differ in their ability to host wheat curl mite: wheat is the most suitable host whereas brome the least suitable. The prediction that will be tested is that general activity of mites will be the highest and dispersal events will be the most frequent when mites are on brome and sense volatiles emitted by wheat.

TEMAT
Behavioural responses to wind cues in aerially dispersing wheat curl mite populations with different levels of homozygosity

CEL PRACY
The study will focus on phytophagous wheat curl mite dispersing aerially. The aim of the study is to investigate behavioural responses expressed by the mite in the presence of wind, which is a dispersal cue for this mite. Specifically, three populations with different levels of homozygosity (confirmed by microsatellite analysis) will be observed in a wind tunnel and their dispersal behavior (forming chains involving multiple individuals) as well as dispersal events will be noted. The prediction of stronger behavioural response (i.e. chain formation) and higher dispersal in the population with lower genetic variability will be tested.

TEMAT
Application of biophysical and biochemical methods to determine the dynamics of interaction between MBNL splicing regulators and RNA

CEL PRACY
MBNL proteins are regulators of alternative splicing and alternative polyadenylation. MBNLs specifically bind defined RNA motifs arranged in a certain structural context. We presume that different RNA motifs with respect to a sequence and structural context may be characterized by different dynamics of association and dissociation of MBNL paralogs. In this project, a few biochemical and biophysical methods including single molecule imaging will be applied to monitor the kinetics of interaction between two macromolecules under the conditions of a cellular extract.

TEMAT
Stworzenie wektorów do nadekspresji genów kodujących ciągi poliglicynowe w fuzji z białkami fluorescencyjnymi do badań in cellula nad powstawaniem toksycznych agregatów białkowych na skutek ekspansji powtórzeń trójnukleotydowych CGG.

CEL PRACY
jw

TEMAT
Application of antisense oligonucleotides targeting trinucleotide CUG repeats in RNA to reduce surveillance of cancer cells

CEL PRACY
Main aim of the project is to test few antisense oligonucleotides with sequence complementary to CUG repeats as potential compound affecting cancer cell biology. Many mRNAs have such CUG sequences and the hypothesis of the project is that slight negative effect on protein biosynthesis from such mRNAs as a combined effect may influence cancer cell surveillance.

TEMAT
Udział czynników trans uczestniczących w translacji toksycznych białek zawierających trakty poli-glicynowe ze zmutowanego mRNA FMR1
Contribution of trans-factors in translation of toxic proteins containing poly-glicine tracts from mutant mRNA of FMR1

CEL PRACY
Celem pracy jest przebadanie kilku białek odpowiedzialnych za metabolizm RNA mogących uczestniczyć w regulacji niekanonicznej translacji inicjowanej z kodonu start innego niż AUG. Ta niekanoniczna translacja prowadzi do powstania toksycznych białek z mrNA zawierających ekspansję powtórzeń CGG w regionie 5`UTR genu FMR1.. Planowane jest przetestowanie kilku helikaz RNA oraz białek regulujących splicing takich jak białka z rodziny MBNL, CELF, RBFOX oraz hnRNP.

TEMAT
Zaburzenie funkcji czynnika splicingowego SAM68 jako potencjalny biomarker w modelach komórkowych i zwierzęcych zespołu drżenia i ataksji związanego z łamliwych chromosomem X.
Functional abnormalities of SAM68 splicing factor as potential biomarker in cellular and animal models of Fragile-X Associated Tremor-Ataxia Syndrome

CEL PRACY
SAM68 jest białkiem wiążącym się z RNA i uczestniczącym w regulacji metabolizmu RNA. Białko to ulega funkcjonalnej sekwestracji na RNA zawierającym ekspansję powtórzeń CGG w zespole FXTAS. W projekcie planowane jest przetestowanie zaburzeń splicingowych eksonów regulowanych przez SAM68 jako potencjalnych biomarkerów choroby. Modelami badawczymi będą komórki pochodzące od pacjentów z FXTAs oraz transgeniczne modele mysie tej choroby. Biomarkery mogą być wykorzystane do monitorowania aktywności potencjalnych czynników terapeutycznych targetujących RNA z ekspansją powtórzeń CGG.

TEMAT
Określenie potencjału inhibicyjnego antysensowych oligonukleotydów na biosyntezę toksycznego białka poli-glicynowego powstającego z mRNA zawierającego ekspansję powtórzeń trójnukleotydowych CGG.

CEL PRACY
Mutacja w regionie 5`UTR genie FMR1 polegająca na ekspansji powtórzeń trójnukleotydowych CGG skutkuje biosyntezą dwóch białek ze zmutowanego mRNA: w ramach kanonicznej translacji powstaje prawidłowe białko FMRP, z kolei na skutek mutacji w ramach niekanonicznej translacji RAN powstaje dodatkowo białko zawierające trakty poliglicynowe (kodowane przez powtórzenia CGG). Celem pracy jest przetestowanie szeregu antysensowych oligonukleotydów komplementarnych do regionu 5`UTR zmutowanego mRNA FMR1 w celu określenia ich skuteczności jako represorów niekanonicznej translacji RAN toksycznych białek. Oligonukleotrydy będą wprowadzane do komórek eksprymujących zmutowany gen, a ich skuteczność zostanie określone z zastosowaniem cytometrii przepływowej i mikroskopii fluorescencyjnej.

TEMAT
 Grywalizacja na różnych etapach edukacyjnych.

CEL PRACY
Celem pracy jest opisanie mechanizmów rywalizacji, gryfikacji procesu kształcenia oraz gamifikacji nauki. Praca dyplomowa oparta o źródła bibliograficzne.

TEMAT
Poliaminy- nowy, molekularny koordynator sygnału nitro - oksydacyjnego w starzeniu liścia jęczmienia.

CEL PRACY
Celem pracy jest uzyskanie odpowiedzi na pytanie, czy PA mogą współdziałać z cząsteczkami sygnałowymi takimi jak NO i H2O2, jako triada sygnalizacyjna NO↔PA↔H2O2, w której kierunek metabolizmu PA konrtorluje tempo przebiegu procesu starzenia. Przyjęto, że cel ten zostanie osiągnięty przez ustalenie zależności w sieciach metabolicznych pomiędzy elementami triady, oznaczając starzeniowo-zależne zmian w
poziomach wolnych poliamin i bio-obrazowanie oraz pomiary ilościowe NO i H2O2 w starzejących się
liściach roślin kontrolnych oraz poddanych działaniu inhibitorów metabolizmu poliamin i syntezy NO. Praca może stanowić punkt wyjścia dla opracowania zajęć dodatkowych dla uczniów szkół ponadpodstawowych.

TEMAT
Geny metabolizmu poliamin potencjalnie istotne dla regulacji procesu starzenia się upraw zbóż

CEL PRACY
Celem pracy jest identyfikacja jeczmiennych sekwencji nukleotydowych genów biosyntezy i katabolizmu poliamin. Opracowane bioinformatycznie sekwencje umożliwią w przyszłości przygotowanie biblioteki genów poliamin i konstrukcję wektorów plazmidowych do transformacji jęczmienia.

TEMAT
The influence of light in the nest habitat on eggshell coloration in Great Tit Parus major

CEL PRACY
The aim of the study is to investigate whether intensity of light in the nest habitat modifies color and patterning of eggshell in a cavity-nesting species. Surveys will be conducted basing on analysis of digital photos of Great Tit eggs laid in a standard and artificially illuminated nest boxes.

TEMAT
Wpływ światła na zachowania związane z wysiadywaniem jaj u bogatki (Parus major)

CEL PRACY
Celem pracy jest zbadanie czy zmienność oświetlenia w środowisku gniazdowym ma wpływ na ogólną stałość wysiadywania jaj oraz dzienną dynamikę tego zachowania. Badania będą prowadzone na populacji sikory bogatki gniazdującej w standardowych oraz zmodyfikowanych skrzynkach lęgowych, zapewniających większe doświetlenie ich wnętrza.

TEMAT
Effect of silencing of long noncoding RNA OIP5-AS1 on expression of OIP5 gene in human cell line NCI-H1703

CEL PRACY
Poziom ekspresji długiego niekodującego RNA OIP5-AS1 znacznie zmienia się w komórkach nowotworowych, w porównaniu z komórkami zdrowymi, dlatego uważa się, że może pełnić istotne funkcje w procesie nowotworzenia, np. poprzez modulowanie poziomów ekspresji innych genów. Celem realizacji pracy magisterskiej będzie sprawdzenie czy i w jakim stopniu wyciszenie ekspresji genu OIP5-AS1 za pomocą gapmerów wpływa na poziom ekspresji genu OIP5 w ludzkiej linii komórkowej NCI-H1703, stanowiącej model nowotworu piersi.

TEMAT
Profil edytowania typu A-I w nowotworach piersi człowieka

CEL PRACY
Porównanie wzoru edytowania transkryptów człowieka w różnych podtypach nowotworu piersi

TEMAT
Rola długiego niekodującego RNA NNT-AS1 w regulacji ekspresji genu NNT w linii komórkowej HEK293T.

CEL PRACY
Sprawdzenie czy i w jaki sposób długi niekodujący RNA NNT-AS1 wpływa na ekspresję genu NNT w linii komórkowej HEK293T.

TEMAT
Antybiotykooporność gronkowców wyizolowanych z żywności..

CEL PRACY
Celem pracy jest ustalenie czy szczepy bakteryjne wyizolowane z żywności są źródłem genów kodujących oporność na antybiotyki. Obecność wielu z tych genów na ruchomych elementach genetycznych stwarza potencjalną możliwość ich przekazywania do innych szczepów bakteryjnych, w tym bakterii stanowiących mikrobiom przewodu pokarmowego człowieka. Nabywanie oporności przez drobnoustroje stanowi obecnie jedno z najważniejszych zagrożeń zdrowia publicznego.

TEMAT
Stan odżywienia i czynność płuc u chorych na mukowiscydozę z i bez Pseudomonas aeruginosa

CEL PRACY
Badanie ma na celu wyjaśnienie zależności między stanem odżywienia, mierzonym za pomocą wskaźnika BMI oraz na podstawie analizy składu ciała metodą bioimpedancji, a czynnością płuc określoną za pomocą FEV1 oraz wskaźnika Tiffeneau w grupie dorosłych chorych na mukowiscydozę. Spodziewamy się, że: 1) chorzy z niedożywieniem będą mieli istotnie niższe średnie wartości FEV1 i wskaźnika Tiffeneau; 2) infekcja Pseudomonas aeruginosa będzie związana ze zmniejszoną czynnością płuc i gorszym stanem odżywienia; 3) prawidłowy stan odżywienia (w normie) oraz brak zakażenia Pseudomonas aeruginosa będą związane z lepszymi parametrami określającymi czynność płuc.
Na badanie posiadam zgodę komisji bioetycznej.

TEMAT
Skład ciała dzieci i młodzieży o zwiększonej aktywności fizycznej

CEL PRACY
Głównym celem pracy będzie zbadanie czy istnieją różnice i jeśli tak, to jakie, w składzie ciała dzieci i młodzieży o zwiększonej aktywności fizycznej. Skład ciała analizowany będzie w grupach o zróżnicowanej aktywności fizycznej (aktywność niska, umiarkowana i wysoka) oraz w grupach wydzielonych ze względu na rodzaj uprawianego sportu.
Na badania posiadam zgodę komisji bioetycznej. Badania będą prowadzone w Wielkopolskiej Przychodni Sportowo–Lekarskiej Sp z o.o. ul. Władysława Reymonta 35, 60-791 Poznań

TEMAT
Stan okołourodzeniowy i jego wpływ na przebieg dojrzewania płciowego u dziewcząt

CEL PRACY
W pracy zbadane zostaną zależności pomiędzy stanem okołourodzeniowym dziewcząt i przebiegiem dojrzewania płciowego. Zakładamy, że w obrębie dzieci urodzonych przedwcześnie i/lub z małą masą ciała istnieją różne strategie wzrastania wynikające z: 1. wystąpienia catch up growth; 2. czasu, w którym wystąpiła kompensacja rozwoju; 3. braku kompensacji oraz 4. wieku wystąpienia adiposity rebound. Catch up growth oraz wiek wystąpienia adiposity rebound (odbicia otłuszczenia) są zjawiskami modulującymi wiek rozpoczęcia dojrzewania płciowego i skoku pokwitaniowego,
Na badania posiadam zgodę komisji bioetycznej.

TEMAT
Budowanie wiedzy przez młodzież o biologicznych uwarunkowaniach seksualności człowieka- rola i znaczenie stawianych pytań.

CEL PRACY
Celem pracy jest zbadanie jakiego typu pytania dotyczące biologicznych uwarunkowań seksualności człowieka stawia młodzież oraz jak z odpowiedzią na te pytania radzą sobie rodzice i nauczyciele.. Badania ankietowe skierowane zostaną do młodzieży (jako stawiającej pytania), rodziców i nauczycieli (jako osób, które otrzymują pytania).
Opiekunem pracy magisterskiej będzie Pani dr Agnieszka Cieszyńska

TEMAT
Wzorce wzrastania dziewcząt i chłopców z nadmierną masą ciała w odniesieniu do rówieśników o prawidłowej masie ciała.

CEL PRACY
Celem pracy będzie wyznaczenie przebiegu wzrastania liniowych wymiarów ciała dziewcząt i chłopców z nadwagą i otyłością. Badania będą miały charakter semi-longitudinalny, rozpoczną się jednocześnie w 5 kohortach wiekowych: 10, 11, 12, 13 i 14 latków. Pomiary wysokości i masy ciała będą przeprowadzone dwukrotnie, dla każdego dziecka, w rocznych odstępach, włączając pomiar pierwszy. Dodatkowo dane zostaną uzupełnione o pomiary dotyczące urodzeniowej masy i długości ciała, a także pomiary masy i wysokości ciała przeprowadzane w ramach badań bilansowych. Dane te pozwolą na wyznaczenie z największym prawdopodobieństwem rzeczywistego przebiegu procesu wzrastania oraz wskazanie specyficznych parametrów skoku pokwitaniowego, takich jak tempo wzrastania podczas rozpoczęcia skoku (Take Off, TO), tempo wzrastania podczas szczytowej prędkości wzrastania (Peak Height Velocity, PHV), wiek rozpoczęcia skoku (Age at Take Off, ATO), oraz wiek szczytowej prędkości wzrastania (Age at Peak Height Velocity, APHV), przy pomocy modelu wzrastania JPA2 zawartego w oprogramowaniu AUXAL SSI 3.1. [Jolicoeur et al. 1992; 1998; Kaczmarek 2001]. Model zakłada liniowość wzrastania oraz pozwala na niestrukturalną analizę odchyleń od modelu w odniesieniu do indywidualnych przypadków, opisujących krótkotrwałe zmiany szybkości wzrastania. Arkadiusz wykona pomiary wysokości i masy ciała oraz spisze dane z kart bilansowych. Dla celów porównawczych zostanie wyłoniona grupa kontrolna ( rówieśnicy o prawidłowej masie ciała). Na badania posiadam zgodę komisji bioetycznej.
Opiekunem pracy będzie Pani Dr Magdalena Durda-Masny

TEMAT
Wiek wystąpienia odbicia otłuszczenia i jego wpływ na przebieg dojrzewania płciowego u dziewcząt

CEL PRACY
Celem pracy będzie wyznaczenie wieku tzw. odbicia otłuszczenia (Adiposity rebound; AR) i zbadanie jego wpływu na przebieg dojrzewania płciowego u dziewcząt. Wiek odbicia otłuszczenia występuje u dzieci między 3 a 7 rokiem życia. Jego wczesne wystąpienie jest czynnikiem ryzyka wystąpienia otyłości w wieku dorosłym. Nie wiadomo jednak czy i jaki wpływ wywiera na przebieg dojrzewania płciowego.

TEMAT
Porównanie stanu odżywienia chorych na mukowiscydozę wyznaczonego metodą bioimpedancji elektrycznej oraz z wykorzystaniem wskaźnika BMI.

CEL PRACY
U chorych na mukowiscydozę ważnym parametrem prognozującym postęp choroby jest właśnie stan odżywienia. Lekarze w większości opierają się na wskaźniku BMI, choć wiadomo, że BMI nie jest precyzyjną metodą, którą można stosować do oceny stanu odżywienia. Stąd celem badań będzie porównanie stanu odżywienia chorych na mukowiscydozę metodą bioimpedancji elektrycznej oraz wskaźnikiem BMI. Na badania posiadam zgodę komisji bioetycznej.

TEMAT
Poznanie mechanizmów udziału białka Hyl1 i Cpl1 w kapowaniu transkryptów w A.thaliana

CEL PRACY
Analiza porównawcza kapowania wybranych transkryptów pomiędzy roślinami typu dzikiego Arabidopsis thaliana a mutantami hyl1-2 i cpl1-7.: Zakładana hipoteza twierdzi, że białko HYL1 wpływa na wydajność kapowania transkryptów syntetyzowanych przez polimerazę RNA II. Zatem być może również na kapowanie transkryptów genów mikroRNA - kluczowych regulatorów ekspresji genów. Poznanie nowej roli białka HYL1 w regulacji ekspresji genów pozwoli na prowadzenie w przyszłości manipulacji genetycznych mających na celu ulepszanie roślin hodowlanych. Techniki biologii molekularnej opanowane w ramach realizowanej pracy są stosowane w badaniach biotechnologicznych.

2019-02-01, 16:17:18
RADA: RE: Proszę o doprecyzowanie tematu i celu pracy zgodnie z profilem studiów na kierunku Biotechnologia. Zosiu innymi słowy jakie zastosowanie może mieć "wiedza" zdobyta podczas realizacji pracy dyplomowej.
Pozdrawiam Agnieszka Ludwików

TEMAT
Poznanie roli fosforylacji w aktywności białka Hyl1 w A.thaliana

CEL PRACY
Charakterystyka podwójnych mutantów Arabidopsis thaliana hyl1-2 x mpk3 oraz hyl1-2 x smek1-2.: Białko HYL1 kontroluje w rytmie dobowym biosyntezę mikroRNA - kluczowych regulatorów ekspresji genów. Zrozumienie kontroli aktywności białka HYL1 poprzez fosforylację pozwoli na prowadzenie w przyszłości manipulacji genetycznych mających na celu ulepszanie roslin hodowlanych. Techniki biologii molekularnej opanowane w ramach realizowanej pracy są stosowane w badaniach biotechnologicznych.

2019-02-01, 16:13:30
RADA: Re: Uprzejmie proszę o doprecyzowanie tematu i celu pracy zgodnie z poniższym określeniem profilu studiów:
"Biotechnologia o profilu ogólnoakademickim jest kierunkiem umiejscowionym w obszarze kształcenia w zakresie nauk przyrodniczych. Zgodnie z definicją, biotechnologią określa się interdyscyplinarną dziedzinę nauki i techniki zajmującą się zmianą materii żywej i nieożywionej poprzez wykorzystanie organizmów żywych, ich części, bądź pochodzących od nich produktów, a także modeli procesów biologicznych w celu tworzenia wiedzy, dóbr i usług. Tak więc zagadnieniami, które decydują o odrębności kierunku kształcenia są zjawiska i procesy występujące na wszystkich poziomach organizacji Życia, które mogą okazać się przydatne, bezpośrednio lub po przekształceniu, w zastosowaniach praktycznych".
Pozdrawiam Agnieszka Ludwików

TEMAT
Uzyskanie i charakterystyka linii transgencznych Arabidopsis thaliana z ekspresją allelu HYL1(S159D) oraz HYL1(S159A)

CEL PRACY
Poznanie roli fosforylacji białka Hyl1 na jego funkcje komórkowe

TEMAT
Uzyskanie i charakterystyka linii transgencznych Arabidopsis thaliana z ekspresją allelu HYL1(S42D) oraz HYL1(S42A).

CEL PRACY
Poznanie roli fosforylacji białka Hyl1 na jego funkcje komórkowe

TEMAT
Parametry termodynamoczne struktur tRNA

CEL PRACY
Celem pracy jest analiza zmienności parametrów termodynamicznych elementów związanych z tworzeniem struktur drugorzedowych czasteczek tRNA.

TEMAT
Oenocyty owadów a hepatocyty ssaków - udział w regulacji metabolizmu lipidów.

CEL PRACY
Celem pracy jest analiza porównawcza dostępnej literatury na temat regulacji metabolizmu lipidów u kręgowców i bezkręgowców w oparciu o dane dotyczące oenocytów i hepatocytów.

TEMAT
Wpływ wybranych wtórnych metabolitów roślinnych na procesy rozrodcze i rozwój embrionalny chrząszcza Tenebrio molitor.

CEL PRACY
Negatywny wpływ klasycznych insektycydów na środowisko naturalne zmusza naukowców do poszukiwania alternatywnych rozwiązań opartych na wykorzystaniu naturalnych substancji jako bioinsektycydów.. Celem pracy jest zbadanie wpływu wybranych ketonów, aldehydów i kwasów pochodzenia roślinnego na liczbę składanych jaj, wylęgalność larw oraz zmiany morfologiczne i ultrastrukturalne zachodzące w układzie rozrodczym samic chrząszcza T. molitor pod wpływem testowanych substancji.

TEMAT
Charakterystyka najważniejszych czynników ryzyka w patogenezie wybranych chorób sercowo-naczyniowych.

CEL PRACY
Celem pracy jest omówienie najważniejszych czynników ryzyka takich jak dieta, stres, otyłość, palenie tytoniu, wpływających na patogenezę chorób serca i układu krążenia: nadciśnienia tętniczego, dusznicy bolesnej, zawału czy niewydolności serca na podstawie najnowszych danych literaturowych.

TEMAT
Wpływ wybranych alkaloidów z rodziny Solanaceae na aktywność enzymów trawiennych, profil białkowy oraz poziom HSP w jelicie chrząszcza Tenebrio molitor.

CEL PRACY
Mechanizmy aktywności glikoalkaloidów w organizmach żywych są jak dotąd bardzo słabo poznane, Wpływ alakloidów z rodziny psiankowatych na fizjologię owadów jest przedmiotem naszych ostatnich badań ze względu na ich potencjalne zastosowanie w rolnictwie, jako bioinsektycydów. Celem pracy będzie sprawdzenie czy wybrane związki tj. chakonina i solanina wpływają na procesy trawienne w jelicie chrząszcza oraz regulujację synteze białek tj. HSP.

TEMAT
Neurobiologiczne podstawy powstawania emocji u człowieka i ich zaburzenia.

CEL PRACY
Celem pracy jest opisanie neuroanatomicznego oraz fizjologicznego podłoża zachowań napędowo- emocjonalnych takich jak złość, lęk czy agresja (emocje negatywne) oraz emocje pozytywne- radość, szczęście Zostanie opisany układ kary i nagrody. W pracy zostaną opisane zaburzenia związane z nieprawidłowym funkcjonowaniem struktur odpowiedzialnych za powstawanie emocji.

TEMAT
Charakterystyka, patogeneza i terapia wybranych chorób metabolicznych

CEL PRACY
Celem pracy jest zebranie najnowszych danych na temat coraz powszechniej występujących w populacji ludzkiej chorób metabolicznych takich jak cukrzyca. Zostanie omówiona etiologia, objawy oraz terapie wybranych chorób o podłożu metabolicznym,

TEMAT
Określenie udziału helikaz z rodziny DDX w regulacji alternatywnego splicingu zależnego od białek MBNL w zinżynierowanych modelach komórkowych z chemicznie indukowanym wyciszeniem DDX5 i DDX17.

CEL PRACY
Celem pracy jest zbadanie czy helikazy z rodziny DDX (głównie DDX5 i DDX17) mają udział w regulacji alternatywnego splicingu zależnego od MBNL. Wiadomo, że MBNL wiąże się do mniej stabilnych struktur RNA, a na stabilność termodynamiczną tych struktur w komórkach wpływać mogą różne helikazy RNA. W związku z tym w projekcie zadane zostanie pytanie o wpływ aranżacji strukturalnych elementów regulatorowych wiązanych przez MBNL w kontekście niedoboru wybranych helikaz. Badania będą oparte o genetycznie modyfikowane eukariotyczne linie komórkowe z indukowanym chemicznie (system TET-ON) wyciszeniem DDX, które będą poddawane przejściowej trensfekcji wektorami genetycznymi kodującymi minigeny zależne od MBNL.

2019-02-07, 14:41:57
KIEROWNIK JEDNOSTKI: uzupelnienie tytulu i celu pracy: Nowy Temat: Określenie udziału helikaz z rodziny DDX w regulacji alternatywnego splicingu zależnego od białek MBNL w zinżynierowanych modelach komórkowych z chemicznie indukowanym wyciszeniem DDX5 i DDX17.

Uzupełniony Cel: Celem pracy jest zbadanie czy helikazy z rodziny DDX (głównie DDX5 i DDX17) mają udział w regulacji alternatywnego splicingu zależnego od MBNL. Wiadomo, że MBNL wiąże się do mniej stabilnych struktur RNA, a na stabilność termodynamiczną tych struktur w komórkach wpływać mogą różne helikazy RNA. W związku z tym w projekcie zadane zostanie pytanie o wpływ aranżacji strukturalnych elementów regulatorowych wiązanych przez MBNL w kontekście niedoboru wybranych helikaz. Badania będą oparte o genetycznie modyfikowane eukariotyczne linie komórkowe z indukowanym chemicznie (system TET-ON) wyciszeniem DDX, które będą poddawane przejściowej trensfekcji wektorami genetycznymi kodującymi minigeny zależne od MBNL.

2019-02-01, 16:12:57
RADA: Re: Proszę o doprecyzowanie tematu i celu pracy zgodnie z poniższym określeniem profilu studiów:
"Biotechnologia o profilu ogólnoakademickim jest kierunkiem umiejscowionym w obszarze kształcenia w zakresie nauk przyrodniczych. Zgodnie z definicją, biotechnologią określa się interdyscyplinarną dziedzinę nauki i techniki zajmującą się zmianą materii żywej i nieożywionej poprzez wykorzystanie organizmów żywych, ich części, bądź pochodzących od nich produktów, a także modeli procesów biologicznych w celu tworzenia wiedzy, dóbr i usług. Tak więc zagadnieniami, które decydują o odrębności kierunku kształcenia są zjawiska i procesy występujące na wszystkich poziomach organizacji Życia, które mogą okazać się przydatne, bezpośrednio lub po przekształceniu, w zastosowaniach praktycznych".
Pozdrawiam Agnieszka Ludwików

TEMAT
Związek między rozwojem fizycznym a sposobem żywienia i jakością życia zależną od zdrowia u dzieci w wieku przedszkolnym.

CEL PRACY
Praca będzie miała charakter badawczy. Celem pracy będzie ocena związku pomiędzy rozwojem fizycznym dzieci w wieku przedszkolnym a sposobem ich żywienia i jakością życia zależną od zdrowia (HRQoL). Badania będą obejmowały pomiary antropometryczne (masa ciała, wysokość ciała, obwód ramienia, bioder i pasa) oraz pomiary kwestionariuszowe za pomocą wystandaryzowanych narzędzi (NutriSTEP i PedsQL).

2019-01-09, 11:35:46
RADA: Programowa Biologii: Proponowany temat pracy dyplomowej został zaakceptowany.
Z pozdrowieniami,
Beata Messyasz

TEMAT
Fizjologiczne konsekwencje różnych sposobów żywienia dzieci w wieku przedszkolnym

CEL PRACY
Celem pracy jest ocena fizjologicznych parametrów organizmu (takich jak ciśnienie tętnicze krwi), składowych masy ciała oraz cech i wskaźników antropometrycznych (takich jak masa ciała, wysokość ciała, obwody wybranych części ciała, wskaźnik masy ciała - BMI oraz WHtR) w zależności od stosowanych sposobów żywieniowych i zachowań jedzeniowych. Badania obejmować będę pomiary antropometryczne, pomiar składu ciała metodą bioimpedancji elektrycznej oraz pomiary kwestionariuszowe (NutriSTEP, CEBQ) i przeprowadzone będą wśród dzieci w wieku 3-5 lat.

2019-01-08, 18:26:16
RADA: Praca magisterska Moniki Piotrowiak: Uprzejmie proszę o przekazanie wiadomości Pani dr Sylwii Trambacz-Oleszak. W systemie deklaracji prac dyplomowych i na stronie wydziałowej brak jej adresu mailowego.
Rada Programowa NBiP proponuje drobną korektę w temacie pracy jak niżej. Poza tym nie mamy żadnych uwag - opis celu pracy jest wzorcowy :-)
Propozycja modyfikacji tematu: Fizjologiczne konsekwencje różnych sposobów żywienia dzieci w wieku przedszkolnym.
Prosimy o wprowadzenie korekty do systemu deklaracji prac dyplomowych.
R. Mól
Przewodniczący Rady Programowej NBiP

TEMAT
Związek między sposobem żywienia a funkcjonowaniem tarczycy u osob z niedoczynnością tarczycy i chorobą Hashimoto

CEL PRACY
Celem pracy będzie analiza związku między sposobami żywienia a funkcjonowaniem tarczycy u osób z niedoczynnością tarczycy i chorobą Hashimoto. Praca będzie miała charakter poglądowy i będzie skupiać się przede wszystkim na dokładnej charakterystyce funkcjonowania tarczycy i szczegółowym ukazaniu biologicznych mechanizmów leżących u podstaw związku między pracą tarczycy a składnikami przyjmowanymi z pożywienia.

2019-01-09, 11:36:18
RADA: Programowa Biologii: Proponowany temat pracy dyplomowej został zaakceptowany.
Z pozdrowieniami,
Beata Messyasz

TEMAT
Biomedyczne czynniki etiologiczne zaburzeń spektrum autyzmu.

CEL PRACY
Praca będzie miała charakter przeglądu najnowszej literatury w celu dokonania analizy podejść biologicznych i genetycznych wyjaśniających etiologię zaburzeń ze spektrum autyzmu (ASD). Omówione zostaną czynniki genetyczne, paragenetyczne i środowiskowe, które wskazuje się jako zaangażowane w patogenezę ASD, w tym m.in. koncepcja testosteronowa, czynniki immunologiczne, zaburzenia metaboliczne, infekcje wirusowe, bakteryjne i grzybicze i uszkodzenia mózgu. W pracy podjęta zostanie próba syntetycznego ujęcia etiologii ASD.

2019-01-09, 11:36:41
RADA: Programowa Biologii: Proponowany temat pracy dyplomowej został zaakceptowany.
Z pozdrowieniami,
Beata Messyasz

TEMAT
Zróżnicowanie genetyczne wewnątrz i między populacyjne Pinus sylvestris z Magurskiego Parku Narodowego.

CEL PRACY
Ocena zmienności genetycznej wybranych populacji sosny zwyczajnej, których pochodzenie nie jest udokumentowane. Populacje są różnowiekowe i niektóre z nich mogły być wysadzone na gruntach porolnych. Dlatego też ich pochodzenie jest nieudokumentowane. Porównanie ich może pozwolić na odtworzenie ich historii.
Aspekt dydaktyczny: praca będzie zawierała scenariusz lekcji poświęconej znaczeniu zmienności genetycznej w kontekście procesu ewolucji.

TEMAT
Aktywność układu odpornościowego chorych na cukrzycę typu 1.

CEL PRACY
Etiologia cukrzycy typu 1 nierozerwalnie związana jest z funkcjonowaniem układu odpornościowego człowieka. Praca stanowi podsumowanie dotychczasowej wiedzy na temat aktywności mechanizmów odpornościowych u osób dotkniętych tą chorobą.

TEMAT
Determination of topology of ccRCC deregulated TMEMs: 213, 207, 116, 72 and 30B

CEL PRACY
Analysis of the number of transmembrane domains in TMEM213, 207, 116, 72 and 30B

TEMAT
Występowanie i wybrane elementy ekologii bączka Ixobrychus minutus na Stawach Milickich

CEL PRACY
Ocena wielkości populacji lęgowej oraz przestrzennego rozmieszczenia bączka Ixobrychus minutus na Stawach Milickich. Teren badań jest obszarem Natura 2000 i rezerwatem przyrody, a wielkość populacji bączka jako gatunku "dyrektywowego" i przedmiotu ochrony w ostoi pozostaje nierozpoznana. Praca formalnie w porozumieniu i za zgodą RDOŚ we Wrocławiu. Cel ostateczny (poza czysto poznawczym) - aktualizacja Standardowego Formularza Danych, uzupełnienie Planu Zadań Ochronnych dla Ostoi i rezerwatu przyrody.

TEMAT
Mikroalgi w produkcji biopaliw i biotechnologiczne metody zwiększania produktywności ich biomasy.

CEL PRACY
Przegląd danych literaturowych

TEMAT
Wykorzystanie przeciwciał monoklonalnych w biotechnologii medycznej.

CEL PRACY
Przeciwciała monoklonalne stanowią niewątpliwie jedno z najbardziej spektakularnych osiągnięć nowoczesnej biotechnologii. Stały się one niezwykle cennym narzędziem badawczym w wielu dziedzinach nauki w tym immunologii, naukach biologicznych czy medycznych. Celem pracy jest przedstawienie, w oparciu o dostępną literaturę, możliwości wykorzystania przeciwciał monoklonalnych zarówno w diagnostyce jak i terapii, szczególnie nowotworów.

TEMAT
Wpływ zróżnicowanej diety na wybrane cechy organizmu modelowego Drosophila melanogaster.

CEL PRACY
Drosophila melanogaster jest szeroko wykorzystywana jako organizm modelowy m.in. w badaniach nad otyłością, cukrzycą czy oddziaływaniem różnych dodatków do żywności na funkcjonowanie organizmu. Celem pracy jest ocena wpływu zróżnicowanej diety (ubogiej i bogatej w węglowodany) na wybrane cechy muszki owocowej w aspekcie opracowania konspektu pracy konkursowej dla uczniów.

TEMAT
Identyfiakcja mutacji w wybranych egzonach genów TOMM40 I PARK2 u pacjentów ze zdiagnozowaną chorobą Parkinsona

CEL PRACY
Celem pracy jest wykazanie czy receptorowe białko Tom40 wchodzące w skład kompleksu TOM odpowiedzialnego za prawidłowy import białek do mitochondriów oraz kierowana do mitochondriów Parkina, stanowią istotny czynnik ryzyka w rozwoju choroby Parkinsona. Do analizy wbrano po dwa rejony ludzkiego genu TOMM40 PARK2, na podstawie których wykonana zostanie identyfikacja mutacji w grupie pacjentów ze zdiagnozowaną chorobą Parkinsona. Otrzymane wyniki mogą stanowić istotny wkład w diagnostyce tej choroby neurodegeneracyjnej.

TEMAT
Rola mitochondriów w przebiegu stwardnienia zanikowo-bocznego.

CEL PRACY
Celem pracy jest przegląd literatury w poszukiwaniu danych dotyczących związku jednej
z chorób neurodegeneracyjnych - stwardnienia zanikowo- bocznego z funkcjonowaniem
mitochondriów. Istnienie takiego związku, udokumentowane danymi
eksperymentalnymi, może mieć istotne znaczenie dla opracowania metod
diagnostycznych i terapeutycznych.

TEMAT
Kanały importowe zewnętrznej błony mitochondrialnej i ich rola w przebiegu wybranych chorób neurodegeneracyjnych

CEL PRACY
Celem pracy jest przedstawienie aktualnej wiedzy dotyczącej kanałów importowych
zewnętrznej błony mitochondrialnej i powiązania ich funkcji z przebiegiem wybranych
chorób neurodegeneracyjnych, takich jak np. choroba Parkinsona lub choroba
Huntingtona . Wiedza ta może mieć ważne znaczenie dla rozwoju skutecznych strategii
diagnostycznych i terapeutycznych.

TEMAT
Wpływ głodzenia na poziom błonowych białek transportujących w mitochondriach ameby Acanthamoeba castellanii.

CEL PRACY
Celem pracy jest sprawdzenie czy głodzenie ameby A. castellanii wpływa na poziom
błonowych białek transportujących w jej mitochondriach. Otrzymane wyniki mogą
stanowić istotny punkt wyjścia dla ustaleń dotyczących działań terapeutycznych w
leczeniu chorób wywoływanych przez tego pierwotniaka.

TEMAT
Ocena wpływu chloramfenikolu na poziom błonowych białek mitochondrialnych ameby A. castellanii,

CEL PRACY
Celem pracy jest ocena wpływu chloramfenikolu na poziom błonowych białek
mitochondrialnych ameby A. castellanii. Ponieważ chloramfenikol hamuje ekspresję genów
pochodzenia bakteryjnego, w tym białek kodowanych przez genom mitochondrialny, w obecności
tego inhibitora może dojść do obniżenia aktywności mitochondriów, a tym samym inhibitor ten może
osłabiać procesy życiowe organizmu eukariotycznego. Dlatego otrzymane wyniki mogą mieć istotne
znaczenie w leczeniu chorób wywołanych przez pierwotniaki.

2019-01-05, 23:15:26
RADA: Opiniowanie tematów prac: Proszę o zatwierdzenie tematu pracy dyplomowej przez kierownika zakładu.
Agnieszka Ludwików

TEMAT
Aktywność antyoksydacyjna w kiełkujących nasionach rzepaku w odpowiedzi na działanie ołowiu.

CEL PRACY
Celem pracy jest opisanie mechanizmów regulujących poziom reaktywnych form tlenu w trakcie kiełkowania nasion rzepaku w obecności czynnika stresowego jakim jest obecność jonów Pb2+ oraz wpływu procesu kondycjonowania nasion na powyższe mechanizmy.

TEMAT
Metabolizm proliny w kondycjonowanych nasionach rzepaku kiełkujących w obecności ołowiu

CEL PRACY
Celem pracy jest zbadanie i opisanie metabolizmu proliny w trakcie kiełkowania nasion rzepaku oraz określenie wpływu stresu wywołanego obecnością ołowiu na ten metabolizm. Jednocześnie celem pracy jest określenie w jaki sposób kondycjonowanie nasion w obecności egzogennie podanej proliny zmienia endogenny metabolizm tego aminokwasu w warunkach stresowych.

TEMAT
Występowanie par lęgowych sroki Pica pica w różnych typach środowisk miejskich Poznania

CEL PRACY
Celem pracy jest poznanianie rozmieszczenia sroki w wybranych częściach Poznania w zależności od typu środowiska. Badania będą prowadzone w kontekście zróżnicowania zabudowy miejskiej oraz występującej szaty roślinnej, ze szczególnym uwzględnieniem dostępności miejsc gniazdowych. Badania ptaków krukowatych w miastach ma szczególne znaczenie w kontekście różnorodności biologicznej i jej ochrony.

TEMAT
Adnotacja białek o działaniu owadobójczym z grzybów rodzaju Metarhizium

CEL PRACY
Celem pracy jest ewolucyjna i funkcjonalna charakterystyka sekwencji 11 genów z grzybów Metarhizium. Sekwencje pochodzą z badań prowadzonych w Zakładzie Mikrobiologii UAM podczas których wykazano ich związek z infekcją Metarhizium anispoliae BRIP 53293 u chrząszczy (Tenebrio molitor). Charakterystyka tych czynników może dostarczyć informacji potencjalnie użytecznych do produkcji nowych bioinsektycydów stanowiących alternatywę dla syntetycznych środków ochrony roślin.

TEMAT
Baza danych interakcji białkowych czynników owadobójczych Bacillus thuringiensis.

CEL PRACY
Celem pracy jest utworzenie bazy danych dostarczającej uporządkowanych i aktualnych informacji na temat toksyczności grup białek Cry i Vip wobec różnych gatunków owadów oraz interakcji pomiędzy toksynami Cry-Cry oraz Cry-Vip u tych owadów. Interfejs bazy danych pozwoli użytkownikom na wyselekcjonowanie mieszanin białek B. thuringiensis o najwyższej aktywności owadobójczej wobec konkretnego gatunku owada wynikającej z synergistycznego oddziaływania komponentów tych mieszanin.

TEMAT
Identyfikacja i charakterystyka genów taksonomicznie-specificznych u bakterii z rodzaju Bacillus.

CEL PRACY

Celem pracy jest identyfikacja genów występujących wyłącznie w obrębie bakterii z rodzaju Bacillus. Badania prowadzone bedą zarówno na poziomie pojedynczych szczepów, jak i gatunków. Utworzone w tej pracy narzędzia komputerowe pozwolą na badanie właściwości tych genów (np. funkcji molekularnej) oraz poznanie ścieżek ewolucyjnych, które doprowadziły do ich powstania.

TEMAT
Metoda rankingowa identyfikacji sekwencji ortologicznych

CEL PRACY
Celem pracy jest zaprojektowanie i zaimplementowanie nowej metody komputerowej służącej do identyfikacji sekwencji ortologicznych. Metoda stosuje technologie informacyjne używane w interpretacji wyników wyszukiwarek internetowych (np. Google, Yahoo) i zostanie przetestowana zgodnie z obowiązującymi standardami (The Quest for Orthologs).

TEMAT
Ochrona ex situ chomika europejskiego Cricetus cricetus w Polsce

CEL PRACY
Opracowanie programu hodowli chomika europejskiego z linii filogeograficznej Pannonia. Kontrola rozrodu osobników w warunkach ogrodu zoologicznego na potrzeby suplementacji zagrożonych populacji tego silnie zagrożonego gatunku. Opis procedur hodowli i rozrodu.

TEMAT
Generation of reporter system for assessing the impact of chromosomal insertions on meiotic recombination frequency

CEL PRACY
In large eukaryotic genomes including human expansion of transposable elements and genomic integration of viruses can change the local pattern of crossover (CO). We will test how insertions of 3kb-long DNA fragments affect CO distribution at short chromosomal distances.

TEMAT
Modification of crossover frequency by modulation of MutL homologs expression levels in Arabidopsis meiosis

CEL PRACY
Celem pracy jest zbadanie wpływu nadekspresji genu PMS1, a także genów MLH1 i MLH3 na częstość rekombinacji w mejozie. Magistrantka sklonuje gen PMS1 i stransformuje nim rośliny A. thaliana zawierające system reporterowy umożliwiający pomiar częstości crossing-over. Uzyskane linie transgeniczne zostaną dodatkowo wykorzystane do utworzenia krzyżówek z liniami z nadekspresją genów MLH1 i MLH3 w celu zbadania interakcji genetycznych w kontekście mejozy. Ponadto, w trakcie projektu zostanie uzyskana krzyżówka linii mutanta pms1 z wybranymi liniami reporterowymi i wykonane pomiary częstości rekombinacji w kolejnym pokoleniu. Projekt ma za zadanie odpowiedzieć na pytanie, które z homologów MutL mają znaczenie w rekombinacji mejotycznej i mogą zostać zastosowane w nowoczesnej hodowli roślin.

TEMAT
Badanie wpływu mutacji w genie MSH2 na częstość rekombinacji mejotycznej dla wybranych linii Arabidopsis thaliana

CEL PRACY
Celem pracy jest uzyskanie mutacji typu null w genie MSH2 poprzez krzyżowanie wybranych linii A. thaliana. Uzyskane w ten sposób materiały posłużą do zbadania wpływu MSH2 na częstość rekombinacji w mejozie, ze szczególnym uwzględnieniem wzoru heterozygotyczności genetycznej. Pomiary częstości rekombinacji będą prowadzone przy użyciu systemu fluorescencyjnych nasion - metodą mikroskopową, a także fluorescencyjnego pyłku - metodą FACS. Prace przyczynią się do poznania możliwości wykorzystania genu MSH2 do modyfikacji częstości crossing-over w roślinach uprawnych.

TEMAT
Uniwersalne narzędzie do interaktywnej wizualizacji tabelarycznych danych biologicznych

CEL PRACY
Celem pracy jest opracowanie narzędzia bioinformatycznego umożliwiającego wizualizację i interaktywną analizę wyników zapisanych w formacie tabularycznych plików tekstowych. Pliki takie będą przekształcane na dynamiczny dokument HTML zawierający tabelę, która w przejrzysty sposób będzie prezentować dane zawarte w pliku wejściowym. Tabela będzie zapewniała możliwość łatwego sortowania i zaawansowanego filtrowania zawartości oraz dynamicznego grupowania danych na podstawie nagłówków kolumn. Dane zawarte w poszczególne kolumnach będą w prosty sposób wizualizowane w postaci wykresów. Narzędzie to będzie działało z każdym plikiem tekstowym zawierającym dane tabelaryczne.

TEMAT
Interfejs internetowy dla aplikacji rnaSMART służącej do identyfikacji motywów strukturalnych RNA

CEL PRACY
Celem pracy będzie opracowanie interfejsu internetowego do opracowanej w Zakładzie aplikacji rnaSMART. Opracowany interfejs będzie umożliwiał korzystanie z aplikacji rnaSMART on-line oraz umożliwiał będzie interaktywną analizę wyników.

TEMAT
Secondary structure dynamics of 5`UTR regions in bacterial mRNAs in context of gene expression regulation by riboswitches

CEL PRACY
Celem pracy jest scharakteryzowanie dynamiki strukturalnej bakteryjnych rejonów 5`UTR w celu . W szczególności nacisk położony zostanie na analizę rejonów zawierających struktury regulatorowe typu cis, takie jak ryboprzełączniki czy uORF. Analiza odbywała się będzie z zastosowaniem narzędzi obliczeniowych zaprojektowanych do badania przestrzeni konformacyjnej RNA, takich jak barriers, treekin czy KinWalker.

2019-02-01, 16:22:58
RADA: opiniowanie tematów prac dyplomowych: Na kierunku Biotechnology temat i cel pracy muszą być przedstawione w języku angielskim. Ponadto, proszę doprecyzować temat i cel pracy zgodnie z profilem studiów:Biotechnologia o profilu ogólnoakademickim jest kierunkiem umiejscowionym w obszarze kształcenia w zakresie nauk przyrodniczych. Zgodnie z definicją, biotechnologią określa się interdyscyplinarną dziedzinę nauki i techniki zajmującą się zmianą materii żywej i nieożywionej poprzez wykorzystanie organizmów żywych, ich części, bądź pochodzących od nich produktów, a także modeli procesów biologicznych w celu tworzenia wiedzy, dóbr i usług. Tak więc zagadnieniami, które decydują o odrębności kierunku kształcenia są zjawiska i procesy występujące na wszystkich poziomach organizacji Życia, które mogą okazać się przydatne, bezpośrednio lub po przekształceniu, w zastosowaniach praktycznych.
Pozdrawiam Agnieszka Ludwików

TEMAT
Zastosowanie metod 3D w biologii człowieka i naukach pokrewnych

CEL PRACY
Celem realizowanej pracy jest przedstawienie możliwości zastosowania metod obrazowania trójwymiarowego w biologii i naukach pokrewnych (np. medycyna, stomatologia, antropologia sądowa). Praca będzie składała się z dwóch część: 1) teoretycznej - przedstawiającej metody obrazowania 3D oraz możliwości ich zastosowania w biologii i naukach pokrewnych, 2) praktycznej - polegającej na zeskanowaniu czaszki ludzkiej ze średniowiecznego stanowiska Cedynia oraz przygotowaniu jej modelu 3D, a także przedstawieniu możliwości wykonania bardziej zaawansowanych niż tradycyjne pomiarów antropologicznych w przestrzeni trójwymiarowej.